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[Biochimie] Charge de la Lysine

Bonjour, dans mon cour il est dit que la Lysine possède une fonction basique et que le Pka de sa chaine latérale est égal à 10,5. Or quelques pages plus loin je retrouve la formule développée de la lysine dans une protéine à pH=12 et la charge de sa chaine latérale est nulle.  [...] La lysine possède sur sa chaine latérale une fonction amine. Le couple acido-basique associé à cette fonction est R-NH 3 + /R-NH 2.  [...]

Glycation

Au niveau des réactions chimiques, simplement il y a réaction entre un sucre réducteur ou un aldéhyde et une fonction amine libre d'une chaine peptidique (principalement sur la fonction NH2 N - terminale ou sur une lysine).  [...] Les protéines touchées ne sont plus fonctionnelles et s'entassent. De plus, j'avais aussi vu que certains AGE avaient la capacité de réagir avec certains récepteurs (/shame je ne sais plus lesquels...) augmentant ainsi les phénomènes d'oxydation (ce qu'il n'est pas très très bien ).  [...]

[Biologie Cellulaire] immunofluorescence ???

Typiquement, on utilise un fluorophore portant une fonction réactive (maleimide, isocyanate...), capable de réagir facilement avec la chaine latérale de certains acides aminés de l'anticorps (ex. lysine, cysteine).  [...] L'exemple le plus courant est le marquage à la fluoresceine ( http.//fr.wikipedia.org/wiki/Fluoresc%C3%A9ine ). On fait réagir l'anticorps avec de de la FITC (fluoresceine isocyanate http.//fr.wikipedia.org/wiki/FITC ). La FITC reagit avec les lysines en formant une liaison thiouree covalente.  [...]

Tout trans rétinal et optogénétique

Une molécule d'eau est éliminée lors de l'association. le O de la fonction aldéhyde du tout trans rétinal + les 2 H de la fonction NH3+ de la lysine.  [...] Ce qui donne bien du tout trans 15 anti rétinal ensuite (le H de la fonction aldéhyde porté par le carbone 15, change de côté lors de l'association).  [...]

Liaison entre acide aminé

Les liaisons ionique concerne les AA ionisable, dans une forme chargée. Les résidus ionisable sont ceux ayant un pKa pour leur side chain.  [...] A noter que le nom de l'acide aminé change lors de cette réduction. deux cystéines liées sont en fait des cystines selon la nomenclature.   [...]

[Biochimie] Modifications post traductionnelles et électrophorèse !

L'acétylation est l'ajout d'un groupement CH 3 CO- au niveau des chaînes latérales de lysines ou de l'extrémité N-terminale d'une protéine. La charge positive de l'amine modifiée va alors disparaître donc je te laisse conclure.  [...] Bizarrement cette explication me convient mieux, mais je la trouve encore un peu approximative... Le phosphate, malgré sa taille imposante doit pouvoir être comparable à une chaine latérale encombrante comme la lysine par exemple. Dans ce cas, la migration électrophorétique tiendrait compte aussi de la composition en acide aminé et, pour un même poids moléculaire, une protéine ayant une composition forte en acide aminés à chaîne latérale encombrante migrerait moins vite qu'une protéine à composition forte en acides aminés à chaine latérale peu encombrante.  [...]

biologie structurale acide aminé

La chaîne latérale d'un acide aminé est polaire lorsqu'elle porte une charge, c'est-à-dire lorsqu'elle porte un groupement ionisable. SH, NH 2, OH, COOH. Par exemple la lysine, dont la chaîne latérale est R= - CH 2 - CH 2 - CH 2 - CH 2 - NH 2. est polaire grâce à NH 2, qui peut devenir NH 3 +.  [...] A l'inverse, la valine par exemple, dont la chaîne latérale est R= - CH(CH 3 ) 2, est apolaire.  [...]

Chromatographie échageuse d'ions

Il est indiqué que le pH est trés basique, par conséquent les acides aminés chargées (Lysine et arginine) seront sous forme déprotonée et puisqu'ils contiennent respectivement une fonction amine et guanidine, on obtiendra NH2. Or dans la correction il est noté que ce peptide est retenu par une résine échangeuse d'anions.  [...] Et ne suis pas sûre d'avoir compris le principe. un peptide chargé positivement est bien retenu par une résine anionique ou par une colonne échangeuse de cations.   [...]

protéine et azote

en effet, certains acides aminés comportent des fonctions amines (-NH2) tel que la lysine, arginine, glutamine, etc.  [...] Il me semble aussi que certains sucres modifiés possèdent des azotes, le eul me venant à l'esprit étant la N-acétyl-glucosamine. Je ne me souviens plus de son rôle par contre.   [...]

Chromatographie échangeuse d'ions

Donc si je met en graphique l'absorbance de chacun des tubes en fonction du numéro du tube j'obtiens une sorte de chromatogramme. De là je dois pouvoir tirer les proportions en faisant un histogramme mais sur le coup je ne vois pas comment procéder.  [...] Merci pour votre réponse. J'ai encore une question nous avons séparer la lysine et l'acide glutamique et introduis dans les différents tubes de la ninhydrine pour justement avoir ce graph de l'absorbance. Le fait est que la ninhydrine réagit avec les deux fonctions amine primaire de la lysine et donc je vais former deux fois plus de pigment violet ( 2 fois plus de chromophore si je peux dire ça comme ça) est-ce que je ne devrais pas en tenir compte dans le rapport d'air de ces pics (un facteur 2).  [...]