• Forum - Protéines, Compartiment, Extra

[Biologie Moléculaire] Peptide signal

Je souhaite cloner dans pGEMTeasy puis dans pET21 un gène qui renferme 7 exons le premier exon code pour le peptide signal, j'ai commander deux types d'amorces sens le premier s'hybride avec l'exon 1 (peptide signal) et le deuxième avec l'exon 2. j'ai commencer mes PCR avec le second type mais je ne sais pas exactement quels sont les conséquences et et ce que ça va influencer sur la conformation protéique ou l'activité biologique.  [...] Oui le peptide signal permet l'adressage de la protéine vers un compartiment cellulaire bien défini mais le fait qu'elle ne soit pas orienter vers un tel compartiment elle peut perdre dans un autre sa conformation ou son activité biologique bon c'est ce que je pense.  [...]

[Physiologie] Physiologie rénale

Comme il y a hyperhydratation extra-cellulaire, à apports constants de sodium, il va y avoir une baisse de la natrémie dans tout le compartiment extra-cellulaire. la molarité est inversement proportionelle au volume de solvant. La membrane capillaire laisse passer librement le sodium dans les compartiments intra et extra vasculaires, donc la natrémie est homogène dans tout le compartiment extra-cellulaire.  [...] L'objectif de tous ces mécanismes est de maintenir une pression osmotique efficace constante de part et d'autre de la membrane cellulaire, de l'orde de 280 mOsm/kg. Seulement, la tonicité est essentiellement due au sodium dans le compartiment extra-cellulaire, alors que dans la cellule, ce seront essentiellement les protéines qui seront en cause (équilibre de Donnan etc...).  [...]

[Biologie Cellulaire] Protocole expérimental

Ben je ne vois pas trop ce qui vous pose problème dans le processus expérimental que vous décrivez. La première chose est de faire une simple lyse cellulaire afin de libérer les protéines cytoplasmiques. Vous centrifugez, récupérez le surnageant et vous avez votre extrait cytoplasmique.  [...] Vous avez donc trois extraits qui constituent chacun un compartiment de distribution des protéines. Votre question est, dans quel compartiment se trouve ma protéine d'intérêt Pour cela vous faites un western.  [...]

peptide signal et ribosomes libres

Bonjour, je suis en train de batailler pour savoir si lorsqu'une protéine est synthétisée par des ribosomes libres dans le cytoplasme, elle possède un peptide signal (d'adressage, pour un quelconque compartiment intracellulaire), tout comme celles synthétisées dreg ont un peptides d'adressage extra-cellulaire..quelqu'un a-t-il la réponse.  [...] C'est le même processus, en effet pour les protéines à destination des plastes et des péroxysomes. Ce sont des compartiments clos, c'est à dire qu'il n'y a pas de transit de protéines entre ces organites et le REG par exemple et pas non plus avec la membrane plasmique.  [...]

[Physiologie] Une perméabilité ionique négative ?

Dans ton cas, plaçons nous dans des conditions où tous les sels sont dans le compartiment extra. Les termes en intra disparaissent de l'équation et on obtient une perméabilité négative pour un flux d'ion entrant. A l'inverse, si tous les sels sont dans le compartiment intra, le terme en extra disparait, et les termes de perméabilités ioniques sont positifs pour un flux d'ion sortant.  [...] Sauf que les termes entrant et sortant n'ont pas d'existence propre, les compartiments intra et extra résultent d'une convention. Dans une cuve séparée par une membrane, pas de compartiment intra ou extra a priori, et pourtant, on pourra y appliquer cette formule de la même façon, en choisissant un compartiment dit intra et un compartiment dit extra. On aurait pu les appeler A et B.  [...]

[Physiologie] Déshydratation extra cellulaire et intra cellulaire ? (incompréhension)

Déshydratation intra cellulaire -. on a une augmentation de sels minéraux, macromolécules dans les compartiments extra cellulaire c'est à.  [...] La déshydratation extracellulaire c'est le contraire, en cas de taux trop élevé de sodium intracellulaire par exemple l'eau du compartiment extra peut aller vers l'intérieur des cellules. Et comme le compartiment extra n'a rien demandé on va vite se retrouver avec des taux inférieurs à la normale pour différents ions.  [...]

[Biochimie] Isolement des protéines du périplasme de Bactéries + Test d'activité spé d'une protéine en SDS-PAGE

Pour isoler le périplasme et prouver que cette protéine est dedans ils utilisent deux techniques qu'ils disent complémentaires.  [...] Ce que je comprend pas c'est le lien entre activité spécifique et électrophorèse. L'électrophorèse en sds-page permet de séparer les protéines selon leur taille et donc d'identifier des protéines dans des extrait donnés, mais quel rapport avec l'activité spécifique de la protéine serait-ce simplement le fait que comme ils on des préparation périplasmique pure de contamination et qu'il test la présence de la protéine SodA dans ce compartiment qu'ils appellent ça activité spécifique du périplasme.  [...]

intra cellulaire??

un compartiment extracellulaire ne fait pas partie de la cellule. il n'y en a pas. En fait je dois dire que ta question n'a pas beaucoup de sens.  [...] Sa limite est la membrane plasmique, sa face externe si on veut chipoter un peu, et elle n'est pas un compartiment extra cellulaire...c'est la limite externe de la cellule.  [...]

Ddp transmembranaire

Le plus important c'est de ne pas oublier les grosses protéines chargées négativement (ou autres gros anions) dans le compartiment intracellulaire, qui ne franchissent donc pas la bicouche lipoprotéique malgré un gradient de concentration énorme entre les milieux intra et extracellulaires, ce qui maintient le potentiel membranaire négatif à l'intérieur de la cellule.  [...] L'électroneutralité des deux compartiments est violée à proximité de la membrane. Toutefois, compte tenu de la géométrie du système, il ne faut qu'un surplus d'environ 2 ions sur 100 000 pour rendre compte du potentiel de membrane. L'électroneutralité est bien respectée macroscopiquement.  [...]

[Biologie Cellulaire] virus

Les protéines de la capside peuvent être très différentes d'un virus à l'autre dans la forme et dans le mode d'assemblage. Le principe général est que ces protéines s'auto-assemblent entre elles pour former un compartiment clos et contenant le matériel génétique.  [...] Ces protéines sont très différentes des protéines membranaires puisque ce sont elles seules qui ont le rôle de former le compartiment chez les virus. Elles ne sont pas intégrées dans une bicouche lipidique.  [...]