• Forum - Niveau, Promoteurs, Bactéries

[Journal club] Reponse strigente et regulation globale de l'expression

La stabilite du complexe d'initiation au niveau du promoteur des ARNr etant proportionelle au degre de sur-enroulement de l'ADN, les auteurs ont egalement mesure la demi-vie du complexe d'initiation, mais cette fois en utilisant, comme matrice, de l'ADN sur-enroule correspondant aux 3 promoteurs stringents testes.  [...] Néanmoins, un changement du pourcentage en GC au niveau de ces promoteurs a pu éventuellement régler le problème chez ces bactéries, si elles utilisent ce système.  [...]

[Biochimie] thérapie génique

Sauf que les rétrovirus modifiés ne pratique pas l'insertion site-specifique et ont tendance a s'insérer au niveau des promoteurs de gènes pouvant entrainer ainsi des cancers. L'utilisation de la recombinaison homologue pourrait être une solution mais je pense que l'efficacité est extrêmement faible vu la taille du génome humain et reste donc minoritaire face a l'insertion au niveau des promoteurs.  [...] Non, l'insertion des rétrovirus au niveau des promoteurs est un biais naturel et est donc indépendent du fait qu'il y a moins de 5% du génome qui code pour des gènes. Je ne connais pas les proportions mais ca ne m'étonnerais guère que plus de 50% des insertions se fassent au niveau des régions promotrices.  [...]

[Biologie Moléculaire] replication transcription

Est ce que La sous-unité ð est un composant permanent de l'ARN polymérase d'E.coli qui lui permet d'initier la polymérisation au niveau de promoteurs appropriés dans le génome bactérien.  [...] non ce n'est pas un composant permanent de l'ARN polymérase d'E.coli mais cette sous unite va se fixé aux 5autres sous unites pour qu'elle puisse de mettre au niveau du promoteur et commencé la transciption pasque sans cette sous unité qui vient se fixé entre les 5sous unites l'arn polymerase se fixera sur l'adn mais ne pourra pas commencer la transciption.  [...]

Mutation?!

Les mutations sont frequentes dans les regions intergeniques, mais un peu moins au niveau des promoteurs, surtout au niveau precis des sites de fixation des facteurs de transcription.  [...] Par ailleurs, il existe des promoteurs TATA-less (LXR doit en connaître un bout ), donc la TATA-box est une séquence de reconnaissance au niveau du promoteur parmi d'autres.  [...]

[Biologie Moléculaire] Disponibilité ARNt procaryotes

J'ai muté la séquence codante d'un gène bactérien mais de façon silencieuse afin d'en conserver la séquence en acides aminés. Je teste maintenant l'activité de la protéine codée par le gène sauvage ou le gène muté en la surexprimant par le promoteur inductible PBAD.  [...] Merci bien pour ta réponse. J'ai trouvé le papier, mais pas de souci.en fait, je bosse chez les bactéries, et il est plutôt question d'interactions entre promoteurs convergents dans mon cas (dont un dans la CDS de mon gène).  [...]

[Biologie Cellulaire] comment la structure du gène facilite la production d'une grande variabilité protéique

Je m'explique, j'entend par là qu'un gène a plusieurs possibilités de donner une diversité de protéines différentes selon la combinaison d'allèle dont le gène est constitué. D'où ma pensé si le gène est fragmenté en plusieurs morceaux il y aura plus de chance que la diversité des protéines soit grande.   [...] Au niveau transcriptionnel, on a les point +1 alternatifs (appelés aussi promoteurs alternatifs) et les sites de polyadénylation alternatifs. Au niveau traductionnel, on a les glissement d'ORF, qui sont l'utilisation de différents codons start. On a aussi les IRES (Internal Ribosomal Entry Site) qui permettent au ribosome de débuter la traduction en plein milieu d'un ARNm eucaryote, sans passer par la partie 5'-UTR.  [...]

[Biologie Moléculaire] Transcription des gènes

Les promoteurs ne font pas partie du gène. La question suppose qu'un gène peut être constitué de plusieurs parties. Réfléchis, tu le sais certainement et ne pense pas aux gènes des bactéries ou des virus qui sont plus simples.  [...] Je ne serais pas si catégorique. Le promoteur est régulateur et jamais codant mais je pense qu'on peut quand même dire qu'il fait partie du gène. Après tout un gène sans promoteur ne sert à rien.  [...]

[Biologie Cellulaire] Comment, après transgenèse à l'aide d'un adénovirus, le gène épisomal, non réplicatif est répliqu...

Oui. Mais le transgène est également probablement présent dans les cônes bleus. Toutefois, comme l'expression du transgène est dépendante d'un promoteur cellule-spécifique (que l'on ne trouve que dans les cônes rouges et verts), il ne sera pas exprimé dans ces cônes bleus.  [...] A priori, le statut intégré ou épisomal du transgène n'influence pas son expression, ou alors faiblement. C'est surtout la nature du promoteur qui va déterminer le niveau d'expression (il existe des promoteurs forts, d'autres moins).  [...]

l'arn polymérase?????

Au niveau du nombre et de la séquence de fixation des facteurs de transcription, c'est tout de même bien plus simple pour les promoteur PolIII et encore plus pour PolI, que pour les promoteurs PolII.  [...] Enfin bon, pour son niveau scolaire (lycée probablement), je doute qu'on aille plus loin que l'ARNpolymérase fixe son promoteur et initie la transcription du gène en aval.  [...]

[Génétique] promoteur de la transcription

Les promoteurs sont des régions dont le but est de recruter des ARN pol. La capacité d'un promoteur à fixer des ARN pol est un facteur clé pour le niveau d'expression du gène qui suit.  [...] Effectivement, le promoteur est la région nécessaire à l'initiation de la transcription. elle est située en amont du 1er nucléotide copié sur l'ARN (numéroté +1 ). Les nucléotides en amont sont numérotés négativement quand l'on se réfère au gène en question.  [...]