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[Biochimie] point isoelectrique et pka

si pk acide est égal au phi de la protéine alors quelle est la charge de la protéine dans la solution.  [...] En tous cas, si la solution est au même pH que le pHi de la protéine, alors la protéine n'est pas chargée (le pHi ou pI d'une molécule est le pH pour lequel sa charge globale est nulle ou on peut dire électriquement neutre).  [...]

[Biochimie] point isoelectrique et PKA

Le PI est une valeur globale (a l'échelle de la protéine par exemple) correspondant au pH de la solution dans laquelle la protéine à une charge globale nulle.  [...] merci d'avoir répondu. juste une dernière pr écision, on calcule le point isoélectrique d'une proteine grace aux PKA de ses acides aminés, c'est bien ça.  [...]

[Biologie Cellulaire] Protéines

a part ce qui a été dit je vois un début d'autre solution qui consiste à essayer de repérer un peptide signal. Certain de ces peptides signaux interviennent lors de la synthèse de la protéine et d'après leur environnement proche (charge et/ou hydrophobicité) on peut avoir une idée de l'orientation dans la membrane.  [...] - si ta protéine contient un seul domaine transmembranaire, tu recherches le peptide signal et tu en déduiras comment ta protéine est positionnée.  [...]

chromatographie échangeuse d'ions

le prtage selon la charge se fait en augmentant d'une façon graduelle le pH,et quand le pH de la solution d'elution est égale au pHi de la molécule alors la charge globale est neutre,donc la protéine se détache de la résine.  [...] - La repartition des charges a la surface de la proteine. Si les charges + sont regroupees a la surface de la proteine, celle-ci va s'accrocher beaucoup plus efficacement que dans le cas contraire.  [...]

Biochimie : Protéines

Le point isoélectrique, c'est en gros la valeur de pH ou ta protéine ne possède plus de charge c'est déterminé par les acides aminés qui la compose.  [...] En clair si ta protéine à un point isoélectrique de 5 et que le pH de la solution est à 4 ta protéine sera chargé positivement, mais si tu monte le pH de ta solution à 6 ta protéine sera chargé négativement.  [...]

Composition d'un peptide

j'ai trouvé la solution pour la charge nette steph avait raison car elle correspond à la somme des charges portées par chacun des radicaux ionisables des acides aminés dans une protéine à un ph donné.  [...] pour calculer le phi il faut tracer un tableau des pk ionisable dans la protéine et leur attribué leur charge en fonction du pk des autre groupe. C'est pas clair comme ça mais il y a une bonne explication à page 9 de.  [...]

difference entre le ph optimum et le ph isoelectrique

alors si j'ai bien compris, en supposant que le pH optimum d'une protéine est pH= 2.3. Alors. en milieu à pH=4 par exemple, ça ne veut pas systématiquement que cette protéine deviendra de charge plus négative, elle prendra alors sa charge en fonction de son pHi, même si celui ci ne s'accorde pas avec son pH optimum.  [...] j'ai cette ambiguïté car en cours, le prof nous a précisé qu'en pH optimum la protéine atteint son point culminant d'activité, et qu'en s'éloignant de ce pH, elle devenais soit de charge positive ou de charge négative selon le milieu, et cette définition appartiens plutôt au pHi (isoélectrique).  [...]

extraction et séparations des composants d'une membrane

L'éléctrophorèse va effectivement permettre de séparer les protéines (ne marche que pour les molécules chargées), ca pourrait peut etre marcher pour séparer les lipides non chargés des protéines mais ca a l'air difficile à mettre en oeuvre car on la pratique sur un gel avec de petites quantités non Or je recherche un méthode capable de fournir au moins 1 ml de solution de lipides (si ce n'est plus).  [...] Une solution est de faire une chromato sur résine échangeuse d'ions (à condition d'avoir utilisé un détergent non chargé (urée, triton...)... car alors, même si tes prot sont dans des micelles, la micelle aura une charge si elle contient une ou plusieurs protéines.  [...]

[Biochimie] La charge des protéines à pH=7

En fait la charge de la protéine vient de son pka, que tu peut trouver dans une table des matières des protéines. En fonction du pka de la chaine latérale et du pH, tu pourras déterminer si a un ph donné, la chaine latérale sera protonée ou déprotonné.  [...] J'aurais une dernière question (un peu HS). à pH très acide, est-ce que l'extrémité N-terminale est sous forme NH3+ et l'extrémité C-terminale sous forme COOH En gros, est-ce que les extrémités N et C terminales interviennent dans la charge totale de la protéine.  [...]

[Biochimie] Conséquence de changement d'acide aminé.

On pourrait imaginer que cet acide aminé chargé positivement se liait à un autre acide aminé chargé négativement (il y a beaucoup d'autres scénario possibles) et permettait un repliement correct de la protéine.  [...] Imagine que le premier rapprochement ne s'effectue pas car l'acide aminé chargé a disparu...le second aura plus difficile de se produire et les suivants encore plus. Du coup d'autres repliements vont survenir mais il conduiront à une protéine ayant une forme différente.  [...]