• Forum - Motif, ARN, ADN

[Biologie Moléculaire] "Vectorologie" : le cPPT ?

A retroviral RNA genome contains short stretches of purines, called polypurine tracts (PPTs), near the 32-end. These PPTs function as RNA primers for plus-strand DNA synthesis during reverse transcription. Complex retroviruses (including HIV-1) contain a second, more centrally located PPT that provides a second site for initiation of DNA synthesis.   [...] En gros et pour faire simple ce motif PPT sert pendant la RT de ton ARN en ADN, c'est un motif qui reste après action de la RNaseH et qui sert ainsi d'amorce pour la RT pour l'initiation de synthèse du 2ème brin d'ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] Télomèrase et télomère

la télomérase est une ribonucléoprotéine, elle comporte donc une matrice ARN qui lui permet d'ajouter le motif (TTAGGG)n a la fin du brin d'ADN dans le sens 5'-3'.  [...] L'ARN de la télomérase (CCCUAA) s'hybride avec la séquence répété télomérique TTAGGG à l'exrémité 3' du brin anti-sens. Là, la télomérase commence la synthèse des télomères en utilisant son ARN comme matrice et l'extrémité 3' du brin d'ADN comme amorce. La télomérase synthétise alors un ADN simple brin.  [...]

[Biologie Moléculaire] Utilisation AAV pour CRISPR/Cas9

Nous devrons ainsi dans un premier temps. (i) cloner l'ADN codant pour l'exon 14 JM de c-MET, qui permet l'ubiquitination par Cbl. (ii) faire synthétiser un ARN guide composé d'une séquence complémentaire du gène ciblé (crRNA) d'environ 20 nucléotides en 5', d'une séquence Protospacer Adjacent Motif (PAM) de trois bases.  [...] NGG suivi en 3' du transactivating crRNA se liant à la nucléase Cas9 (tracrRNA). (iii) introduire ce matériel génétique dans un plasmide. (iv) transfecter ce plasmide dans des cellules en culture permettant la réplication des virus adéno-associés défectifs (293AAV Cell Line).   [...]

[Immunologie] Interferon

Les meilleurs inducteurs sont des virus qui se multiplient lentement et ne perturbent pas la synthèse protéique de la cellule hôte que ce soit des virus à ADN ou à ARN.  [...] Bonsoir, je suis pas un professionnel mais la voie RIG1/MDA5 cytoplasmique n'est pas la seule a pouvoir induire une réponse à l'IFN. Il y a aussi TLR3,7,8 et 9 au niveau de l'endosome. Le TLR9 reconnait l'ADN viral (motif CpG il me semble). Peut etre que les virus qui vont dans le noyau (donc pas les virus à ARN+) y sont protégé des PRR.  [...]

[Biologie Moléculaire] enzyme de restriction pourquoi elle ne clive pas tout les ADNs ?

j'ai une question pourquoi les enzymes de restrictions ne clive pas tout les ADNs par exemple HindIII ne clive pas l'ADN d'une cellule du foie humaine alors que pour l'ADN de phage lambda elle le clive en libérant plusieurs fragments comment ce la ce fait il.  [...] _ Ou alors, le motif est bien là mais il est modifié chimiquement et n'est donc pas accessible à l'enzyme. Par exemple l'enzyme ECORI vient de la bactérie E. coli et coupe de cette façon. G/AATTC. Ce motif existe pourtant dans l'ADN de cette bactérie. Pour éviter qu'elle ne coupe son propre ADN, les motifs GAATTC de E.  [...]

[Biologie Moléculaire] Polymorphisme et RFLP

Dans ce cas ce qu'il faut voir c'est que l'enzyme de restriction coupe l'ADN en un certain endroit, qui contient un certain motif. Si la longueur du fragment est différente c'est que le motif n'est pas au même endroit, ou encore que le motif attendu à l'endroit usuel n'existe plus, donc c'est qu'il y a une mutation quelque-part dans le motif.  [...] Donc c'est bien cela, le motif présent dans le fragment d'ADN peut être variable (polymorphe) chez un individu x et y. Merci je commence à intégrer la notion.  [...]

[Biologie Moléculaire] Réplication des télomères

- Absence de matrice exogène. L'ARN de la télomérase sert de matrice (ARN guide). Motif central inverse complémentaire du minisatellite télomérique.  [...] . Sous unité protéique. TERT (Telomerase reverse transcriptase) C'est en fait une enzyme à activité transcriptase inverse, un ADN polymérase ARN-dépendante qui permet la synthèse de la séquence télomérique en utilisant l'autre sous-unité ARN comme matrice.  [...]

[Biochimie] dnase 1

Et je ne comprends pas non plus le lien entre les protéines avec un motif structural particulier comme leucine zipper ou le doigt de zinc et leur lien avec l'ADN.  [...] On a donc besoin d'un groupe de protéines qui peuvent se lier à cet ADN et pour leur conférer cette fonction de transcription, il faut leur donner une structure particulière qui le leur permet (toujours penser au lien structure =. fonction). Eh bien il se trouve que le motif en glissière à leucine a une affinité pour l'ADN, on va donc le rencontrer parmi les protéines de liaison à l'ADN.  [...]

[Biochimie] Leucine zipper

Les arginines et lysines à proximité constituent une région basique proche du motif leucine zipper et permettent de favoriser la liaison à l'ADN.  [...] C'est un motif 3D riche en leucines et fréquemment retrouvé au niveau des facteurs de transcription chez les eucaryotes et les procaryotes. Ces motifs sont impliqués dans la régulation de l'expression des gènes en interagissant avec le grand sillon de l'ADN.  [...]

activité physiologique orientée

Je suis pas sur d'avoir tout compris à ta questoin, mais, à mon avis, la seule chose qu'on peut faire c'est un rapprochement par homologie avec des molécules ou motifs moléculaires ressemblant et dont on connait l'activité.  [...] M'enfin, c'a m'a l'air très hasardeux comme projection... mais bon, avec les protéines, si on reconnait tel motif, on peut déja connaitre si la protéine aura tendance a agir avec l'ADN ou pas (motif en doigt de zinc par exemple).  [...]