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ARN traduction protéique

Les ARNm qui ont une durée de vie courte ont une région riche en A et en U dans la région 3'. Des protéines spécifiques peuvent s'y fixer pour réguler la vitesse de dégradation de l'ARNm. Cette vitesse de dégradation changera donc pour chaque l'ARNm différent selon l'importance de ses régions riches en A,U et la présence de protéines régulatrices.  [...] La séquence riche en A et en U (ARE) se trouve dans une région non traduite en 3'. C'est à partir de cette région que la dégradation des ARNm va commencer. Les protéines qui agissent sur ces séquences régulant la durée de vie de l'ARNm contrôlent la quantité de protéines traduites.  [...]

[Biochimie] si RNA

Dans ce cas il ne faut que quelques heures pour que le siRNA pénètre dans la cellule. La transfection ne dure que 4-6 heures. En revanche, pour observer une extinction de la protéine ciblée, il faut attendre plus longtemps. Une fois le siRNA à l'intérieur de la cellule, celui-ci va activer le complexe RISC chargé de dégrader spécifiquement les ARNm porteur de la séquence ciblée par le siRNA.  [...] Le processus de dégradation des ARNm prend un certain temps, mais ce qui va déterminer réellement le temps au bout duquel l'extinction de la protéine sera la plus forte, c'est la demi-vie de la protéine. En effet, les protéines traduites juste avant la dégradation de l'ARNm ont une durée de vie plus ou moins longue qui déterminera le moment où l'on verra une bonne diminution de leur quantité.  [...]

Un prob a resoudre

Bien sur, la nature n'est pas fantasque, si la partie exonique (=celle de l'ARNm qui sort du noyau) qui donne effectivement la protéine se limite aux trois premiers AA, le reste des bases pourra être délété sans que ça constitue un handicap pour le mutant qui en résulte.  [...] Chez les eucaryotes, ces ARNm sont degrades rapidement dans le noyau. Chez les procaryotes il y a un tag ajoute aux proteines en cours de synthese provenant d'un tel ARN qui provoque leur degradation.  [...]

[Biologie Moléculaire] Le ribosome: une fonction unique ou des fonctions multiples?

Cette elimination ce fait par un processus appelé épissage, et fait intervenit de nombreuses proteines. Il permet donc de passer d'un ARN pré-messagé, à un ARNm mature capable d'etre lu par le ribosome.  [...] ce controle qualite est effectué par le ribosome qui effectue un premier cycle de traduction tres particulier. Ce cycle va avoir pour role d'éliminer les proteines impliquées dans l'epissage qui sont restées accrochées a l'ARNm, si durant ce cycle le ribosome rencontre un codon stop précoce, alors il y a activation de la degradation de l'ARNm par la voie appelée NMD.  [...]

[Biologie Moléculaire] Les différents types d'ARN

.. Mais chez les mammifères les ARNs longs double brins sont reconnus comme viraux déclenchent une réponse de type interféron. Donc quand on transfècte des siRNAs en labo, on ls transfecte directement sous forme de petits ARNs. De plus, les siRNAs présentent une séquence parfaitement complémentaire à l'ARNm cible et entrainent le clivage et la dégradation de l'ARNm.  [...] Le micro-ARN va aussi présenter des mésappariements avec la séquence de l'ARNm cible, en en général il a été montré une inhibition de la traduction plutôt qu une dégradation de l'ARNm. Les micro-ARNs sonstituent une forme de régulation supplémentaire de l'expression des protéines.  [...]

[Biologie Cellulaire] Dégradation des ARNm par la voie du NMD

En fait, je voulais savoir si cette dégradation été due à la persistance, après le passage de la petite sous unité du ribosome, de quelques protéines EJC à une jonction exon/exon.  [...] En fait, il va y avoir dégradation de l'ARNm si le ribosome (pourquoi tu ne parles que de la petite sous-unité ) ne parvient pas à enlever tous les EJC (mon prof appelait ça les protéines de marque, je sais pas si tu as eu ce nom aussi en cours) qui sont aux jonctions otenues après épissage.  [...]

[Biochimie] ENZYMES question

La régénération protéique est donc plutôt marginale. D'autre part, en excluant la dégradation par les protéases, la renaturation spontanée d'une protéine n'est pas triviale. De nombreuses protéines nécessitent un repliement assisté par des chaperones qui conditionnent une conformation particulière en consommant de l'énergie, pour que la protéine soit fonctionnelle.  [...] Pour la plupart des gènes exprimés, on assiste à une synthèse permanente d'ARNm suivie de la synthèse de la protéine, puis de sa dégradation plus ou moins rapide selon sa demi-vie. Ainsi il y a un remplacement permanent d'une protéine. Donc je dirais que lorsqu'une protéine est dégradée accidentellement (par la chaleur puisque tu y tiens beaucoup ), il faut attendre le temps que l'ARNm (s'il a tenu le choc) soit traduit en cette protéine, ce qui peut être très variable suivant les protéines considérées.  [...]

[Biologie Moléculaire] dégradation des ARNm

J'ai une petite question a poser au sujet de la dégradation des ARNm (on est chez les eucaryotes), en effet, j'ai écrit dans mon cours que la baisse de la dégradation des ARNm peut se faire par.  [...] Tu as tout à fait raison, c'est l'augmentation de la dégradation des ARNm. PLus exactement, la queue polyA permet la fixation de protéines, les polyA-BP, qui vont empêcher les exonucléases de dégrader l'extrémité 3'. Mais ces protéines ont une affinité pour la queue polyA donc elles se fixent puis au bou d'un certain temps se libère et ainsi de suite.  [...]

[Biologie Cellulaire] Stabilité de l'ARNm

en fait dans mes problèmes on me demande souvent si la transcription de l'ARNm est devenue plus stable ou non après modification de certains paramètres.  [...] Enfin, la stabilité de ton ARNm produit dépend de son taux de production et de dégradation (c'est la même chose pour une protéine ou un ADN d'où la transition stable où il y a moins de dégradation de ton ADN). Plus un ARNm sera synthétisé dans de bonne condition, plus il sera stable, cad moins il sera dégradé.  [...]

[Biologie Moléculaire] ARN interference

L'ARNi est un acide nucléique qui peut être simple ou double brin et qui va aller interférer (de là son nom) avec un ARNm donné. Pour cela l'ARNi se fixe spécifiquement à l'ARNm et conduit à sa dégradation et de fait on assiste à une diminution de la traduction de l'ARNm en protéine.  [...] Enfin, les ARN @sens sont seulement produits et n'ont vraiment qu'un rôle chez les bactérie, où il n'y a pas de RNAi homologue de celui des eucaryote (il existe cependant le système CRISPR mais c'est une autre histoire... voire pubmed). On a en effet caractérisé des ARN @sens jouant un rôle dans la régulation de la traduction (copT.   [...]