• Forum - Protéine, Molécule, Substrat, ADN

[Biochimie] Desoxycytidine-triphosphate(dCTP) = Enzyme?

Il est écrit que le dCTP donc qui est un nucléoside triphosphate serait un substrat des ADN polymerases,puis il est précisé Les enzymes(ici l'ADN poly) utilisant un nucléoside triphosphate(ici dCTP) comme substrat ou coenzyme.  [...] Non, il n'y a pas d'amalgame possible. Une enzyme est une protéine alors que le dCTP n'est qu'une petite molécule qui est un substrat de l'ADN polymérase.  [...]

[Biochimie] Plusieurs questions sur les chromatographies échangeuses d'ions et d'affinité

Tout d'abord attention à ton vocabulaire. Substrat est un terme réservé à de l'enzymologie pas à de la biochimie analytique. On parle de compétiteur, c'est une molécule qui a de l'affinité pour la phase stationnaire de la colonne d'affinité. On rajoute cette molécule pour éluer la protéine par compétition.  [...] Je te remercie de m'avoir répondu..En fait,j'ai eu TD de biochimie aujourd'hui du coup j'ai posé mes questions,et tu as confirmé les réponses que j'ai reçu...Pour le Nacl en chromatographie d'affinité.comme le substrat(si on veut éluer une protéine enzymatique)ou plus généralement la molécule située sur la résine en phase fixe,se fixe à la protéine à éluer par liaison faible,le NaCl peut perturber ces liaisons en se fixant sur la résine(par compétitivité) et permettant ainsi l'évacuation des protéines à éluer.  [...]

ADN et protéines

2. La mutation de l'ADN se passe sur le codon terminateur (TAA deviendrait CAA par exemple). Les polymérases et ribosomes sont incapables de s'arrêter, la protéine produite a une taille beaucoup trop grande et conduit généralement à la destruction de celle-ci.  [...] 3. La mutation de l'ADN se passe sur un codon d'un acide aminé du site actif de la protéine. Beaucoup de protéines ont une fonction enzymatique qui leur permet de catalyser une réaction chimique. Cette réaction se fait lorsqu'un substrat spécifique entre en contact avec une poche de la protéine appelée site actif.  [...]

[Biologie Moléculaire] La molécule mystère - Page 8

Tu dis l'ADN pol, mais est-ce qu'elle correspond à la description que j'ai donnée de l'enzyme Les ADN pol sont en général d'énormes molécules, 1247 aa est petit comme PM... Mais pense au mot atypique. une ADN pol n'est pas atypique parce qu'elle a des fonctions de réparation en plus.  [...] Pour récapituler. il s'agit d'une protéine monomérique de 1247 aa à deux domaines ayant des fonctions distinctes. Cet enzyme a pour substrat l'ADN et est responsable essentiellement de la régulation de sa topologie ( = fonction topoisomérase). Elle est atypique, en partie parce que rencontrée uniquement chez une partie des Archae.  [...]

[Biologie Moléculaire] La molécule mystère - Page 7

vous avez fait la première partie du chemin. Ca n'est pas Rec8 mais tout le maintient de la cohésion des chromosomes tourne autour de cette molécule. La question est de savoir pourquoi, alors que sont exprimées des séparases les chromosomes restent en cohésion.  [...] Je ne sais pas trop quoi vous donner comme indices sans trop en dire... Cette protéine est un enzyme, ses deux domaines ont une fonction distincte. Cet enzyme a pour substrat l'ADN. Le point important est le mot atypique. autant la fonction que les organismes chez lesquels on la trouve.  [...]

Le virus à la limite du vivant

Je suis pas sûr qu'on puisse appeller ça du métabolisme. sinon, ta machine de PCR a un métabolisme. Pour moi, c'est juste une réaction chimique d'estérification ce que tu décris là. le virus a volé les nucléosides triphosphate de son précédent hôte et est incapable de fabriquer lui-même ces molécules qui ne sont pas des nutriments au sens propre du terme mais des métabolites d'une cellule qu'il a détourné.  [...] Une voie metabolitque est une serie de reactions enzymatiques permettant de passer d'un substrat A a un produit B. Si tu te bases sur ca, alors l'incorporation d'un dNTP sous forme de molecule d'ADN est une reaction metabolique. Biensur elle n'a pas le sens qu'on lui donne communement, quand on pense metabolisme, on pense, metabolisme des sucres, des lipides etc.  [...]

Phénomène de réplication (eucaryotes)

Au début, on a une molécule d'ADN double brin. L'hélicase vient séparer les 2 brins. Il y'a une ADN polymérase sur chaque brin qui suit l'hélicase (va dans le sens 5'.. 3') pour synthétiser leur brin fils respectif. Après, je ne comprends pas pourquoi il y'a un brin continu et un un brin discontinu.  [...] -cependant, la Polymérase alpha n'est pas une enzyme très efficace (on dit qu'elle a une processivité faible, c'est-à-dire que pour une quantité de substrat donné, elle incorpore peu de nucléotides). C'est donc la Polymérase delta qui va prendre le relais, car elle possède une processivité élevée, et va s'occuper de synthétiser le reste de la molécule d'ADN.  [...]

coenzyme A

On étudie les couplages énergétiques et les formes d'énergie intermédiaire qu'ils font intervenir, on a une partie sur la coenzyme A qui est assez brève et je ne parviens pas à comprendre exactement à quoi elle correspond. Du coup j'aimerais savoir en quoi c'est une forme d'énergie intermédiaire et expliquer un peu son fonctionnement.   [...] Bonsoir/Bonjour, Prima2815 la coenzyme A est une coenzyme de type co-substrat c'est à dire qu'elle est lié à la protéine de manière non covalente, elle fait partie des enzymes qui transfert les groupements acyle elle est très important aux niveaux de l'organisme elle est très forte énergetiquement en effet puis ce qu'elle forme une liaison thioester si elle se lie avec une autre molécule comme par exemple l'acétyl CoA.  [...]

Glycolyse et maintien des métabolites

aprés il existe dans certain cas notamment dans le cas des réactions qui se produisent en des lieux précis de la cellule des transporteurs protéiques qui dirige le métabolite ou la protéine vers une zone particulière de la cellule.  [...] peut être veux t'il entendre que parler du problème des concentrations locales de molécule. lorsqu'une enzyme tourne il se crée a proximité une forte concentration locale de son produit. Si tu ajoute à ça le fait de la viscosité du milieu cellulaire et de sa forte concentration en protéine notamment celle de la glycolyse tu peux supposer que ça maintient une concentration locale suffisante pour conserver à proximiter de l'enzyme et de sa suivante les produits et substrat de la glycolyse. sinon je vois pas.  [...]

Vecteur de clonage, PCR et vecteur d'expression

Je ne voulais pas dire que c'etait specifique d'une enzyme mais qu'on pouvait utiliser l'enzyme comme proteine liée au DB et le substrat lié au AD.  [...] Je pense surtout que tu utilises le mauvait vocabulaire. un substrat est une petite molecule qui est modifiée par l'enzyme. dans quelques cas le substrat peut etre une autre proteine, mais on n'utilise pas le double hybride pour etudier cela.  [...]