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[Biochimie] Méthode de Sanger

J'ai quelques questions concernant cette méthode de séquençage des acides nucléiques. En effet, j'ai compris que l'on prenait 4 tubes.  [...] Et après sur le gel de polyacrylamide, si l'on voit un trait vert par exemple que le marqueur vert était associé à la ddCTP, cela veut dire que sur le brin à séquencer la base était une guanine.  [...]

[Biochimie] génie génétique

Bonjour, j'ai un peu de mal à comprendre le séquençage des acides nucléiques. methode de sanger.j'aimerai bien avoir une petite explication.merci.  [...] Un ddNTP est un didésoxynucléotide, c'est à dire qu'il n'a plus de groupement OH en 2' et 3', donc, lorsqu'il est incorporé dans la séquence la synthèse s'arrête.  [...]

séquençage des protéines

j'aimerai savoir dans le détail pourquoi la méthode de Sanger, qui concerne le séquençage des acides aminés, ne peut pas être utilisée de manière récurrente. merci pour la réponse.  [...] Bon, en fait la méthode d'Edman, (qui est détaillée sur ce lien), a l'avantage d'être très efficace sur des peptides, mais sur une chaine polypeptidique d'une protéine, plus la séquence est longue, plus vite tu atteints le phénomène de bruit de fond qui rend la lecture des résultats nulle sur le chromatogramme.  [...]

Acides Nucléiques

Lorsqu'on fait un séquençage d'ADN, avec la méthode de Sanger, on reconstitue le génome ensuite par electrophorèse. Les acides nucléiques ont donc des charges différentes (car on se réfère à la taille de tous les fragments séquences et leurs charges ).  [...] Salut. Au moment de la migration, la charge est identique pour chaque fragment d'ADN car la préparation de ton ADN pour l electrophorese sert justement a masquer la charge réel de tes fragments afin que ces derniers aient tous la même charge fictive et migrent uniquement selon leur poid moléculaire.   [...]

Identification des acides aminés d'une plante

Dans un cadre plus simple, ou sans outils, de quelles infos disposes-tu Si tu as une séquence d'ARN, tu peux remonter aux nucléotides.  [...] Je te dirais simplement que tu peux faire un type de séquençage des acides aminés selon la Méthode de Sanger, donc comme les séquenceurs d'acides aminés, mais à la main... Pour cela il te faut. De la ninhydrine (encore), une colonne chromatographique (type échangeuse d'ions) et des échantillons des 20 acides aminés naturelle (et protéogénique) PUR.  [...]

[Biochimie] Séquençage par méthode de Sanger à partir d'une PCR

Alors, j'ai déjà regardé à travers les autres discussions à propos de la méthode de Sanger mais la réponse à mon problème (très spécifique) ne s'y trouve malheureusement pas.  [...] J'ai un cours sur le séquençage de l'ADN, et on nous y décrit notamment la méthode de Sanger. Seulement un élément du cours, non expliqué, me fait bloquer.  [...]

[Biochimie] Diverse question

Des méthodes de séquençage d'acide aminé, laquelle est la plus utilisée, et pourquoi j'ai mis que c'est la méthode d'edman car la protéine reste intact.  [...] pour la question sur les methode de dosage chimique j'ai trouver que c'est le nitrate d'argent avec une sensibilité de 5 à 10 ng.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquençage et métabarcoding

Ce qui est certain, c'est qu'à l'heure actuelle, le pyro séquençage est la méthode de séquençage qui produit les reads les plus longs (même si on ne peut pas parler de reads à proprement parler, puisqu'on ne séquence qu'un seul produit de PCR par cette méthode).  [...] Bref, je comprends pas trop où va ton expérience. Soit tu as une information très précise à obtenir, sur un nombre limité de séquences, et tu fais du pyro-séquençage. Soit tu cherches à avoir une vision plus globale de ton génome et tu passes par du séquençage à haut débit (et après le choix de la méthode de séquençage à haut débit dépend des informations recherchées).  [...]

[Génétique] Sequençage d'ADN

Ensuite, le fluorophore est clivé et une nouvelle base est ajoutée, etc... jusqu'à avoir synthétisé tout le brin complémentaire de chaque fragment. Pour chaque paquet, tu auras une séquence de couleur. bleu-vert-jaune-jaune-rouge..., qui sera transformée en séquence nucléotidique GCTTA.  [...] La deuxième phase, est la phase qui permet de séquencer les fragments. Certes l'ADN y est aussi amplifié, mais c'est n'est pas le but. Au début de cette phase, on ajoute seulement un type de primers, des dNTP et la polymérase. Les dNTP ont tous un fluorofore sur leur sucre, qui empêche l'ajout d'un autre nucléotide lors de la réplication.  [...]

[Biochimie] Est-il possible de réaliser le séquençage des acides aminés impliqués dans des interactions

Je voulais savoir si il était possible de séquencer les acides aminés de la protéine qui peuvent interagir avec l'héparine.  [...] On pourrait récupérer cette fraction, la caractériser par spectro de masse, et, connaissant la séquence de la protéine et donc les sites de coupure enzymatiques, déterminer la séquence du fragment en question.  [...]