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besoin d'aide: restitution de connaissance : du phénotype et protéine

- Une protéine est une molécule constituée d'une ou de plusieurs chaînes d'acides aminés. D'une protéine à l'autre, le nombre total d'acides aminés varie.  [...] 1. Pour montrer la relation entre une protéine et le phénotype macroscopique, il est plus facile de prendre un exemple là où il y a un problème. En l'occurence ici, tu peux prendre l'al... (maladie de la pigmentation).  [...]

définition d'une protéine

alors voila, j'ai un problème avec la définition d'une protéine. sur wikipédia, il y'a écrit que une protéine c'est une molécule composée d'une ou plusieurs chaines d'acides aminés, c'est la qu'est le problème. quand il y'a traduction il y'a que une chaine d'acides aminés qui est synthétisé et cette chaine la correspond a la protéine non donc comment une protéine peut être constitué de plusieurs chaines.  [...] Peut-être utile d'indiquer en complément qu'une protéine peut être une seule molécule tout en étant composée de plusieurs chaînes, liées par des liaisons covalentes (typiquement des ponts disulfures ). Un exemple est l' insuline.  [...]

Pectine

Un protide est une molécule composée d'un assemblage complexe d'acides aminés. Elle est dite peptide si elle en contient un nombre peu élevé, et protéine si celui-ci est important.  [...] Pour qu'une molécule soit considérée comme étant une protéine, il faut qu'elle soit constituée d'un enchaînement d'acides aminés. Or la pectine n'est pas un enchaînement d'acides aminés, il va falloir trouver un autre nom pour la caractériser.  [...]

comprendre l'ATP???

Je ne comprend pas de qu'elle forme est cette énergie et comment la cellule peut utiliser l'atp (par exemple pour fabriquer une protéine à partir de plusieurs acides aminés.  [...] Par exemple, pour joindre deux acides aminés, ou pour changer la conformation d'une protéine qui permetra par exemple d'ejecter une molécule d'un compartiment cellulaire.  [...]

a propos d'immuno, et de proteines...

Deuxième question. La structure tertiaire d'une proteine, est elle due à des liaisons covalentes entre des acides aminés souvent normalement éloignés les uns des autres.  [...] ahh d'accord, oui pour moi une liaison covalente correpondrai à un ponts dissulfure. ok maintenant je comprends mieux pourquoi on dit qui sont normalement éloignés les uns des autres c'est parceque la proteine est une molécule linéaire et grâce aux liaisons covalentes les acides aminés sont beaucoup plus proches.  [...]

[Biochimie] origine de la vie

Création spontanée de protéine (peptide) par assemblage d'acides aminés par condensation (perte d'une molécule d'eau) sous l'action de la chaleur (zone hydrotermales).  [...] La une enzyme particulière fait une liaison peptidique entre les deux acides aminé on a donc deux acide aminés lié puis on passe au 3 éme codon puis au 4 éme...on polymérise donc les acide aminé en fonction du code pour aboutir au finale à la proteine.  [...]

Criblage virtuel et "docking"

Ah d'accord, donc en fait il ya un thésard qui fait du docking toute la journée alors, avec la station. C'est génial car tu te met des lunettes cristoliquide sur le cigare, et là tu voit ta protéine en 3D donc tu te balades carrément dans la molécule. Les efforts pour visualiser la position des acides aminés et des groupements fonctionnels sont nettement diminués.  [...] Après ya plus qu'à choisir une molécule potentielle et la mettre dans le LBD de la protéine. Les intéractions se font automatiquement et la machine calcule les distances en Angstrum des intéractions. Je crois qu'on peut aussi lui faire calculer des paramètres thermodynamiques pour évaluer la stabilité de l'intéraction et donc se faire une idée de l'affinité. Tout simplement génial.  [...]

[Biochimie] Acide aminés

Vous dites que les acides aminés sont laissés intacts mais jouent-ils un rôle dans le poids moléculaires de la protéine en question.  [...] On vient de me dire que la protéine dégradée garde ces acides aminés intact et que ces derniers forment la majeure partie du poids moléculaires de la protéine. On m'a également dit que la caséine posséde un poids moléculaire 3 fois moins important que l'albumine qui sont tous deux des protéines animales.  [...]

[Biologie Moléculaire] Page sds

4g de SDS pour 1g de protéine), la charge globale d'une protéine dépends alors uniquement de sa longueur en acides aminés, et du coups, de son poids moléculaire.  [...] La différence en poids moléculaire (et donc longueur et/ou complexité) entre protéines est énorme. Mais la dénaturation est là pour simplifier leur structure (il n'est censé resté que la structure primaire), et le SDS va camoufler les acides aminés de la protéine et en profiter pour uniformiser la charge.  [...]

[Biochimie] Modifications post traductionnelles et électrophorèse !

C'est possible mais ça fait une sacrée phosphorylation. Mais je suis d'accord avec toi que le SDS recouvre la protéine (je n'y ai plus pensé à ça... ) donc mon hypothèse est un peu foireuse, la tienne étant la plus probable. En plus sur 1863 acides aminés, c'est possible, les phosphorylations de cette protéine démontrées actuellement étant déjà une bonne dizaine, sans compter celles qui restent sans doute à découvrir.  [...] Je dois dire que j'ai assez de mal avec cette idée. Je serais plus pour celle de gorben parce que vu que la protéine est linéaire je pense pas que ça rajoute beaucoup d'encombrement, surtout à une protéine comme celle de LXR qui possède 1863 acides aminés. Mais bon c'est que mon avis.  [...]