• Forum - Protéines, Acides aminés, Activite enzymatique

La Momification

Je pense que ce que vous recherchez comme concept c'est celui de la température et du pH optimaux de fonctionnement d'une enzyme. Les enzymes sont des protéines à activité catalytique, et l'évolution a fait qu'elles fonctionnaient mieux dans la plage de température et au pH qui sont les caractéristiques physiologiques des êtres vivants les possédant (pour l'humain, la température physiologique est 37 et le pH autour de 7,4 (cela dépend des compartiments, certes)).  [...] En effet, une modification du pH, par simple réaction acido basique avec les acides aminés des protéines, va modifier leur charge, donc leur conformation et leur activité catalytique. plus ou pas d'activité enzymatique.  [...]

[Biologie Moléculaire] La molécule mystère - Page 8

c'est vrai qu'il y a plusieurs types de DNA polymérase qui permettent la réplication de l'ADN mais ont également un role dans la réparation. Elles ont donc deux activités enzymatiques (ce qui pourrait correspondre à l'énoncé de Malicia. Mais je suis d'accord sur le fait qu'il faudrait préciser la DNA polymerase en question.  [...] Je reconnais que l'HMGCoA réductase est très proche de la définition que j'ai donné, mais c'est pas ça (c'est pas loin). Quand je parle de deux protéines, je ne pensais pas à des conformations différentes (activée ou non par un ligand ou par modifications posttraductionelles) mais à de protéines proches mais pas identiques au niveau acides aminés mais possédant la meme activité enzymatique.  [...]

caspase

Est-ce que les caspases ont des fragments clivés dont le poids moléculaire est égal à la moitié de celui de la procaspase.   [...] Les caspases s'autoclivent et clivent les autres protéines après les acides aminés aspartate. d'où leur nom C= clivent, Asp= aspartate, ase= activité enzymatique. Donc tout dépend de là où se trouve ledit acide aminé. Il y a donc très peu de chances que les PM des produits de procaspases soit la moitié du PM du réactif.  [...]

Carbamylation de protéines

La carbamylation correspond à la fixation non enzymatique d'acide isocyanique, (...) sur les groupements aminés des protéines, et participe à leur vieillissement moléculaire. (Gillery et al. 2015, nephrologie et thérapeuthique).  [...] c'est donc une réaction non voulue, qui reflète donc le vieillissement des protéines. Cela provoque un changement de conformation qui peut provoquer une perte de fonction.  [...]

[Divers] Peptides bioactifs !

Les peptides bioactifs sont des séquences définies d'acides aminés qui sont inactives au sein de leur protéine d'origine, mais qui présentent des propriétés particulières une fois libérées par action enzymatique. On les appelle aussi peptides fonctionnels.  [...] Ces peptides bioactifs sont capables d'exercer, entre autres, un effet sur le système digestif, les défenses de l'organisme (par exemple, un effet antimicrobien ou immunomodulateur), le système cardiovasculaire (notamment un effet antithrombotique ou antihypertenseur), et/ou le système nerveux (tel qu'un effet sédatif et analgésique de type opioïde).   [...]

[Biochimie] Conséquence de changement d'acide aminé.

Comme l'a bien dit Hellbly, avec ce type de changement d'acide aminé, les liaisons (faibles ou covalentes) entre ces acides et donc la conformation dans l'espace de la molécule peuvent changer, avec une activité (enzymatique par exemple) fort différente.  [...] Le repliement des protéines ne se fait pas de manière volontaire (il n'y a pas un organite qui décide comment replier la protéine). Le repliement se fait en fonction des acides aminés et de leur caractéristiques et se fait petit à petit. Un premier repliement va permettre un second replient (en rapprochant des acides aminés éloignés) et ainsi de suite comme le montre cette image.  [...]

Question : Identifier une protéine dans un anabolisme

En fait, de nos jours, on aurait probablement déja identifié la protéine (du moins virtuellement) et le gène correspondant. En effet, maintenant que les organismes sont entièrement séquencés, on connait théoriquement toutes les protéines potentielles et on a une idée de leur fonction (par analogie de structure, analogie de séquence).  [...] Une approche différente est d'étudier l'activité enzymatique de fraction protéiques, par exemple. On sépare un pool de protéines selon leur caractéristiques biochimiques (charge, taille, etC...) et on regarde dans quelle fraction on retrouve l'activité enzymatique recherchée.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 11

Les électrons solvatés sont impliqués dans les processus chimiques principaux et dans les processus biologiques. La conversion de CO 2 aqueux et de CO en substances organiques simples, la génération d'ammoniac à partir de N2 et d'eau, la formation d'amines, d'acides aminés et de protéines simples sous l'action d'e aq  a été prouvée expérimentalement.  [...] C'est déjà pas si mal et ça me plaît à plus d'un titre. Notamment le fait que, dans l'hypothèse de Michael Russell, on a pas besoin de tous les acides aminés au début. Les acides aminés plus complexes peuvent être synthétisés une fois qu'un équipement proto-enzymatique suffisamment évolué a vu le jour pour permettre ces synthèses.  [...]

[Biochimie] Plusieurs questions sur les chromatographies échangeuses d'ions et d'affinité

En cours,nous avons vu que suite à une chromatographie échangeuse d'ions(par exemple échangeuse d'anions),afin de séparer les protéines chargées négativement qui se sont liées aux résines chargées positivement,nous pouvions soit,faire varier le pH de la solution d'élution jusque obtenir le point isoéléctrique des protéines et ainsi les séparer des billes,ou bien utiliser un gradient de force ionique qui trierait en fonction de la charge.  [...] Lors d'une question. les protéines B sont plus petites que l'enzyme on a répondu vrai car les protéines B se situent APRES l'activité enzymatique.  [...]

ADN

Dans une récente interview, Steve Miller (celui de la réaction de synthèse d'acide aminés dans des conditions terriennes prébiotiques.) a émis l'opinion que les premiers acides nucléiques (pas acide... cf suite) du vivant étaient des acides amino-nucléiques.  [...] Bon, on connait aussi des ADN catalytiques (dnazyme ou déoxyribozyme), avec une large palette d'activité. Pour l'instant, c'est in vitro. Mais rien ne dit que l'on en trouvera pas in vivo. Les ribozymes ne sont donc plus forcément un très bon argument pour le monde ARN.  [...]