• Forum - Modèle, Mathématique, Liaison, Molécule

[Biologie Moléculaire] Le "Scatchard" et le "Binding in vitro" : étude comparative

Le Binding (= étude de liaison), c'est le fait d'étudier l'interaction entre une molécule et un récepteur, l' affinité en quelque sorte.  [...] Le Scatchard est un modèle mathématique modélisant la liaison d'une molécule sur son récepteur. Le binding est la méthode expérimentale qui va permettre de définir in vitro les paramètres de liaison de la molécule sur son récepteur. Le Scatchard est donc une représentation possible (dans le sens où on a le choix entre plusieurs représentations) des données d'une expérience de binding.  [...]

[Microbiologie] Croissance bactérienne

Je voudrais savoir si vous connaissez un modèle mathématique de la croissance bactérienne plus avancé que les modèle de Malthus (croissance exponentielle) et le modèle de logistique continue (par la loi de Verhulst).  [...] Ainsi je suis certain qu'en connaissant mieux les différents paramètres propres à telle ou telle espèce bactérienne, il est possible de faire des simulations très fines. Cependant, deux problèmes majeurs persisteront à mon avis. déjà ces simulations seront surtout utilisées pour la croissance bactérienne in vitro, ce qui est limité, et ensuite le modèle mathématique sous-jacent sera toujours aussi difficile à faire ressortir.  [...]

fréquence d'allèle dans les générations..

Pour vous montrer le devenir d'un allèle muté dans la population il utilise un modèle mathématique (il faut pas avoir peur du mot ) qui permet de regarder la fréquence de l'allèle muté dans la population si sa valeur sélective est moins bonne que celle de l'allèle normal.  [...] Dans le cas, où la valeur sélective de l'hétérozygote est meilleure que celle de l'homozygote normale, on parle de superdominance. (c'est l'exemple du Paludisme et de la malaria si tu en as entendu parlé). Le gène va perdurer dans la population du fait que les hétéorygotes ont plus de chance de survivre que les normaux.   [...]

Dérive génétique

Si on prend une population d'êtres vivants (ce qui peut être des bactéries), elle définit un ensemble de variations génétiques. Au cours du temps certains vont se reproduire (par duplication par exemple), certains vont mourir. l'ensemble des variations génétiques peut se modifier, de nouvelles apparaître, les proportion entre variantes changer, et en particulier certaines variations peuvent disparaître, tout cela pour des raisons qu'on ne peut pas attribuer à une sélection ( par hasard ). On appelle cela la dérive génétique neutre.   [...] je trouve qu'on comprend mieux les choses à partir d'un modèle mathématique. Ici, le modèle le plus simple est le modèle de Fisher-Wright. Ce modèle suppose une population d'allèles de taille constante et dont chaque génération est un tirage aléatoire parmi les allèles de la génération précédente.  [...]

[Evolution] Phylogénie: modèle de substitution: Jukes-Cantor, Kimura 2P

Je voulais savoir si quelqu'un pourrait m'expliquer la formule mathématique d = -3/4 ln(1-4/3 D) donnant la distance corrigée par rapport à la distance observée dans le modèle de substitution de Jukes-Cantor (modèle où pA=pC=pG=pT, et où la probabilité de transversion est égale à la probabilité de transition).  [...] Et dans la foulée, vous pouvez m'expliquer la distance corrigée avec le modèle Kimura à 2 paramètres d = -1/2 ln(1-2P-Q) + 1/4 ln(1-2Q).  [...]

ELISA : méthode des ajouts dosés

je sais que beaucoup de sujets ont été crées sous cet intitulé, mais je ne trouve pa de réponse à ma question. Si par exemple le signal diminu avec la concentration est-il possible de réaliser des ajouts dosés.   [...] Il me semble qu'en ELISA l'inhibition des réponses n'est pas toujours reliées linéairement aux concentrations d'analyte mais nécessitent une transformation pour être ajustées. La pertinece d'utilisation d'une méthode d'ajouts dosés serait alors plus que discutable.   [...]

[Biologie Cellulaire] modélisation mathématique du clonage

[Biologie Cellulaire] modélisation mathématique du clonage.  [...] Est ce que il y a un modéle mathématique (systeme dynamique, EDP) qui explique le mécanisme de clonage en biologie cellulaire.  [...]

fistfuck et sida?

Selon une biomathématicienne de l'Inserm, un modèle n'est qu'une approximation et une abstraction de la réalité, et le modèle mathématique découle directement des hypothèses posées (d'où l'importance de poser les bonnes hypothèses). Les principales modélisations concernent les populations d'Afrique subsaharienne où la contamination atteint des seuils très élevés et où 80 % des personnes infectées ignorent leur statut (contre 21 % aux USA).  [...] Le concept qui consiste à utiliser les traitements antirétroviraux comme moyen de prévention n'est pas nouveau5. En 2002, Veslasco-Hernandez et coll. ont montré, en utilisant également des modèles mathématiques similaires, que l'utilisation des antirétroviraux pourrait conduire à l'éradication du VIH dans la communauté homosexuelle de San Francisco6.  [...]

distribution in vivo spatiale de la dengue

Bonjour, je suis actuellement en stage, étudiant en mathématique appliqués, et je travaille sur la formulation d'un modèle d'interaction entre le système immunitaire et la dengue.  [...] bonjour, pour autant que je sache les virus de la dengue parasitent plusieurs types de cellules humaines et notamment les lymphocytes et les macrophages. Du coup la circulation sanguine les envoie dans toutes les parties du corps, et on retrouve bien sûr du virus en grandes quantités dans le foie, la rate et les ganglions lymphatiques.   [...]

mutations humaines.

On peut en parler informellement, mais pour comprendre les choses complètement il faut se référer à un modèle mathématique. Je te conseille de te procurer le petit livre de Hartl sur la génétique des populations.  [...] Hartl expose les bases de la génétique des populations, mais il y a un livre qui répond probablement mieux à tes interrogations, c'est Molecular Evolution. a phylogenic approach de Page & Holmes.  [...]