• Forum - Phase, Séquence, Protéine

[Biologie Moléculaire] Choisir le bon vecteur?

La séquence insérée là dedans ne sera qu'amplifiée, jamais exprimée étant donné qu'il n'y a pas de promoteur de transcription.  [...] Ce vecteur ne sert donc pas à produire n'importe quelle protéine mais à mettre les séquences qui vont permettre de promouvoir la transcription du gène rapporteur luciférase.  [...]

mutation génétique

il peut arriver énormément de choses à la protéine. La transcription/traduction se déroulera normalement, et par exemple, si tu avais AAA CCC GGG AAA TTT (...) comme séquence sauvage, et qu'après mutation tu obtiens AAA CC GGG AAA TTT (...), tu auras donc comme codons. AAA CCG GGA AAT TT (...).  [...] une délétion hors phase a des conséquences dramatiques sur la séquence, d'autant plus qu'elle se produit en début de séquence codante. Dans le cas d'un décalage de cadre, en général on tombe très très rapidement sur un codon stop, donc en plus d'avoir une protéine qui n'a rien à voir, elle a des chances d'être raccourcie.  [...]

Définition d'un Pseudogène .

Je crois qu'il y a une deuxième catégorie de pseudogènes. Dans une séquence d'ADNg tu détecte ton gène mais en 3', il y a une longue succession de A. A ce moment là tu peux dire que t'as un pseudogène provenant d'une infection antérieure par un rétrovirus.  [...] S'il y a similitude au niveau de la séquence des nucléotides (blastn) mais qu'il est très difficile de reconstituer la protéine (accumulation de sauts de phase), la séquence étudiée risque d'être un pseudo gène.  [...]

[Biochimie] Protéine non détéctable

Voila, j'ai réalisée une construction dans le pCS2 flag, la construction a été vérifiée par séquencage sans aucun soucis. Par contre pas moyen d'avoir la protéine en western blot, j'ai donc réalisé une autre construction qui exprime ma protéine d'intérêt fusionnée à la GFP même chose rien.  [...] enfait j'ai cloné un gène d'environ 600 pb exprimé chez le xénope dans le pCS2 flag. le clonage marche super bien et tout. la séquence de mon gène est bien en phase avec mon étiquette en 5', ya pas de mutation rien. tout devrait bien marché mais voila j'ai pas de proteine.  [...]

repérer le brin transcrit

Pour la séquence MHAGMNRLITV, je me base tout simplement sur le code génétique. ATG=M, etc. Un polypeptide, c'est une succession d'acides aminés formant une molécule. Un polypeptide, c'est une protéine. (j'ai jamais compris la subtilité de signification entre polypeptide et protéine, mais c'est kif-kif à l'usage ).  [...] Donc. ce n'est pas parceque tu vois dans une séquence 3 nucléotides successifs correspondant à un potentiel codon stop qu'il s'agit effectivement d'un codon stop. Tout dépend de la phase de lecture. (typiquement dans la séquence d'un gène codant une protéine, il y a plusieurs codons stop potentiels, mais potentiels uniquement, parcequ'ils ne seront pas lus comme tels).  [...]

DM 1ère S biologie

Phase codante, car on peut lire une séquence nucléique selon 3 phases, puisqu'il s'agit de triplets (en décalant chaque fois d'une base le début de la lecture). Mais une seule de ces phases, commençant au codon initiateur, code pour la protéine.  [...] Sinon le brin transcript est bien celui du bas, qui va donner un ARNm de séquence identique (sauf T-. U) au brin non transcrit. c'est évidemment cette séquence qu'il faut lire pour obtenir la protéine.  [...]

[Biologie Moléculaire] Site de restriction

Si vous avez votre séquence ATG ATC ATC ATC ATC, vous allez supprimer l'ATG et faire entrer cela en Bam. Vous aurez donc dans votre vecteur. ATGxxBamHIATATATATATATA. Ce qui sera transcrit sera ATG xxG GAT CCA TCA TCA TCA TC. Ça ne codera pour la protéine que vous attendez parce que votre séquence codante n'est pas entrée en phase par rapport à l'ATG.  [...] Sinon, pour la raisonnement sur la phase, je pense que vous passez encore à coté. La phase c'est simplement que le premier nucléotide de votre séquence d'intérêt doit tomber au début d'un codon si l'on prend pour départ un ATG.  [...]

[Biologie Cellulaire] Immunofluorescence et cycle cellulaire

Je souhaite identifier dans quelle phase du cycle cellulaire ma protéine est exprimée en immunofluorescence par co-marquage. Pourriez-vous m'indiquer des marqueurs qui fonctionnent très bien pour différentier les différentes phase du cycle.  [...] Oui je pense que c'est une bonne idée,car la protéine CENP-F commence à s'accumuler dans la matrice nucléaire durant la phase S, atteignant une expression maximale durant la phase G2. Au début de la mitose, CENP-F se concentre sur les kinétochores où elle persiste jusqu'en métaphase.  [...]

[Biochimie] Chromatographie Affinité et NaCl

La rétentions est liées à la solubilité de la protéine dans la phase mobile, si on ajoute du NaCl, le soluté sera moins soluble dans la phase mobile donc il sera mieux retenu.  [...] Mais si on n'utilise pas la structure propre de la protéine mais une modification post-traductionnelle, comme une glycosylation pour retenir notre protéine (phase stationnaire concanavaline par exemple), où est l'intérêt de la concentration en sel ici Au niveau de la concanavaline.  [...]

[Biologie Moléculaire] TPE 1Ssvt mutations génétiques

délétion. en phase (nombre de bases délétées = un multiple de 3), dans ce cas, il manquera des acides aminés dans la protéine mais elle peut garder une partie de sa fonction.  [...] hors phase (nombre de délétions ` multiple de 3). dans ce cas, la phase de lecture sera décalée, il y a de grande chances pour que cela fasse apparaitre un codon stop et une protéine tronquée.  [...]