• Forum - Migration, Protéines, En direct

Marqueur de poids moléculaire protéique coloré

Je cherche à faire moi-même mon marqueur de poids moléculaire pour des raisons d'économie. Connaitriez-vous un moyen pour faire un marqueur pré-coloré soi-même Grâce à ces marqueurs, je peux suivre la migration des protéines en direct.  [...] Disons que nous avons accès à des stocks de protéines pures à peu près gratuitement. D'après la marque utilisée, 500ùl de marqueur pré-coloré monte déjà à 95¬...donc oui ça pourrait être moins cher.  [...]

[Biologie Moléculaire] Dosage des ARN à l'orcinol

Pourquoi le ration purine/pyrimidine serait il de 1 dans les ARN Ceci ne vaut que pour l'ADN double brin. Il faudrait retrouver le tableau avec les %CG en fonction des organismes (je l'ai pas retrouvé en cherchouillant vite fait sur le net). Maintenant il faut aussi tenir compte du fait que le dosage spectro n'est pas une méthode de dosage absolument précise avec les appareils classiques.   [...] Donc, j'ai une remarque à faire. ta gamme étalon, si tu l'a faite avec l'ARN commerciale de levure, il n'y a pas de différence dans le rapprot C G, ton absorbance est proportionnelle à ta concentration. Il y aurait un soucis seulement si l'ARN de ta gamme vient d'une espèce différente de la levure dont tu doses l'ARN.   [...]

[Biochimie] migration sds page

Tiens, tiens, ça me rappelle tout à fait les problèmes dont j'ai fait face très récemment. J'avais également des migrations très moches avec mes protéines, alors que les marqueurs migraient parfaitement. J'ai identifié mon problème. un lot d'acétone pourri (provenant d'une bouteille en plastique et non en verre) et la resuspension des protéines dans de l'urée 9M.  [...] je viens de recommencer un gel en diminuant la concentration en glycérol, en prenant de nouveaux produits (acrylamide, tampons avec le bon pH, b-mercaptoéthanol...). La migration est un peu meilleur mais mes protéines ne dépassent toujours pas la moitié de mon gel de séparation alors que mes marqueurs et mon front de migration sont OK.  [...]

[Biologie Cellulaire] Qui à déjà utilisé le système SNAP i.d. de Millipore pour ses Western Blot?

Nous l'avons au laboratoire. Et c'est tout aussi miraculeux que cela en à l'air. En une journée tout est fini. Migration, transfert, bloc, anticorps 1er, anticorps 2e, révélation, etc etc... Le résultat sur la table direct.  [...] Je ne le ferais peut etre pas pour un western dans une optique de quantification, ou avec des Ac dont le titre est tres faible ou des proteines tres faiblements produite.  [...]

système de double hybride

Dans les autres cas, Gal4BD et Gal4AD ont été modifié en fusionnant deux protéines différentes. Ces deux protéines sont des théoriquement capable d'interagir entre elles. Elle vont donc rapprocher les Gal4BD et Gal4AD ce qui va permettre l'activation du promoteur et le début de la transcription du gène.  [...] On a deux protéines d'intérêt humaine, PCR-1 (appat) et AST-1 (proie) que l'on étudie au laboratoire. On a leur séquence ADN (ADNc) sur un plasmide. Et on pense qu'il y a interaction de ces deux protéines dans la cellule humaine (colocalisation). On veut donc vérifier s'il y a réellement une interaction direct entre ces deux protéines, et pour cela on utilise les système double hybride.  [...]

[Divers] La Vie sous une forme différente, dans des conditions différentes?

En date du 3 décembre 2012, on connaissait la séquence d'acides aminés de 18877226 protéines différentes (voir les données Uniprot de la PDB). De ces ~19 millions de protéines, seules 538585 ont été vérifiées expérimentalement (voir base de données UniProtKB ).  [...] En ce qui concerne les origines de la vie, je crois qu'une grande source potentielle de progrès sera l'étude de l'évolution des protéines et plus particulièrement des métalloenzymes, ainsi que la détermination de ce qu'on qualifie parfois de fossiles moléculaires.  [...]

[Biologie Moléculaire] Combien d'enzymes différentes dans le vivant ?

La structure tertiaire correspond à la position précise de chacun de ces atomes en trois dimensions. Il existe également une structure quaternaire, qui constitue une description de l'arrangement de plusieurs protéines en complexes protéiques.  [...] Je pense qu'on connait l'essentiel des protéines les plus anciennes dans le cas où celles-ci elles existent toujours. Par contre, il est tout à fait possible que d'autres aient disparues. Des enzymes qui utiliseraient un ion dont la concentration était élevée il y a 3,x milliards d'années et dont la concentration est aujourd'hui faible pourraient avoir été remplacées par des enzymes se passant de cet élément.  [...]

[Biologie Cellulaire] Protéines ancrées et membranaires

qui sont reliées à la membrane par liaison avec un lipide membranaire, ce sont des protéines dites ancrées, elles sont elles aussi intrinsèques.  [...] qui sont reliées à la membrane par interaction avec une protéine transmembranaire, ces protéines non pas de contact direct avec la membrane, elles sont dites extrinsèques.  [...]

[Biologie Cellulaire] Lame basale

La matrice extracellulaire regroupe les composants extracellulaires des tissus (dont les tissus conjonctifs, qui sont riches en cette matrice ). fibres (collagènes/élastiques) et substance fondmentale (eau + protéines dissoutes. GAG, protéines d'adhésion, PG...).  [...] Les Integrines (je pense qu'on eut dire que ce sont elles le lient direct entre le tissu épithéliale et la lame basale ) Lient les laminines (proteïnes fibreuses en forme de croix).  [...]

[Génétique] la langue en gouttière

Pourrais-tu nous en dire un peu plus. Connait-on les acteurs moléculaires de cette flexibilité de la langue La ou les protéines élastogènes en cause Il y a t-il un lien génétique direct.  [...] Il y a cependant un certain nombre de caractère qui sont codés par plusieurs gènes car dépendant de plusieurs protéines (tout est une question d'échelle je te l'accorde), certaines protéines sont le fruit de la traduction d'ARNs distincts issu d'un même ARNm codé par un seul gène, les modificaton épigénétiques, les erreurs de réplication/transcription qui peuvent conduire à des caractères accidentels, etc.  [...]