• Forum - Produit, Séquence, ADN

[Biologie Moléculaire] Conversion génique

La conversion produit le remplacement d'une séquence d'ADN par une autre,c'est un mécanisme de recombinaison. Les transposons sont des éléments d'ADN instables, capables de migrer vers différentes régions du génome par rétrotransposition.  [...] La conversion génique est un mécanisme de recombinaison permettant un transfert d'information génétique qui, par son résultat, évoque un double crossing-over (Jeffreys et al 1994). La conversion, au sens moléculaire, produit le remplacement d'une séquence d'ADN par une autre, apparentée mais non allélique (conversion interlocus) ou allélique (conversion interallélique).  [...]

qPCR résultats hors gamme standard!!!

Pour tester cette hypothèse. si tu as une chance que la séquence de l'ADNc soit différente de celle de l'ADN génomique (intron), séquence le produit PCR.  [...] Si les 2 séquences sont identiques, fait une PCRq avec un couple d'amorces placé dans un intron pour contrôler le niveau de contamination par de l'ADN génomique.  [...]

[Génétique] Les modification du génomes et du système immunitaire entraîner par le dopage

La sequence d'ADN, à moins que le produit en question soit génotoxique, a peu de chance d'être modifiée.  [...] Par contre j'imagine que des produits stimulants sont susceptibles de modifier indirectement l'expression de certains gènes ( typiquement l'inhibition de la synthèse de certains neuromédiateurs suite à l'absorbtion récurrente de molécule qui rentrent en compétition avec ces derniers ).  [...]

[Biologie Moléculaire] Rétro transcription (S.O.S)

J'aurais voulu savoir si la rétro transcription est l'inverse de la transcription C'est à dire que la transcription ce fera dans le sens rétrograde si je peux dire, alors que normalement elle se fait de manière antérograde non Normalement la transcription ce fait sur le brin matrice ou brin non codant ou brin transcrit.   [...] La rétro-transcription est juste une réaction enzymatique ayant pour substrat de l'ARN (ARNm) et en produit de l'ADN. En gros, avec la transcription tu passe d'un gène (ADN / ou plusieurs gènes) à un ARNm, et la rétro te permet de passer de l'ARNm à de l'ADN Ce nouvel ADN, appelé ADN complémentaire et noté ADNc et ne possède pas d'introns que l'on peut retrouver chez l'ADN des eucaryotes, c'est juste la séquence d'ARN transformée en ADN, c'est tout.  [...]

[Génétique] Biologie de synthèse : réalité ou fiction ?

je ne vois pas bien le lien que tu fais entre programmation et code génétique. Ce qu'on appelle code génétique c'est la correspondance entre séquence de nucléotides dans l'ADN et séquence d'acides aminés dans le peptides produit. Cette correspondance n'évolue plus de nos jours (en tout cas ce n'est pas observé). Ce qui évolue ce sont les séquences.  [...] Ca a longtemps été le cas en synthèse totale. Cela a permis de former des bataillons de jeunes chercheurs hyper-compétents techniquement,et de faire de belles avancées méthodologiques qui ont fait avancé la chimie orga en général. Par contre, après quelques décennies, l'intérêt est fortement retombé et les projets qui visent à synthétiser en 10 ans un produit naturel n'ont plus vraiment la côte.  [...]

[Biologie Cellulaire] Génie génétique - Méthode "phage display"

Les virus produit sont incubés en présence de la cible après lavage on récupère les virus accrochés, on les réamplifient et on recommence et on augmente la stringeance pour que seul les virus ayant la plus forte affinité pour la cible restent. Ensuite l ADN des virus est sequencé pour trouver le meilleur peptide.  [...] This approach has led to the identification of a unique set of homing peptides with high in vivo selectivity (6–9). We have used homing peptides to target i.v.-injected qdots to specific vascular sites in mice (Fig. (Fig.1).1). One of these peptides binds to membrane dipeptidase on the endothelial cells in lung blood vessels (9), and the other two preferentially bind to tumor blood vessels (10) or tumor lymphatic vessels (11) and the tumor cells.   [...]

[Biochimie] modification génétique

Dans l'absolu, oui on peut tout changer. Le truc, c'est que la séquence d'ADN telle qu'elle est a un but, ça permet à l'organisme de pouvoir faire des choses. Changer son ADN, c'est changer ces possibilités. Si on le change trop, on peut carrément éliminer sa possibilité de permettre à l'organisme de vivre.  [...] Je ne sais pas comment le pavot par exemple (exemple... intéressant) produit son alcaloïde, mais je peux supposer sans trop de difficultés que ça nécessite plus d'une opération. Donc modifier cet alcaloïde peut rapidement signifier modifier plus d'une séquence d'ADN, rendant l'opération plus difficile à réaliser et à rendre viable par la suite.  [...]

[Biotechnologie] primer extension

Pour avoir aussi fait les deux, je trouve la primer extension plus rapide. A la place de la radioactivite tu peux marquer les oligos par un fluorophore (type sequencage ADN) et l'envoyer comme une sequence. Tu obtiens la taille de ton produit, et ca t'a pris une heure de manip et un timbre poste.  [...] Ensuite tu les passes sur un ABIprism (J'avais utilise un 310 en analyse de fragment, pas sequencage) contre un marqueur de poids moleculaire. En fait c'est tout bete, il suffit de dire que tu veux la taille du fragment, et tu prepares ton mix avec formamide + echantillon+marqueur de poids moleculaire (TAMRA 500 par exemple), et le sequenceur te donne 40 min plus tard la taille de ton produit marque.  [...]

[Génétique] qu'est ce qu'une collection d'EST

en fait c'est très simple. les EST ou express sequence tag sont des petits fragments de séquences exprimées et vu que dans les banques de séquences tu n'as pas d'ARNm mais des ADNc correspondants à ceux-ci, les EST sont tout simplement des petits morceaux de ces ADNc.  [...] Les EST sont utilisés notamment pour localiser de nouveaux gènes dans le génome. A partir d'ARNm, on produit les ADNc. Seules les extrémités 5' et/ou 3' des ADNc sont séquencées. En supposant que le génome soit bien identifié, il suffira d'aligner la séquence avec le génome ou bien d'utiliser la technique FISH afin de déterminer l'emplacement du gène dans l'ADN génomique.  [...]

[Biologie Moléculaire] Connaissez -vous un outil d'analyse d'affinité d'un primer pour une séquence ?

Une amplification (géométrique) exponentielle dite hyperbranched RCA (HRCA), également connue sous le nom de ramification ou RCA en cascade, est réalisée en utilisant une deuxième amorce avec une séquence identique à une partie du cercle d'ADN.  [...] Puisque mon Forward primer (=droit) est complémentaire à la molécule d'ADN template, son hybridation avec cette dernière lance le processus de RCA. Mais l'autre amorce, l'amorce renversée (Reverse primer=gauche) est conçue pour être complémentaire du produit de RCA (ce qui signifie que sa séquence est identique à une partie de la molécule d'ADN template), ainsi cette amorce seule, sans la première, n'est pas censée s'hybrider au template et lancer elle aussi une RCA. La réaction est @ 30°C en isotherme.  [...]