• Forum - Protéine, Composition, Acide aminé

Biochimie, sur l'hydrolyse acide

* Quels sont les inconvénients de l'hydrolyse acide d'une protéine pour déterminer sa composition en acide aminé.  [...] * Démontrer que la relation donnant la concentration d'un groupement ionisable protoné dans une protéine est fonction hyperbolique de la concentration libre en proton du milieu.  [...]

ADN et protéines

La forme et la composition de cette poche est essentielle (et spécifique à la protéine). Un seul acide aminé modifié peut faire perdre toute activité à la protéine (par exemple les sites à cystéines actives ou à acides aspartiques...).  [...] Il doit aussi exister des cas plus compliqués où un acide aminé serait un site d'une modification post-traductionnelle nécessaire au fonctionnement de la protéine (glycosylation), mais on rentre dans des détails plus compliqués.  [...]

Problème avec mes dosages d'ARN

Le-Trool. si il y a une contamination par des protéines, ton rapport DO260/280 serait inférieur à 1. je te rappelle que les protéines (90%) absorbent à 280nm.  [...] dans une solution de protéine pur les protéines absorbent entre 260 et 280 nm (phe pic à 260 nm, trp pic à 280 nm ) tout depend de la composition de ta prot en acide aminé.  [...]

[Immunologie] Epitope (incompréhension)

J'ai une question à propos de l'antigène, il est dit que l'antigène possède plusieurs déterminants antigéniques (épitope), par exemple une bactérie est un pathogène celui ci possèdes des protéines membranaires donc les protéines membranaires seront les antigènes mais je comprends pas quelques choses c'est au niveau de l'épitope, la glycoprotéine transmembranaire de la bactérie aura par exemple des polysaccarides fixés a elle, ces polysaccarides pourrait être des épitopes Un Acide Aminée qui compose cette glycoprotéine pourrait être un épitope, enfaite je comprends pas tellement ce que pourrait être un épitopde au niveau d'une protéine par exemple, merci pour vos futures explications.  [...] Et on peut considérer un deuxième épitope. la poignée de l'autre côté. Bon, dans cet exemple les deux épitopes ont la même forme mais bien sûr, en prenant par exemple une protéine antigénique, les épitopes ont a priori une forme tridimensionnelle qui leur est propre, ainsi qu'une certaine composition en acide aminé qui compte aussi (par rapport aux charges, l'hydrosolubilité de tel acide aminé à tel endroit de la prot, etc).  [...]

[Biologie Moléculaire] albumine(blanc d'oeuf)

En soit, savoir quels acides aminés composent une proteine n'est pas tres informatif. Cherchez plutot quels domaines proteiques la compose, sont ils hydrophyles ou hydrophobes ect.  [...] Ta recherche sur les acides aminés de la protéine d'Albulmine te sera nécessaire pour pouvoir expliquer le phénomène de stabilité suite à l'émulsion des blancs d'oeufs. En effet la composition de chaque acide aminé va t'informer sur ses propriétés. hydrophile ou hydrophobe.  [...]

Le rapport Campbell ; Découverte majeure ou manipulation de données scientifiques ? - Page 3

Après, j'en reviens au fondamental. je ne vois pas la différence entre une protéine animale et végétale... Pour moi, cela reste un enchaînement d'acide aminé, qui sont essentiels à notre fonctionnement. Bref, tout cela me semble bien empirique (tout comme le rôle de la composition du SVF pour la culture cellulaire).  [...] C'est vrai que le dogme veut que les protéines soient découpées en acides aminées dans l'intestin avant d'être absorbés, et donc la séquence des Acides aminés n'importe pas, ce qui importerait c'est la quantité de chaque type d'acide aminés dans l'ensemble des protéines.  [...]

Feuillet Béta, composition

Je ne comprends pas bien votre question. La formation ou non de feuillet béta (structure secondaire) est due à la composition en acide aminé (structure primaire). Si vous changez cette structure primaire, vous pouvez modifier la présence de structures secondaires.  [...] En fait la composition d'un feuillet bêta dépend beaucoup de sa position dans la protéine, s'il est à la surface, la partie en contact avec l'extérieur sera principalement formée d'acides aminés hydrophiles (basiques, acides, alcools) alors que la partie dans la protéine sera majoritairement constituée d'acides aminés hydrophobes avec une préférence pour le tryptophane qui a un rôle structural important (acide aminé principal d'un coeur hydrophobe).  [...]

[Biochimie] Modifications post traductionnelles et électrophorèse !

Bizarrement cette explication me convient mieux, mais je la trouve encore un peu approximative... Le phosphate, malgré sa taille imposante doit pouvoir être comparable à une chaine latérale encombrante comme la lysine par exemple. Dans ce cas, la migration électrophorétique tiendrait compte aussi de la composition en acide aminé et, pour un même poids moléculaire, une protéine ayant une composition forte en acide aminés à chaîne latérale encombrante migrerait moins vite qu'une protéine à composition forte en acides aminés à chaine latérale peu encombrante.  [...] La protéine est linéaire à cause du SDS, peu importe la composition en acides aminés. Mais le phosphate fait office de chaine latérale sur la protéine si tu me permets l'expression.  [...]

[Biochimie] Hplc

HPLC est une chromatographie qui permet de séparer les composés en fonction de leur hydrophobicité. C'est donc une technique préparative et analytique. La phase mobile est un liquide adsorbant qui remplit la colonne. La phase fixe correspond à une colonne avec une granulométrie fine.   [...] Après il faut savoir qu'il existe RPHPLC pour Chromatographie d'adsorption en phase inverse qui repose sur le même principe que la HPLC mais on utilie une phase apolaire et hydrophobe. La RPHPLC est beaucoup plus utilisé que la HPLC (notamment pour la dégradation d'Edman et donc déterminer la composition en acide aminé d'une protéine).  [...]

protéine: hydrophile ou hydrophobe

En effet, un polypeptide résulte de la réaction de condensation de plusieurs acides aminés. Un acide aminé est un molécule composé d'un carbone central ( alpha ) lié à un atome d'hydrogène, à un radical R ( où R représente un groupement fonctionel ) ainsi qu'à un groupement amine et carboxylique.  [...] Je pense (je n'en suis pas sûr.) que le fait qu'une protéine soit hydrophobe réside dans sa composition en acide aminé hydrophobe (non polaire).  [...]