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[Biologie Moléculaire] Motif/Domaine des protéines

2/ Pourquoi certaines protéines sont écrites en majuscule entièrement (ex. APC, MPF - mitosis promoting factor -, etc.). J'ai une petite idée sur la question. est ce parce qu'il s'agit de complexe protéique Est ce parce que le nom de la protéine correspond aux initiales de quelque chose.  [...] En général les noms de protéines sont en majuscules, pour justement signifier l'anagramme. Parfois vous pouvez trouver des minuscules dans les noms, ce sont alors en général les secondes ou troisièmes lettres de mots dont les majuscules sont les initiales.  [...]

[Biochimie] retard sur gel

c'est une proteine recombinante pure, et je pense que la protéine est inactive in vitro vu sa structure (HTH, doigt de zinc) lui permet normalement de se fixer sur les oligo marqués. et la seule hypothese que je peux y mettre est que ma proteine est activée par des proteine chaperonnes.  [...] cette proteine comporte trois domaine. un domaine HT, un autre central presentant des homologies avec le domaine catalytique de la proteine cas9 (CRISPR/cas) et RuvC (resolvase) et un motif en C terminal doigt de zinc. j'ai fait des test on me focalisant sur la relation structure -fonction de cette protéine et tout les tests sont révélés négatifs.  [...]

Pdb 2hyy

La structure de la protéine a-t-elle été obtenue pour l'ensemble de la séquence ou pour un domaine particulier de la protéine.  [...] Enfin, il est demandé de cliquer en haut sur 3D View. On ouvre un fichier NGL et dans les options en sélectionnant assembly unit ou quelque chose du genre puis color by chain on remarque 4 chaines et on me demande si il s'agit de la même protéine pour les 4. Je réponds oui.  [...]

[Biologie Moléculaire] P53 et réparation de l'ADN

La protéine s'organise autour d'un domaine central hydrophobe (résidus 110 à 290), qui se lie à des séquences d'ADN spécifiques (contenant des répétitions du motif RRRCA/TA/TGYYY). Deux des cibles majeures de p53 sont p21waf-1, un inhibiteur de kinases cycline-dépendantes impliqué dans l'arrêt du cycle cellulaire en G1, et Bax-1, un inhibiteur de bcl-2 impliqué dans le contrôle de l'apoptose.  [...] Mis bout à bout, ces différents domaines correspondent au portrait classique d'un facteur de transcription oligomérique. Mais ce découpage topographique révèle que chaque domaine peut aussi servir de site d'accrochage pour des protéines cellulaires telles que mdm-2 (dans le domaine de transactivation) ou p53BP2 (p53-binding protein 2, dans le domaine de liaison à l'ADN).  [...]

[Biochimie] Recepteur Nucléaire

- Domaine DBD (DNA Binding Domain). Contient un motif à doigts de zinc permettant l'interaction avec un motif nucléique particulier appelé élément de réponse.  [...] - Domaine AF2 (Activation Function 2). il peut être vu comme un prolongement du LBD étant donné qu'il est formé par la douzième hélice alpha du LBD (hélice H12). La fixation d'un ligand induit un changement de conformation du LBD entrainant un positionnement particulier de l'hélice H12.  [...]

coiffe et queue polyA traduite ?

Quand au motif de Rbp1, il s'agit du domaine protéique CTD (en fait il s'agit du motif YSPTSPS répété 52x chez l'homme) qui va être sujet à différentes phosphorylations au cours de la transcription et qui va permettre le recrutement des différents acteurs de la transcription, on parle de CTD-code.  [...] 4-l'ARN polymérase agit au niveau de l'étape de transcription, elle a une affinité faible avec les séquences d'ADN mais quand elle reconnait un site promoteur + un complexe proteique(TFIID,boite TATA...) son affinité devient bcp plus forte et a transcription commence.  [...]

[Biochimie] protéine monomérique et une protéine polymérique

Bonjour, oui c'est la structure. une protéines polymérique est constituée d'un motif répété plusieurs fois. Une protéines dimèrique aura 2 fois ce motif, une protéine timérique aura 3 fois ce motif etc.  [...] mercii pour votre réponse et donc une protéine monomérique est un protéine qui est constitué d'un seul motif parce que trouvé cette définition.. Protéine monomérique. protéine présentant une structure tertiaire.  [...]

[Biochimie] dnase 1

Et je ne comprends pas non plus le lien entre les protéines avec un motif structural particulier comme leucine zipper ou le doigt de zinc et leur lien avec l'ADN.  [...] On a donc besoin d'un groupe de protéines qui peuvent se lier à cet ADN et pour leur conférer cette fonction de transcription, il faut leur donner une structure particulière qui le leur permet (toujours penser au lien structure =. fonction). Eh bien il se trouve que le motif en glissière à leucine a une affinité pour l'ADN, on va donc le rencontrer parmi les protéines de liaison à l'ADN.  [...]

[Biochimie] Questions Protéines / Enzymologie

2) Avec quel composé chimiques une protéine peut elle devenir fluorescente Est- ce bien le bromure d'éthidium Et quelles sont les protéines fluorescentes.  [...] En général le Bromure d'Ethidium est plutôt pour l'ADN (C'est un composé aromatique qui s'intercale entre les bases). Mais si la protéine a des domaines riches en aromatiques, il peut éventuellement s'y scotcher, surtout après une dénaturation qui expose les domaines aromatiques enfouies.  [...]

activité physiologique orientée

Je suis pas sur d'avoir tout compris à ta questoin, mais, à mon avis, la seule chose qu'on peut faire c'est un rapprochement par homologie avec des molécules ou motifs moléculaires ressemblant et dont on connait l'activité.  [...] M'enfin, c'a m'a l'air très hasardeux comme projection... mais bon, avec les protéines, si on reconnait tel motif, on peut déja connaitre si la protéine aura tendance a agir avec l'ADN ou pas (motif en doigt de zinc par exemple).  [...]