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[Biologie Moléculaire] traduction et mutation

2) une mutation d'un gene bactérien génre un codon stop UGA au milieu de l'ARNm codant le produit proteique. une seconde mutation dans la cellule provoque un unique changement du nucléotide dans un ARNt qui permet la traduction correcte de la proteine,autrement dit la seconde mutation annule ou supprime l'anomalie causée par la premiere.  [...] l'ARNt altéré traduit le codon UGA par un tryptophane. Quel changement nucléosidique s'est probablement produit dans la molécule ARNt mutante.  [...]

[Biologie Moléculaire] siRNA résistant

En théorie une seule mutation suffit, en pratique tu peux en faire plusieurs pour être sûr. Il me semble que la meilleure zone où faire les mutations est la partie correspondant à la 1ère moitié 5' du siRNA antisens, des nucléotides 2 à 10 car c'est là que l'appariement est important pour qu'il y ait clivage, donc sur ton ARNm c'est la partie 3' dans la zone ciblée par ton siRNA.  [...] Le but est surtout que le siRNA ne puisse plus induire la dégradation de son ARNm cible par l'absence de reconnaissance par RISC. Donc il y a juste à faire en sorte que la mutation du siRNA soit suffisante. Par contre, une fois la mutation choisie, je te conseille de blaster la séquence de ton siRNA mutant de façon à ne pas avoir des effets non spécifiques dûs à un ciblage d'un autre ARNm.  [...]

[Biologie Moléculaire] Petite question sur la terminaison de la traduction

Même si une mutation annule ce codon STOP en revanche il y a toujours des signaux d'arrêt de la traduction, je pense notamment à la queue polyA des ARN messagers. Cette queue permet la fixation de protéines pour la circularisation des ARNm, si le ribosome arrive jusque là il va y avoir un encombrement stérique qui va amener le désassemblage du ribosome.  [...] Si un ARNm ne possède pas de codon stop (et ce quelquesoit la raison. cassure de l'ARNm, mutation du codon stop etc...) alors il existe un système de surveillance qui s'appelle la No-Stop Decay (NSD) chez les eucaryotes qui va provoquer le relargage du ribosome et la dégradation du peptide et de l'ARNm.  [...]

Mutation?!

2/ Cytosine méthylée qui subit une désamination, on aura une thymine, base tout a fait habituelle, et au lieu de réparer la thymine, on remplace le Guanine par une adenine, et la mutation se produit.  [...] J'ai une question encore concernant les mutations, et plus spécifiquement les mutations non-sens qui serait a l'origine d'un codon stop et par conséquent a une protéine tronquée, mais que se produirait il si la mutation au lieu de créer un codon stop, l'abolirait Obtiendrait on une protéine trop longue, sachant que le codon stop n'influe aucunement sur la transcription qui dépend de la séquence AAUAAA et donc l'ARNm sera le même et au niveau de la traduction qu'est ce qui va se passer si on a plus de signal d'arrêt.  [...]

[Biologie Cellulaire] Quel est l'avantage du noyau cellulaire d'une cellule eucaryote vis-à-vis d'une procaryote?

On peut donc dire que le noyau permet d'atteindre un degré de complexité et de diversité (par les régulations et les possibilités diverses de produits de gènes) qui n'est pas permis chez les procaryotes (malgré que ceux-ci usent d'autres moyens qui ont leur complexité propre ).  [...] Diversité dans le sens où un gène ne donnera pas qu'un seul produit si le pré-ARNm concerné subit un épissage alternatif. Cela veut dire que certains introns pourront être codant ou non. Ainsi par exemple à partir d'un gène on aura des ARNm ABCD, ACD, ABD, AD, par exemple.  [...]

génétique inverse

La génétique inverse consiste dans l'obtention in vitro de mutations spécifiques dans un gène et la réintroduction de celui-ci par transformation ou transfection dans un organisme, les effets obtenus sont ensuite analysés.  [...] C'est, a mon sens, le point central de la forward genetic, la capacite a generer des perte partielles de fonction. Un tres bel exemple est notre papier cite plus haut ou on screen une mutation dans une proteine qui fixe et inhibe les ARNm. Notre mutant est defectif uniquement pour l'ARNm de p53 et pas les autres.  [...]

[Biologie Moléculaire] Rétro transcription (S.O.S)

La rétro-transcription est juste une réaction enzymatique ayant pour substrat de l'ARN (ARNm) et en produit de l'ADN. En gros, avec la transcription tu passe d'un gène (ADN / ou plusieurs gènes) à un ARNm, et la rétro te permet de passer de l'ARNm à de l'ADN Ce nouvel ADN, appelé ADN complémentaire et noté ADNc et ne possède pas d'introns que l'on peut retrouver chez l'ADN des eucaryotes, c'est juste la séquence d'ARN transformée en ADN, c'est tout.  [...] Pour l'insertion, j'en suis pas sûr, mais il me semble que l'ADNc peut être décodé dans le cytoplasme, pas besoin qu'il aille s'insérer dans l'ADN génomique de la cellule hôte. Je ne sais plus sur quel virus, mais certains larguent du matériel génétique qui va permettre de reconnaitre un ADN ou ARN spécial, celui que transporte le virus.   [...]

Trangénèse > caroténoides > cossupression de gène ...

pour moi, la cosuppression d'un gène ou gene silencing est le fait d'éteindre l'expression d'un gène, c'est à dire d'entrainer l'arrêt de la production de la protéine qu'il code, en provoquant la destruction des ARNm de ce gène au fur et à mesure de leur production.  [...] En gros, si tu introduit par transgenèse une construction qui produit l'ARNm de ton gène-cible en grande quantité. Le système de régulation de l'expression du gène va détecter l'excès d'ARNm et détruire tous les ARNm de ce gène. Du coup, au lieu d'augmenter la quantité d'ARNm de ce gène et donc la quantité de protéines, on obtient l'effet inverse.  [...]

[Biochimie] Quelques questions à propos des ARN

première question. les anti_codon c'est l'arnt qui les porduits ou ils rentrent dans sa composition et chaque arnt a son anti codon, ce que je veux dire est est ce que l'arnt contient son anti codon puis il se fixe sur la partie arnm voulu ou l'arnt ne contient pas l'anti codon mais il le produit selon l'arnm c'est a dire il se fixe sur l'arnm et il prépare ou je sais pas comment dire son anti codon.  [...] Je ne suis pas d'accord pour définir les liaisons peptidiques par le terme de liaisons chimiques, par opposition à des liaisons physiques.   [...]

[Biologie Cellulaire] Traduction d'une protéine avec codon stop prématuré

le codon stop arretant la traduction avant la partie active de ton enzyme, il n'y a jamais aucune protéine entière de fabriquée.   [...] Tu es dans quel organisme car dans certains meme si tu es sur un cDNA, il peut y avoir une dégradation très forte de l'ARNm a cause de la mutation stop prématurée.  [...]