• Forum - Protéine, Séquence, ADN

[Biotechnologie] Global Analysis of Protein Activities using proteome chips

En gros, la séquence d'ADN codant pour la protéine d'intérêt est fusionnée à une séquence signal (GST), puis des levures sont transfectées par le plasmide. Donc production de la protéine correctement modifiée et conformée (la protéine d'origine provient de la levure).  [...] Si tu as une protéine complètement inconnu, et pas son ADN, il faudra séquencer les acides aminés de la protéine un à un (en tout cas, le début de la protéine), avant de pouvoir trouver la séquence ADN.  [...]

ADN, proteines et mutations

Ces mutation peuvent entrainer l'apparition de codon stop dans une sequence d'ADN ayant pour conséquence d'arreter la transcription, et donc ecourtant la proteine. Si elle n'a fais pas apparaitre de codon stop et qu'elle augmente la taille de la proteine, se peut il que cette mutation qui a la base ne touchais qu'un proteine puisse toucher plusieurs autres sequences codant des proteines.  [...] Dans le meme etat d'esprit, une molecule écourtée par une de ces mutations va crée une sequence d'ADN qui ne codera pas de proteine, jusqu'au premier codon initiateur. Dans le cas où il s'agit du codon pour la proteine suivante normale cela ne pose pas de probleme.  [...]

Gel Shift : problème avec la compétition

Ca ressemble a une fixation non specifique de ta proteine sur l'ADN. As tu fais un temoin de binding de ta proteine sur une sequence d'ADN non specifique (different de la competition).  [...] Ca arrive souvent qd tes conditions ne sont pas optimales et/ou que l'affinite de ta proteine pour l'ADN est tres important. Tu peux essayer de mofier la composition du tampon de shift. Es tu sure que ta proteine se fixe sur cette sequence d'ADN Comment l'as tu identifiee.  [...]

ADN traduit - Page 2

Donc, tu prends un ADN DS (Double brin), tu va donc avoir un brin codant et un brin matrice. Le brin codant est sens, c'est à dire même séquence que son ARN. Le brin matrice est anti-sens, c'est à dire séquence complémentaire de l'ARN. Donc, quand ton ARN polymérase veut transcrire, elle va se fixer sur le brin matrice, qui porte bien son nom, car la polymérisation se faisant par complémentarité, tu obtiendra un brin d'ARN néo-synthétisé de même séquence que le brin codant, donc un bon ARN puisque c'est la séquence correspondant à la future protéine.  [...] Par contre, imaginons que la polymérase délire et qu'elle prenne pour ADN matrice le brin codant, alors la séquence de l'ARN obtenu serait celle du brin matrice, pas du tout la bonne. La séquence ne correspondrait pas du tout à la protéine censée être traduite.  [...]

[Biologie Moléculaire] Protéine d'initiation

Lors de la réplication on parle de la présence d'une protéine d'initiation de la réplication qui reconnait l'origine de réplication. Chez le Procaryote il s'agit du dnaA mais existe t'il la même chose chez les Eucaryotes D'ailleurs il y a également quelques choses qui reste flou, l'origine de réplication provient d'où Puis ce que cette protéine d'initiation recrute l'ADN Hélicase et l'ADN Primase or c'est l'ADN Primase qui synthétise l'amorce (origine de réplication) qui sera reconnu par l'ADN Polymérase.  [...] emmm.. l'origine de réplication est une séquence d'ADN riche en base AT donc elle est facile à ouvrir.. et la protéine d'initiation reconnait cette séquence grâce au ces bases.. puis l'ADN hélicase se fixe sur l'origine de réplication et l'ADN Primase et Polymérase.  [...]

[Biologie Cellulaire] Lien entre mutation génétique et transformation phénotypique

L'ADN porte l'information génétique qui est codée sous forme de gène. Un gène est une séquence d'acide nucléique qui code pour une ou plusieurs protéine.  [...] On voit bien dans la séquence que si l'on modifie l'ADN qui forme le gène alors on modifie la protéine codée et donc en retour le phénotype. Je modifie l'ADN qui forme le gène qui code pour la protéine qui donne aux yeux leur couleur, du coup je modifie la protéine, du coup je modifie la couleur des yeux.  [...]

[Génétique] Génome Bactérien

Quels sont les gènes remarquables dans le génome bactérien.   [...] Tous dépend de ce que tu veux dire par remarquables, si tu veux dire par là les gènes communs à toutes les bactéries, je dirai. la séquence ori, la séquence ter, les séquences d'ADN qui code pour la protéine DnaA (protéine initiatrice de la réplication), toutes les enzymes impliquées dans la réplication, la transcription et la traduction de l'ADN.  [...]

[Biologie Cellulaire] technique de retard sur gel et immunoprécipitation de chromatine

Le retard sur gel permet de déterminer si le fragment d'ADN intéragit avec une protéine ou un complexe protéique (d'ou un retard de migration si tel est le cas). Mais ne donne aucune info sur l'identité de la protéine et de la séquence (même si pour la sequence il y a moyen de bricoler pour en savoir plus).  [...] Le ChiP permet de déterminer la séquence d'ADN avec laquelle une protéine ou complexe protéique connu intéragit. C'est de l'IP sauf que là avec l'anticorps on fait tomber une protéine (d'ou la nécessité de connaitre son identité) qui intéragit avec, entre autre, des bouts de chromatine (préalablement digéré).  [...]

exons_épissage alternatif

Je n'ai jamais vu l'ordre des exons changés. Certains exons peuvent être supprimés mais l'ordre n'est pas censé changer sinon toute la molécule serait différente et ce ne serait plus du tout la même copie du gène initial pour traduire la protéine voulu.  [...] Mais je trouve ça plutôt logique car une séquence d'ADN représente un ordre bien précis qui pourra être codé en une protéine précise. Donc si il y a transcription d'une séquence, c'est pour coder la protéine qui correspond à cette séquence. Enfin je ne pense pas qu'il y a des changements contrôlés de l'ordre des exons pour créer de nouvelles protéines, je pense juste qu'il y aura transcription d'une autre séquence.  [...]

[Biologie Moléculaire] PCR dégénéré

sur ce principe on peut décider de créer des amorces PCR en partant de la protéine et non de la séquence ADN. on traduit en sens inverse pour passer de la séquence peptidique à la séquence nucléotidique.  [...] mais comme le code génétique permet plusieurs solution on cré des amorces dégénérées. toutes les amorces vont coder pour les mêmes acides aminés mais leurs séquences sont différentes, par un ou plusieurs nt.  [...]