• Forum - Niveau, Promoteurs, Bactéries, ADN

Définition exacte d'un promteur.

Je recherche la définition exacte d'un promoteur, en particulier chez les bactéries. Les sources se contredisent, que ce soit dans mes cours, dans les livres ou sur internet.  [...] Pour certains, cela semble être la séquence d'ADN recouverte par l'ARN polymérase lorsque celle-ci se fixe à l'ADN (au niveau de la séquence -35 chez les bactéries). Si c'est effectivement le cas, la taille des promoteurs bactériens devraient être constante non Ce n'est pas ce qui ressort des différents schémas. Et de où à où s'étend cette séquence.  [...]

[Journal club] Reponse strigente et regulation globale de l'expression

Est-ce que cet élégant modèle, montré chez E. coli, a été retrouvé chez d'autres bactéries D'autres part, comment se produit le surenroulement au niveau des promoteurs chez les bactéries Si ce surenroulement est provoqué de manière spontanée grâce à la capacité de l'ADN à former des structures secondaires, est-il possible de retrouver ce mécanisme de régulation chez des bactéries thermophiles (si ce n'est pas déjà fait ).  [...] Néanmoins, un changement du pourcentage en GC au niveau de ces promoteurs a pu éventuellement régler le problème chez ces bactéries, si elles utilisent ce système.  [...]

soutern, PCR, banque genomique

en fait on intègre le morceau d'ADN inconnu dans un ADN bactérien dont on connait la séquence. On mettra donc des promoteurs qui reconnaîtront cet ADN bactérien.  [...] oui, il n'existe pas d'amorce universelle utilisable pour n'importe quel ADN. Il me semble qu'on peut en utiliser par exemple des amorces universelles communes à un genre bactérien. Ces amorces se fixent sur une région conservée de l'ADN.  [...]

Récepteur nucléaire

Cependant, j'ai une petite interrogation sur leur localisation. En effet, mon prof nous a indiqué qu'ils étaient dans deux endroits. Le premier serait dans la région promotrice de l'ADN (HRE). Donc là pas de problème car j'ai trouvé des informations là dessus mais, toujours d'après mon cours, il y aurait également des récepteurs au niveau des régions régulatrices. C'est sur ce point que je bloque un peu.  [...] Les régions de l'ADN sur lesquelles les récepteurs nucléaires des hormones se lient sont appelées éléments de réponse à l'hormone (HRE) car leur présence au niveau des promoteurs de certains gènes est indispensable pour que l'hormone régule la transcription de ces gènes.  [...]

Mutation?!

Les mutations sont frequentes dans les regions intergeniques, mais un peu moins au niveau des promoteurs, surtout au niveau precis des sites de fixation des facteurs de transcription.  [...] Concernant les séquences consensus, je pense que la TATA box en fait partie étant donné qu'on la trouve dans quasiment tous les promoteurs de nos gêne et donc pour moi si il y a changement au niveau de ce fragment d'ADN, on ne parlera plus de polymorphisme mais plutôt de mutation car cela affecterait largement la transcription du gêne soit en sur-exprimant ou en l'inhibant et cela se refléterait sur le phénotype, enfin je pense.  [...]

[Biochimie] expression de protéines

le ribosome ne choisit pas, c'est au niveau de la transcription que tout se joue. Les facteurs de transcription, régulent l'expression des gènes en fonction du type cellulaire. Ce sont donc ces FT qui déterminent quels gènes seront transcrits, et en quelle quantité.  [...] Comme il a été dit plus haut, il y a plusieurs niveaux de régulation. Tout d'abord, certaines zones de l'ADN serons plus accessible que d'autres aux ARN polymérases, c'est l'épigénétique. Il y a aussi une régulation transcriptionnelle du aux facteurs de transcriptions et aux promoteurs des genes.  [...]

[Biochimie] thérapie génique

Sauf que les rétrovirus modifiés ne pratique pas l'insertion site-specifique et ont tendance a s'insérer au niveau des promoteurs de gènes pouvant entrainer ainsi des cancers. L'utilisation de la recombinaison homologue pourrait être une solution mais je pense que l'efficacité est extrêmement faible vu la taille du génome humain et reste donc minoritaire face a l'insertion au niveau des promoteurs.  [...] Non, l'insertion des rétrovirus au niveau des promoteurs est un biais naturel et est donc indépendent du fait qu'il y a moins de 5% du génome qui code pour des gènes. Je ne connais pas les proportions mais ca ne m'étonnerais guère que plus de 50% des insertions se fassent au niveau des régions promotrices.  [...]

[Biologie Moléculaire] Problème transfo...

Non, l'une des extrémités est coupée par BamHI, l'autre par NcoI. Ceci n'explique d'ailleurs toujours pas l'histoire du plasmide fantôme... Pour moi, c'est une contamination. mes bactéries ont choppé une MST.  [...] Par contre bacillus est un gram+, donc un %GC plus faible que E. coli. Quand je bossais sur une bacterie a faible %GC, j'avais souvent des problemes d'expression (les sequences a haut taux de AT sont souvent reconnues a tort par coli comme etant des promoteurs), voire de mutations, ou de duplications (les ADN/ARN pol de coli n'aiment pas les succession A/T).  [...]

[Biologie Moléculaire] replication transcription

Est ce que La sous-unité ð est un composant permanent de l'ARN polymérase d'E.coli qui lui permet d'initier la polymérisation au niveau de promoteurs appropriés dans le génome bactérien.  [...] non ce n'est pas un composant permanent de l'ARN polymérase d'E.coli mais cette sous unite va se fixé aux 5autres sous unites pour qu'elle puisse de mettre au niveau du promoteur et commencé la transciption pasque sans cette sous unité qui vient se fixé entre les 5sous unites l'arn polymerase se fixera sur l'adn mais ne pourra pas commencer la transciption.  [...]

[Biologie Moléculaire] Regulation des gènes chez les eucaryotes

C'es facteurs de transcription sont des protéines capables de s'accrocher au génome au niveau de zones promotrices, situées juste avant le gène. Ils sont spécifiques seulement de certains promoteurs, d'ou spécificité au niveau des gènes exprimés. Ainsi, une fois les facteurs de transcription liés aux promoteurs, ils permettent a la machinerie de transcription de se mettre en route et de produire les arn messagers voulus.  [...] Par exemple, les marques épigénétiques se trouvent plus fréquement au niveau des promoteurs et/ou en plein centre des orfs (auquel cas on leur attribut un role dans la régulation fine de la vitesse de transcription d'un gène), tant est si bien qu'à y regarder plus finement on peut sans doute considérer au niveau d'un gène donné des zones plus condensées que d'autres.  [...]