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[Microbiologie] comment produire une toxine bactérienne sans bactérie?

existe t il un logiciel freeware de bio-informatique qui présente la structure de n'importe quel protéine il suffirait d'entrer le code amine (je veux dire le code en acide aminé de la protéine) et qui marche sous windows, je disais il suffirait d'entrer le code amine de la protéine pour qu'il la structure en 3d et même nous donne le code génétique correspondant, en plus chercherais dans les base de données mondiales des gènes ou des références qui possède le même code génétique si c'est pas encore fait ça, je donne gratuitement une idée à un bio-informaticien pour créer ce logiciel.  [...] C'est très généreux de donner votre idée gratuitement, mais ne vous en faites pas, il existe une flopée de logiciels permettant de visualiser la structure 3D des protéines. Je vous encourage à aller faire un tour sur la Protein Data Bank. Cette base de données est la plus complète en matière de structure de protéines.  [...]

Identification d'une protéine

J'ai une séquence d'ADN et je dois trouver quelle protéine elle code. J'ai donc traduit cette séquence en AA grace à un logiciel, puis j'ai cherché des homologies avec d'autres protéines sur cette base de données. http.//www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST.  [...] si tout ce passe bien lorsque tu blastes une proteine contre la base de données, le meilleur resultat qu'il te sort est la proteine elle meme (normal). C'est donc les resultats suivant qui te renseignent sur l'identité possible de cette proteine.  [...]

[Biologie Cellulaire] coloration des peau, yeux et cheveux.

. Mais je peux tenter de vous convaincre en vous disant qu'il y a une similitude entre le code génétique et le code informatique. Il y a des bugs informatiques et il y a des bugs génétiques. De même que la présence d'un code dans un logiciel ne signifie pas qu'il sera forcément exécuté.  [...] il suffirait d'expliquer légèrement, tel que Les gènes fabriquent des protéines diverses, et certaines d'entre elles (les enzymes) vont réagir avec d'autres molécules et les modifier, les modification de ces molécules vont les changer en une nouvelle molécule qui donne la couleur aux cheveux, Et on reste bien avec quelque chose de vulgarisé, sans entrer dans des détails complexes si ce n'est pas ce qu'il veut.  [...]

Comment coder un rétro Virus?, Ou trouver de l'arn, creation d'un rétro virus et le coder HELP !

Si l'on veut être plus précis. Des scientifiques ont crée des chèvres génétiquement modifiées qui produisent dans leur lait, des protéines impliquées dans le formation de la soie. Après récupération du lait, les protéines peuvent être extraites industriellement par des techniques chromatographiques.  [...] Après séchage des protéines isolées et redissolution dans un solvant approprié, on peut les transformer en fibres par extrusion (comme pour les fibres acryliques).  [...]

[Biochimie] Conformation préférentielle des acides aminés ??

Donc si j'ai bien compris c'est une méthode empirique pour déterminer des éléments de structures secondaires connaissant la séquence d'un peptide ou d'une protéine.  [...] Donc ensuite ils ont construit un algorithme où tu rentres la séquences de ta protéine et le logiciel va prédire les éléments de structures secondaires de ta protéine.  [...]

[Biochimie] logiciel de modelisation gratuit

je suis a la recherche de logiciel me permettant d'observer la structure 3D d'une proteine connue, mais aussi me permettant de recuperer cette struture afin de la mettre dans un fichier word ou excel, ramol ne passe pas sur mon windows vista et Cn3D me permet pas de recuperer ma structure proteique.  [...] j'ai telecharger le logiciel STRAP, i ma l'air tres bien cependant je n'arrive pas a telecharger le format text de la proteine prise sur pdb (2QSP) alors que c'est le debut de tout comment faire pour la suite des manip grace a ce logiciel je pense pouvoir men sortir. a l'aide.  [...]

Quel test statistique utiliser?

Il s'agit d'une part de protéine de cellules transfectée et d'autre part de protéine de cellules non transfectée. Je voudrai savoir si la transfection affecte de niveau de cette protéine. Mais mon échantillon ne contient qu'une seule série de mesure.  [...] Si tu souhaite avoir des données chiffrées, il faut utiliser un logiciel comme ImageJ qui permet de mesurer des intensités de bandes. Il faut alors ajuster les valeurs obtenues pour ta protéine en fonction des valeurs lues pour la protéine référence.  [...]

Alignement séquence (Bioinformatique)

Dans notre labo, nous avons commencé à faire du séquencage de protéines. Nous recevons les données et nous les alignons avec une séquence de référence dans NCBI pour savoir si notre protéine est bien présente dans notre plasmide. Le séquencage n'est jamais parfait alors, lorsque je fais ces alignement jobtiens pleins de fragment des séquences homologue.  [...] J'aimerais savoir s'il y aurait un logiciel capable de relier tous ces fragments afin d'avoir une seule séquence de ma protéine. Présentement je le faismanuellement et c'est très long.  [...]

[Génétique] bioinformatique

Je dois trouver sur un logiciel de bioinformatique, la séquence du gène (et non de la protéine), codant pour la polymérase (pol) du VIH.  [...] Je l'ai déja trouvé via NCBI mais je dois trouver un autre moyen de tomber dessus. J'ai cherché vraiment pendant longtemps et je ne trouve pas du tout.   [...]

[Biochimie] Dosage des protéines???

à première vue 2 idées me viennent. dosage BCA si la protéine est pure et ELISA si on dispose d'une gamme étalon et des anticorps adéquats. Il y en a surement d'autres.  [...] Connaissant le coefficient d'absorption molaire (si tu ne le connais pas, suffit juste de taper la séquence de ta protéine dans un logiciel accessible sur le net tel protein calculator ), tu peux facilement déterminer la concentration.  [...]