• Forum - Logiciel, Analyse, Génétique

Logiciel de Génétique GeneMapper

J'utilise depuis peu un logiciel d'analyse en génétique, c'est GeneMapper version 3.7.  [...] Mon problème est que une fois que j'ai importé toutes mes données et que j'ai paramétré, j'ai toujours un souci avec mon size matches ou il m'affiche deux courbes nettement plus élévées que les autres et je sais que normalement les courbes doivent toutes être à la même hauteur sur l'axe des Y.   [...]

[Génétique] Analyse résultats SSR

voilà, J'ai fais une petite analyse génétique avec 3 marqueurs SSR seulement (3/5 qui ont bien marché) mais le soucis est que je ne sais pas comment exploiter ces résultats, car le logiciel MSVP que j'ai, analyse 5 amorces au minimum.  [...] Je suis à la recherche de logiciel pouvant analysé 3 amorces (ou si nécessaire ajouté une 4 ème qui peu être analysée aussi mais pas la 5ème car elle n'a pas donné de résultat du tout ).  [...]

[Biologie Cellulaire] Quel logiciel d'analyse de FACS gratuit puis-je utiliser ?

J'aurais besoin des lumières de spécialiste de cytométrie en flux. Je fais mes acquisitions de données de FACS avec CellQuest et j'aimerais pouvoir analyser les résultats sur mon ordinateur (un Mac). Je suis donc à la recherche d'un logiciel de traitements de données de cytométrie, ci possible gratuit (ou accessible grâce à une adresse mail académique, par exemple).  [...] En général les cytomètres ont un logiciel d'analyse intégré. Sinon, il y'en a une petite liste de gratuit, dont weasel.  [...]

[Biologie Moléculaire] Analyse de TLDA

je suis à la recherche d'un logiciel permettant d'analyser un grand nombre de fichiers issu d'une analyse par screening de TLDA. Nous avons un Workflow sous R permettant l'analyse des fichiers exporté (.txt) mais nous n'avons aucun logiciel nous permettant d'analyser l'ensemble des plaques d'un coup de façon à analyser les courbes d'amplifications.  [...] Il existe un logiciel permettant d'analyser des fichiers.sds (appareil de qPCR applied Biosystem), mais pas des fichiers.eds (nouveau format de fichier exporté par le Viia7).  [...]

[Génétique] allele in space

J'utilise le logiciel 'allele in space' (logiciel de génétique des populations) et je rencontre un problème. En fait ce logiciel prend en compte 2 fichiers d'entrée. un avec le génotype de mes individus et l'autre avec les coordonnées de tous les individus.  [...] Or sur l'interface du logiciel on peut cocher ou pas une case pour indiquer au logiciel si les coordonnées rentrées dans le fichier 'coordonnées' correspondent aux longitudes et aux latitudes de chaque individu. Le problème c'est que le logiciel lance très bien l'analyse lorsque je ne coche pas la case, or mes coordonnées étant des longitudes et latitudes j'aimerai cocher la case mais là le logiciel ne veut rien savoir et m'affiche un message d'erreur.  [...]

western blot et spéctrométrie de masse

-si c'est fait en automatique. mauvais choix dans le logiciel d'analyse.  [...] la protéine dont il s'agit est l'oxalate oxidase, elle a été identifiée chez le contrôle mais pas chez le stressé( stress abiotique), chose qui n'est pas normale, car ce sont des enzymes qui sont normalement impliquées dans le processus de défense ça pourrai donc être en rapport avec les possibilités que vous avez citez.   [...]

[Microbiologie] comment produire une toxine bactérienne sans bactérie?

je me demande si il y a une  [...] d'un antibiotique existe t il un logiciel freeware de bio-informatique qui présente la structure  [...] le code amine (je veux dire le code en acide aminé de la protéine) et qui marche sous windows, je disais il suffirait d'entrer le code amine de la protéine pour qu'il la structure en 3d et même nous donne le code génétique correspondant, en plus chercherais dans les base de données mondiales des gènes ou des références qui possède le même code génétique si c'est pas encore fait ça, je donne gratuitement une idée à un bio-informaticien pour créer ce logiciel.  [...] existe t il un logiciel freeware de bio-informatique qui présente la structure de n'importe quel protéine il suffirait d'entrer le code amine (je veux dire le code en acide aminé de la protéine) et qui marche sous windows, je disais il suffirait d'entrer le code amine de la protéine pour qu'il la structure en 3d et même nous donne le code génétique correspondant, en plus chercherais dans les base de données mondiales des gènes ou des références qui possède le même code génétique si c'est pas encore fait ça, je donne gratuitement une idée à un bio-informaticien pour créer ce logiciel.  [...]

[Biologie Cellulaire] apoptose cytométrie

Quelqu'un à déjà utilisé le logiciel DIVA pour l'analyse des résultats en cytométrie savez-vous si il est gratuit.  [...] Je n'avais pas eu l'idée de récupérer le surnageant en effet les cellules apoptotiques perdent de l'adhérence par conséquent il est important de le faire.   [...]

[Physiologie] Potentiel global du nerf

Grosso modo. le potentiel de repos d'un nerf mesuré et analyse représentée par un logiciel quelconque, est-il négatif ou égal à 0.  [...] C'est bien ce qui me semblait, pourtant j'ai travaillé il y a peu de temps un annale de concours (analyse de plusieurs courbes et définir lesquelles étaient potentiel gradué, PA, PG, ect) dont le corrigé officiel stipulait par rapport à l'une de ces courbes (partant de 0 et devenant par la suite négative en l'occurrence) que cela correspondait à un potentiel global de nerf.  [...]

cytométrie

J'aimerai avoir des renseignements sur le logiciel cellquest, à savoir quels sont les paramétres qui doivent être ajustés pour l'analyse des lymphocytes T CD4 et CD8.  [...]