• Forum - Moyenne, Expression, Expériences

Heat map

Donc dans ce cas, un z-score positif (jaune) correspond à une surexpression du gène par rapport à la moyenne et l'inverse pour un z-score négatif.  [...] La moyenne que tu évoques correspond donc à la moyenne d'expression des gènes dans les 3 expériences, est-ce cela Cela expliquerait pourquoi (alors qu'il n'y a pas de changement d'expression des gènes) les cellules contrôles ont est un zscore négatif. Si oui, (encore) merci.  [...]

Vecteur de clonage, PCR et vecteur d'expression

Il peuve aussi utiliser la gst pour des experiences de double hybride histoire de confirmer l'expression.  [...] Donc conclusion. ça ne sert strictement à rien de faire du double hybride (très compliqué qui demande beaucoup de mise au point, etc...) pour vérifier un simple clonage (qui se vérifie très rapidement par séquençage). C'est un peu comme jouer du piano avec des gants de boxe.   [...]

[Biologie Moléculaire] Quantification relative en qPCR

Je mène en ce moment des expériences de qPCR visant à quantifier l'expression de quelques gènes par rapport à un gène de ménage suite à une transfection.  [...] J'ai après récupération des résultats, utilisé l'équation de Pfaffl pour établir les ratio d'expression relative. J'obtiens des valeurs inférieures à 1 si le gène est sous exprimé et supérieures à 1 dans le cas contraire.  [...]

Homochromie Variable

Par ailleurs, nous avons travaillé plus précisément sur la seiche en réalisant quelques expériences, nous voudrions savoir combien en moyenne une seiche peut imiter de substrats.  [...] Une même partition peut être interprétée différemment. Ce qui explique les légères différences entre deux jumeaux. Un autre exemple plus en rapport avec le sujet. Les mantes religieuses adultes sont soit vertes, beiges voire même brunes. Le pigment brun = pigment tétrapyrolique dérivant du pigment vert la biliverdine par oxydation (irradiation lumineuse).   [...]

calibration entre différents run en QPCR

Dans mon labo on fait une quantification relative à un house keeping gene. Pour cela, tu dois choisir arbitrairement un gène dont la variation d' expression est la plus faible possible (on travaille sur des échantillons d'oreille de souris et on a choisit bêta-actine).  [...] Grâce à cette quantification relative, tu te retrouves avec une variation minime de l' expression en fonction de la quantité d' ADN introduite et tu peux gérer des résultats de différentes expériences plus sereinement.  [...]

[Biologie Cellulaire] Receptor Binding Domain dans une experience de signalisation cellulaire

Une des expériences de l'article, visant à demontrer que l'expression de FT est induite directement depuis les feuilles, est basée sur l'utilisation du Receptor Binding Domain du glucocorticoide du rat... j'avoue avoir du mal à comprendre exactement comment cela fonctionne.  [...] En fait c'est simple quand on connait le truc, ils ont utilisé pour exprimer leur gène un promoteur inductible et non un promoteur constitutif (genre 35 S). Le promoteur est inductible à la dexaméthazone (DEX. corticoïde), donc pour induire l'expression de ton gène il faut activer le promoteur par du DEX.  [...]

[Divers] Perception de la douleur chez la carpe !

Elle n'a peut-être pas souffert, le trou dans ses lèvres n'est peut-être pas douloureux, mais si on pense à cette expérience et qu'on la transposait sur un être humain, même indolore, le cas de conscience mettrait un bémol à notre plaisir... Notre capacité d'empathie nous pousse en tout cas à nous demander si notre plaisir propre vaut bien le ressenti (quel qu'il soit) de l'animal.  [...] C'est vrai qu'on se permet, au niveau des drosophiles, des expériences qu'on ne ferait pas avec des vertébrés (par contre, au niveau des conditions d'élevage, je pense qu'elles sont en moyenne mieux bien mieux loties).  [...]

[Divers] Le role du coeur dans les comportements

Ben...je ne sais pas si cela est du au fait qu'on a comme l'impression que le dialogue interne(monologue) serait logé dans le coeur.Cependant le pharynx ou larynx(je doute un peu,corriger svp) source de la voie est prohe de là.   [...] Les modif du rythme cardiaque qui accompagnent nombre de nos expériences sociales, sont plutôt des conséquences de la commande du système nerveux et non l'inverse. Pour moi, si le coeur n'est pas étranger à l'expression de nos sentiments mais pas à leur naissance.  [...]

[Génétique] Stochasticité dans l'expression des gènes

C'est du déterminisme et c'est ce sur quoi on se repose lorsqu'on reproduit une manip en labo pour montrer que le résultat n'est pas artéfactuel. Ca veut bien dire que la stochasticité est incriminable aux moyens expérimentaux mais peu ou pas aux mécanismes biologiques, à l'expression génique dans ton cas.  [...] Ils sont corrélés à des expressions de gènes particulières. On peut d'ailleurs s'interroger sur l'interprétation des résultats expérimentaux qui ont contribué à accréditer cette théorie. Les expériences sur des hydres (Webster et.  [...]

[Biologie Cellulaire] probleme de transfection

Normalement je devais cotransfecter dans une lignée cellulaire un plasmide avec le promoteur qu'on étudie et qui contrôle l'Expression de la luciferase, et le plasmide controle codant pour la beta-Gal.  [...] Tu vas probablement avoir une haute mortalité cellulaire (plus que d'habitude en tout cas), donc un max de déchets cellulaire dans le milieu. Mais les survivantes devront être normal (ou stressé à la limite, ce qui est jamais bon dans des expériences d'expression de gène).  [...]