• Forum - Peptides, Séquences, Acides aminés, Protéine, Origine

[Divers] Peptides bioactifs !

Les peptides bioactifs sont des séquences définies d'acides aminés qui sont inactives au sein de leur protéine d'origine, mais qui présentent des propriétés particulières une fois libérées par action enzymatique. On les appelle aussi peptides fonctionnels.  [...] Ces peptides bioactifs sont capables d'exercer, entre autres, un effet sur le système digestif, les défenses de l'organisme (par exemple, un effet antimicrobien ou immunomodulateur), le système cardiovasculaire (notamment un effet antithrombotique ou antihypertenseur), et/ou le système nerveux (tel qu'un effet sédatif et analgésique de type opioïde).  [...]

[Biotechnologie] spectrometrie de masse

ce que j'ai compris c'est que la spectrometrie de masse SM permet de séparer les molecules (ici les peptides) selon leur masse. Ce que je ne comprend pas c'est comment avec la spectromrtrie de masse en tandem MS/MS on arrive a deduire la sequence en acides amines a partir des masses des peptides.  [...] Ce qu'il faut avoir a l'esprit, c'est que la masse d'un peptide est statistiquement unique au dela de 6 ou 7 acides amines (je ne sais plus exactement). En comparant les masses des peptides obtenus aux masses theoriques que l'on peut obtenir a partir d'une base de donnees de proteine, on peut identifier ainsi la sequence a partir de la masse (algorithme Mascot).  [...]

Polypeptide végétal

Ouais, monopeptide semble n'exister qu'en anglais, une langue ou apparemment les acides aminés simples semblent être aussi classés sous le nom de protéine.  [...] pas vraiment, en fait on parle de protéine lorsqu'on parle d'une chaine d'environ 100 acides aminés, en dessous ce sont des peptides tout simplement.  [...]

[Biochimie] Acide Aminé

En fait je suppose qu'ils recherchent l'épitope d'une protéine reconnu par ton IgE. Donc ils synthétisent des peptides de 10 acides aminés ici (c'est bien ça ) qui recouvrent toute la séquence de ta protéine (ou plutôt ici une région de ta protéine vu que ça semble être une étape d'affinage non ).  [...] Et deux peptides qui se suivent se chevauchent vu qu'ils partagent 9 acides aminés en commun ( nine amino acids overlap ), et on passe d'un peptide au suivant en décalant la séquence d'un acide aminé ( one amino acid offset ).  [...]

Pectine

Un protide est une molécule composée d'un assemblage complexe d'acides aminés. Elle est dite peptide si elle en contient un nombre peu élevé, et protéine si celui-ci est important.  [...] La différence se situe dans la composition. une protéine est constituée d'acides aminés et un polysaccharide d'oses. La pectine étant un polymère d'oses, c'est donc un polysaccharide.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 2

J'ai adoré son intervention sur l'homochiralité. d'après lui, il s'agit d'un faux problème. Les sucres sont droits (D), les acides aminés dans les protéines modernes sont gauches (L) et dans l'ARN (ainsi que dans l'ADN, apparu plus tard) le sucre (du RIBose, dont la structure a été déterminée au Rockefeller Institute of Biochemistry) est D.  [...] En effet, le site actif en 3D d'une protéine est comme un gant. il ne peut reconnaître qu'une des deux formes. Il est très probable que dans les peptides ou les protéines qui existaient avant les protéines modernes, il y ait eu des proto-protéines avec des acides aminés D.  [...]

[Génétique] Biologie de synthèse : réalité ou fiction ?

je ne vois pas bien le lien que tu fais entre programmation et code génétique. Ce qu'on appelle code génétique c'est la correspondance entre séquence de nucléotides dans l'ADN et séquence d'acides aminés dans le peptides produit. Cette correspondance n'évolue plus de nos jours (en tout cas ce n'est pas observé). Ce qui évolue ce sont les séquences.  [...] - des efforts qui conduisent à de belles avancées méthodologiques et technologiques, et qui pour certaines vont disséminer rapidement dans d'autres domaines. L'introduction d'acides aminés non-naturels dans des protéines est typiquement quelque chose d'hyper utile et qui est utilisé par de nombreux laboratoires (par contre, la technique des quadruplets de Jason Chin peine, il me semble, à trouver des applications dans le monde réel ).  [...]

[Biochimie] séquençage d'une proteine

Comment détermine on l'ordre des acides aminés d'un peptide Qui se trouve avant qui dans le peptide et comment ensuite determine on l'ordre des peptides qui constituent la protéine Quel est le premier peptides quel est le 2ème etc.  [...] La HPLC ne permet pas d'identifier les acides aminés, elle n'est utilisée que pour séparer les peptides. La protéine est digérée en plusieurs peptides, ces peptides sont séparés par la HPLC. Les peptides ne sont pas fragmentés durant la HPLC, il n'y pas pas de liaisons covalentes qui sont cassés entre les a.  [...]

[Biochimie] origine de la vie

On sait que des acides aminés peuvent s'associer pour donner des peptides et donc des protéines de manière à priori assez simple, sans enzime. Supposons que les bases azotés soient capables de mémoriser l'assemblage des acides aminés en peptides via la codification (codons).  [...] La une enzyme particulière fait une liaison peptidique entre les deux acides aminé on a donc deux acide aminés lié puis on passe au 3 éme codon puis au 4 éme...on polymérise donc les acide aminé en fonction du code pour aboutir au finale à la proteine.  [...]

[Divers] Explicitation d'un terme

je plussoie les propos de guillaume 69. Jamais entendu pour des protéines ou acides aminés, pourtant je travaille énormément avec des peptides et acides aminés.  [...] En philosophie, plastique signifie. qui a la puissance de former. Je pense effectivement que c'est cela. On utilise beaucoup le terme de plastique pour le cerveau qui a la capacité de se remodeler en permanence et de s'adapter à l'environnement appréhendé par l'organisme.   [...]