• Forum - Orientation, Séquence, Acide

[Génétique] endonucléases

Une endonucléase de restriction peut elle couper dans un exon.   [...] Bien sur, l'endonucléase ne reconnait que le type (ADN, ARN), l'orientation et la séquence d'un acide nucléique. Les séquences introniques et les exons mais aussi l'ADN non codant ont exactement la même structure et ne diffèrent que par leur rôle. Donc la présence d'un site de restriction suffit.  [...]

ADN transcription brin matrice et brin codant

En règle générale de toute facon tu dois orienter tes séquences (toujours) j'ai déjà vu des erreurs dans des articles scientifiques parce que les auteur s'étaient trompés dans l'orientation de leur séquence, et après avoir perdu plusieurs mois avec leurs primers j'ai refais les primers a partir des séquences génomiques qu'ils ont utilisés et une séquence était inversé, et après avoir commandé le nouveau primer (donc pas celui de l'article, mais basé sur la meme zone) bizarrement cela marchait beaucoup mieux.  [...] pour le brin codant, c'est le complémentaire du brin matrice (donc identique a l'ARNm à l'exception qu'on a pas d'Uracile dans l'ADN mais de la Thymine) et donc puisque c'est censé etre la meme séquence que l'ARN, pourquoi avoir gardé l'orientation 5'-3' mais changé le sens des lettres de la séquence en plus du probleme d'orientation dans ce brin, tu as un problème séquence, tu as la meme lettre aux deux extrémitées pourtant aucune de tes autres séquences(qui sont soit complémentaires soit identique) ne possède la meme base a gauche et a droite.  [...]

[Biologie Moléculaire] Comment fabriquer une amorce PCR

Par exemple, si vous voulez amplifier la région 500 à 1000 d'un gène, alors vous prenez une amorce s'hybridant du nucléotide 500 au nucléotide 520 (car les amorces que l'on utilise font le plus souvent 20 bases) en orientation sens (même séquence que la séquence codante du gène), et vous prenez une amorce s'hybridant du nucléotide 1000 au nucléotide 980 en orientation antisens (séquence complémentaire à la séquence codante du gène).  [...] Admettons que la séquence nucléotidique de la region 500 à 520 soit ATAGCT (je mets moins de nucléotides exprès), dans le sens 5'-3'. Pour avoir une orientation sens, il faut selon moi se placer sur le brin 3'-5' de séquence complémentaire. TATCGA. De ce fait, la polymérase va former un brin orienté 5'-3' de séquence ATAGCT. C'est bien ça.  [...]

[L1]Formule développée et complémentarité base ADN.

Ensuite j'ai un exercice similaire ou on me dit pour chacun de ces fragments d'ADN donnez son orientation,ainsi que la séquence et l'orientation du brin complémentaire.  [...] Pour donner l'orientation d'un brin il faut chercher un codon start ou stop Si oui je ne trouve pas un de ces deux codons ( ATG,UAG pour les starts,et UAA,UAG,UGA ( TAA,TAG,TGA,) pour les stop )) dans ma première séquence.  [...]

Technique pour intégrer une protéine chimère dans la membrane externe?

Je cherche à savoir s'il est possible, à partir de la séquence nucléotidique d'une protéine d'intérêt ( possédant les carractéristiques membranaire ), d'ajouter une séquence tag, lui permettant d'être intégrée à la membrane extracellulaire, et si oui, comment gérer son orientation d'intégration.  [...] Oui je pense que c'est possible. Il suffit de lui mettre une bonne séquence d'adressage en Nt. Pour l'orientation il me semble que ca va dépendre beaucoup du nombre de segment TM que possède ta protéine. Mais le mieux serait de lui mettre les signaux provenant d'une protéine qui à l'orientation que tu désires.  [...]

où a lieu la traduction de l'ARNm en peptides?

Il faut juste savoir que les ARNm déstiné a être traduit au niveau des ribosomes liés, possedent une séquence polypeptidique appelée séquence signal et donc qui permet l'orientation de cet ARN.  [...] Mantos, ben je vois ce que tu veux dire et je vais tenter d'eclaircir et de montrer la nuance. La synthése des protéines sur un ribosome libre ou lié dépend de d'une information contenue dans la portion N-terminale du polypeptide c'est a dire, la 1ère portion qui sort du ribosome durant la synthése des protéines.   [...]

[Biologie Moléculaire] probléme d'orientation des deux brins

nous avons traités un seul cas d'orientation c'est a dire le triplet ATG mais il nous reste celui de GTA parce que je sais que il y a une différence entre les deux alors je vais essayer de chercher pour mieux comprendre.  [...] Tout ce que je peux dire c'est que le brin simple d'ARN est toujours de même séquence (à l'exception des T remplacés par des U) et de même orientation que le brin non-transcrit (ou codant) d'ADN.  [...]

[Divers] [Méthodologie] Aide contre les noms barbares en bio !!!

Supposons que l'on connaisse les états successifs d'un même caractère a au cours de la généalogie. Nous les appellerons par exemple a X aH X aHH. Dans cette séquence ordonnée, aH est apomorphe par rapport à a mais plésiomorphe par rapport à aHH. L'orientation de la séquence du plésiomorphe à l'apomorphe est sa polarité.  [...] Tout l'édifice analytique repose donc sur la reconnaissance des apomorphies. Cette tâche est délicate, car les similitudes partagées entre plusieurs taxons peuvent être interprétées de trois façons différentes. il peut s'agir soit d'une synapomorphie qui nous indique une relation de groupes frères, soit d'une symplésiomorphie, soit d'une convergence adaptative sans signification phylétique particulière.   [...]

Thérapie génique : chemins vers le perfectionnement !!!

L'insertion incontrôlé de L'ADN&, reste l'une des contraintes de la thérapie génique&, les recherche tend de plus en plus à rendre ces insertions plus ou moins maîtrisable, on parle déjà de l'utilisation de séquence particulières qui permettront d'assurer un certain degré d'orientation &.  [...] Y a-t-il d'autres points qui peuvent être ciblé à fin de maîtriser de plus en plus cette insertion.   [...]

[Biologie Moléculaire] qu'est ce qu'une ORF?

Ensuite il y a bien évidemment les reverses. Mais il n'ont de sens que si je n'ai pas d'indication sur l'orientation de ma séquence. Or j'ai pris le soin de l'orienter. Donc ici je n'ai pas à prendre en compte les 3 reverses.  [...] A sequence of successive nucleotide triplets that are read as CODONS specifying AMINO ACIDS and begin with an INITIATOR CODON and end with a stop codon (CODON, TERMINATOR).  [...]