• Forum - Protéine, Séquences, ADN

[Biologie Moléculaire] Comment ce fait-il qu'on ait des séquences codantes et non codantes ?

Je comprends pas un truc. L'ADN est un polymère d'acide nucléique comment ce fait-il qu'ont est des séquences codants pour des protéine (exons) et d'autres séquences non codantes (introns) qu'on a longtemps qualifié d'ADN poubelle avant de trouvé qu'ils avaient une action régulatrice sur les gènes.  [...] Mais la chose qui m'interpèle vraiment c'est comment ce fait il qu'il y est une différence alors que c'est simplement un enchainement de nucléotide comment ce fait-il que certain nucléotides code et que d'autres non c'est lié au modification post-traductionelle c'est à dire méthylation etc.   [...]

[Biologie Cellulaire] Fixation d'une protéine à l'ADN

Je dois montrer comment une protéine qui se lie à l'ADN va réaliser des contacts spécifiques de séquences avec une molécule de l'ADN à double brin sans rompre les liaisons H.  [...] Petite question supplémentaire. pourquoi pour certains facteurs il y a necessité d'avoir un site palindromique sur l'ADN J'ai lu sur le sujet, j'ai cru comprendre qu'il y avait torsion de l'ADN quand un dimère se fixe... en quoi cela régule la transcription.  [...]

Promoteur

Bof bof, c'est sur les deux brins. Un facteur de transcription reconnait une conformation de séquence d'ADN double brin, qu'on la mette dans un sens ou dans l'autre, la conformation reste la même... (voir les enhancers par exemple).  [...] Pareil que LXR, quand on parle de séquences régulatrices, c'est-à-dire que leur fonction implique des intéractions protéine-ADN, il faut considérer que la structure importante est l'ADN double-brin.  [...]

Transgene / Protéine Recombinante

Généralement ce qu'on fait c'est qu'on séquence le génome et on repère des séquences d'intérêt (c'est-à-dire des séquences pouvant potentiellement coder des protéines). Ensuite à partir de ça on peut éventuellement prédire la fonction de la protéine qui sera produite (sur la base de comparaisons avec d'autres séquences ADN proches et de la structure tertiaire).  [...] Partir de la protéine pour remonter au gène est possible si on arrive à isoler une protéine dans un sécrétome par exemple. Des méthodes pour séquencer les protéines existent. Remonter à la séquence d'ADN devra être fait en tenant compte de l'épissage, épissages alternatifs, éventuelles modifications post-traductionnelles effectuées après la traduction etc.  [...]

Hybridation ADN-ARN

1- Identifier sur la molécule d'ADN les séquences codantes impliquées dans la synthèse de la protéine ovalbumine.  [...] Peux-tu faire preuve d'un peu plus de patience lorsque tu postes une discussion (cf message #2) Même si la dynamique du forum est bonne, les membres ne répondent pas aussi vite que sur un chat, cela reste un forum. Attends plus longtemps avant de relancer ton sujet.   [...]

[Génétique] Génome Bactérien

Quels sont les gènes remarquables dans le génome bactérien.   [...] Tous dépend de ce que tu veux dire par remarquables, si tu veux dire par là les gènes communs à toutes les bactéries, je dirai. la séquence ori, la séquence ter, les séquences d'ADN qui code pour la protéine DnaA (protéine initiatrice de la réplication), toutes les enzymes impliquées dans la réplication, la transcription et la traduction de l'ADN.  [...]

[Biochimie] Empreinte à la DNase+ TAMOXIFENE

Si on place une protéine dans le milieu avant digestion et que celle-ci se fixe sur une séquence d'ADN, on observera disparition de certaines bandes. comme l'ADN n'est marqué qu'aux extrémités, on peut savoir grossièrement où la protéine s'est fixée.  [...] Sans tamoxifène, la protéine de fusion cre-dllER est séquestrée dans le cytoplasme par des chaperonnes (HSP70). Lorsque l'on ajoute le tamoxifène, le DLL change de conformation, libère les chaperonnes et la protéine de fusion peut entrer dans le noyau et exciser la portion d'ADN comprise entre les séquences LoxP.  [...]

[Divers] Fac de Sciences, les débouchés.

Concernant la génétique et la bio mol, si tu aimes l'informatique, un master en bio-informatique pour être bio-informatien pour le traitement des bases de données des séquences d'ADN ou protéine pourra te convernir aussi.  [...] Une autre remarque. les facs de bio (en tous cas la mienne, qui est la même que celle dont VilCrocrotte t'indiquait les masters) ne sont pas organisées comme les facs de lettres ou de sciences humaines, et n'espère pas avoir 15h de cours par semaine, ça tourne plutôt autour de 30-32 et il y a effectivement un volume de connaissances à ingurgiter important.   [...]

génétique inverse

En génétique classique, on part d'une protéine connue, depuis laquelle on synthétise des sondes ADN dégénérées (c'est-à-dire incluant toutes les séquences d'ADN pouvant coder pour une même partie de la protéine) et on retrouve ainsi le gène originel par hybridation.  [...] Chez la mouche, tu peux trouver une lignée qui a un transposon dans ton gène ou dans les séquences amont, ou ailleurs (il y a un consorium pour ça, c'est gratuit) Donc tu peux déjà avoir un allèle de ton gène. Si, t'as pas de phénotypes tu le refais sauter soit dans un dans les séquences régulatrices, dans les introns et qq fois dans le codant ou, alors, tu génères une délétion qui arrache une partie du gène.  [...]

[Biologie Cellulaire] SAR / MAR , précision please :(

Les SAR, ou MAR (région d'attachement au scaffold/ à la matrice) sont des protéines fixées à la matrice du noyau (l'ensemble des structures fibreuses qui l'organisent). Elles possèdent un fragment complémentaire à une partie de l'adn, ce qui fait que la chromatine, déjà autour des nucléosome, vient se fixer sur elle en formant une boucle sur chaque SAR. Ca confère à l'adn une forme d'hélice (.  [...] existence de sites d'attachement de la chromatine appelés SAR (Scaffold Attachment Region) ou MAR (Matrix AR). Sequences riches en A/T qui confère une rigidité de l'ADN, ce qui favorise l'attachement sur la protéine. Généralement les SAR séparent deux gènes.  [...]