• Forum - Manipulations, Enzymes, Protéines

Northern blot

Ces trainés peuvent être dues à de mauvaises manipulations au cours desquelles des enzymes protéolytiques auraient pu dégrader les protéines. Y aurait-il cependant une autre explications à ces trainés.  [...] Bon je crois qu'il y a un truc qui t'a échappé lorsque tu as écrit ton message. c'est un Northern donc pas question de parler de protéines.  [...]

[biochimie] activité spécifique d'un enzyme selon la concentration

Si tu connais l'activité spécifique d'une enzyme particulière. Tu connais donc 100% de la valeur. Or généralement, l'échantillon n'est jamais pure. Tu comprends donc qu'on peut s'en servir pour mesurer la purification d'un enchantillon d'une enzyme donnée.  [...] Si tu as 50% de l'activité spécifique tu as donc 50% des enzymes qui t'intéresse dans l'échantillon et 50% d'enzymes que tu aimerais t'en débarassser. Le but étant par exemple de mesurer l'indice de purification d'une technique ou tout simplement vérifier qu'on a un échantillon de protéines qui est le plus pur possible pour divers manipulations,études.  [...]

[Génétique] Transcription inverse

- La RNAse OUT (nom commercial) est un inhibiteur des RNases, ces enzymes qui dégradent les ARN et ne sont donc pas souhaitables dans ces manipulations.  [...] Le tampon RT, comme son nom l'indique, est là pour tamponer la solution au pH adapté à l'enzyme. Il contient aussi des sels, nécessaires à son activité.  [...]

[Biologie Cellulaire] Cycle cellulaire

Si c'est ça, alors il existe plusieurs façon d'avoir accés au cycle cellulaire et àa son activité dans une cellule. Tu peux analyser l'expression de certaines cyclines et des cdk, en faisant un Q-PCR par exemple. Tu pourrais analyser l'expression de certaines protéines connues pour leur implication à différentes étape du cycle (lors de la réparation par exemple). ATM, ATR, Rad51.  [...] Au niveau des manipulations tu peux réaliser un western blot à partir de tes différentes cellules lysées ciblant certaines protéines spécifiques du cycle cellulaire.  [...]

Petite énigme à vous soumettre...

Bon je détaille un peu plus mon idée de départ Je pense en effet donc à un criblage haut débit, avec par exemple un criblage in-silicio suivie d'une étude plus poussée des molécules retenues par RMN. En effet, la RMN est une très bonne méthode pour mettre en évidence des intéractions protéines-ligand, et pourrait donc permettre d'obtenir des données fort intéressantes.  [...] .. 20.000 manipulations Avec assez de cultures cellulaires pour chaque expérience, extraction des seconds messagers, révélation des protéines... Est-ce bien réalisable.  [...]

4 °c ???

je pense que la raison principale des manipulations de biochimie à 4°C est qu'à cette température les réactions enzymatiques sont inhibées (par exemple les enzymes cataboliques). ça permet donc de figer les réactions biologiques.  [...] je pense que pour des réactions biochimiques dépendantes pour la majeure partie d'entre elles (peut-être toutes) d'enzymes le facteur principal est la température, l'influence de la densité doit être très faible voire nulle.  [...]

[Microbiologie] Quantité de protéines/biomasse

Après des manipulations sur une souche de Pseudomonas nous avons pu établir des courbes nous donnant la quantité de protéines présente dans différents échantillons.  [...] Il me semble que la souche a poussé à un pH de 2 alors que j'ai lu que Pseudomonas est alcalinophile donc j'aimerai pouvoir vérifier que la manipulation est correcte.  [...]

[Biotechnologie] spectrométrie de masse type MALDI en tandem

quelles sont les applications de la spectrométrie de masse type MALDI en tandem ( a part son application en criminologie ou toxicologie, pour la détection de la glycosylation, le dépistage néonatal, et la protéomique) existe il autre domaines d'application.   [...] Etant donné que la préparation pré-analyse réclame un peu plus de manipulations, on la réserve surtout à l'étude de grosses molécules telles que les protéines.  [...]

[Biologie Moléculaire] Gamme étalon dilution

apres le calcule des concentrations de proteines inconnus a l'aide du graphe de la gamme il y a une question sur le calcul des concentrations reelles des proteines en tenant compte des dilutions.  [...] Alors si ti connais ta concentration final en protéines, tu peux facilement revenir à la concentration initiale en tenant compte des différentes manipulations que tu as fait pour y parvenir.  [...]

[Divers] Différence entre Biochimie et Biologie moléculaire

Si je dis que la phylogénétique étudie les rapports génétiques entre les organismes (unicellulaires ou multicellulaires) tandis que la phylogénie moléculaire étudient les liens de parentés (atomiques, moléculaires, macromoléculaires, etc...) entre les molécules biologiques (protéines, enzymes, cofacteurs, etc...), ça te paraît correct.  [...] Biologie moléculaire. Au sens strict, branche de la biologie qui vise à expliquer les propriétés biologiques des protéines et des acides nucléiques par leur structure moléculaire. Dans le langage courant, le terme se rapporte aussi à toute forme de manipulations de gênes (ex.  [...]