• Forum - Liaisons, Protéine, ADN

[Biologie Cellulaire] Fixation d'une protéine à l'ADN

Je dois montrer comment une protéine qui se lie à l'ADN va réaliser des contacts spécifiques de séquences avec une molécule de l'ADN à double brin sans rompre les liaisons H.  [...] Je voudrais être sûre d'avoir compris la question. je pensais répondre qu'il pouvait y avoir liaison avec l'ADN si la protéine possède un domaine basique chargé + afin de se lier à l'ADN chargé -.  [...]

[Biologie Cellulaire] Domaine de liaison à l'ADN

Les protéines qui se lient plus spécifiquement à l'ADN vont plutôt reconnaître la partie variable de l'ADN cad l'enchaînement des base. Dans ce cas, les protéines établissent plutôt des liaisons hydrogène avec les bases de l'ADN. Les acides aminés les plus mis en jeu étant ceux qui établissent le plus de liaisons hydrogène cad glutamine, asparagine et arginine.  [...] Dans un premier temps il faut bien qu'elle adhère de manière aléatoire à l'ADN par ces phosphates ( fixation non spécifique donc )ensuite qu'elle rompt les liaisons et enfin qu'elle se fixe ou pas à la séquence de paire de base. Sans compter sur le fait qu'elle doit dégager l'hisone de l'ADN si sa séquence spécifique est enroulée autour d'un octamère d'histones... Elle fait tout ça la protéine.  [...]

ADN et protéines

3. La mutation de l'ADN se passe sur un codon d'un acide aminé du site actif de la protéine. Beaucoup de protéines ont une fonction enzymatique qui leur permet de catalyser une réaction chimique. Cette réaction se fait lorsqu'un substrat spécifique entre en contact avec une poche de la protéine appelée site actif.  [...] 4. La mutation de l'ADN se passe sur un codon d'un acide aminé impliqué dans le repliement de la protéine. Pour fonctionner, les protéines doivent se replier sous une forme très spécifique appelée structure tertiaire. Certains acides aminés clés sont impliqués dans ces repliements (cystéines pour les ponts disulfures, liaisons ioniques avec acides aminés chargés, liaisons H.  [...]

[Biochimie] Cast

je n'arrive pas à comprendre le principe et les étapes de la technique CAST (Cyclic amplification and selection of targets).   [...] Je sais qu'elle permet d'identifier des sites de liaisons entre une protéine et l'ADN. Mais je ne comprends pas de quelles étapes est composé un cycle.  [...]

[Evolution] mécanisme de correction des mutations génétiques, quelle utilité évolutive?

Il faut comprendre qu'au fond, la réplication de l'ADN est une simple réaction chimique, organique. Une protéine se fixe à l'ADN et avance dessus en incorporant des nucléotides reconnus parce qu'il y a des liaisons plus stables que d'autres. Tout est dans le plus stable.  [...] Le premier mécanisme de correction est dans la protéine même qui réplique l'ADN. Elle a une faible activité DNase, c'est à dire que dès que le nucléotide est incorporé, il se passe en même temps une réaction de rejet de ce nucléotide, mais si la liaison est plus stable ça ne marche pas et le nucléotide reste en place.  [...]

Réplication de l'ADN

pour une réplication,l'ADN doit s'ouvrir çàd les brins dADN ne sont plus associés par l'intermédiaire de l'Hélicase qui va coupé les liaisons d'hydrogènes entre les deux brins, on sait que la lecture de lADN se fait de 5'vers 3' et puisque lADN est une double hélice donc il ya une partie 5'-3' et l'autre 3'-5', donc pour le 2eme cas, l'adn est synthétisé d'une façon normale et continue ( de 5'vers 3' ) mais donc le 1er cas qui est de 5 vers 3' (la synthèse serait de 3 vers 5' ce qui n'est pas habituel ) donc on a une proteine nommé ADN primase qui va synthétisé des fragements d'ARN oui je dis bien des fragments d'arn qui vont etres remplacés par la suite par des petits fragments d'adn par l'intermédiaire dADNpolymérase tu vas surement te posé la question.  [...] est prq pas des amorces d'ADN dès le départ et bien non car ladn polymérase nécessite un amorce dARN pour débuter son '' travail, une fois on a les amorces dadn sont là ( les fragments d'OKAZAKI QUI SONT FAIT DE 5 VERS 3 ) une proteine ligase va les '' soudés pour avoir un brin d'ADN continu.  [...]

Ordre des acides aminés dans une chaine polypeptidique

Je pense qu'il y a une confusion entre la séquence en acides aminés d'une protéine, et la structure des molécules d'ADN dans un chromosome.  [...] Maintenant lors d'une traduction d'un ARNm en protéine, on utilise la séquence d'un gène qui est codé par des nucléotides dans l'ADN. Cette séquence correspond à une partie d' une molécule d'ADN (soit. un enchaînement de A, C, G, T liés par des liaisons phosphodiesters).  [...]

[Biologie Moléculaire] Complexe RISC et ARNi

oui c'est une histoire de liaisons style liaisons H, electrostatiques, VDW, doigts de zinc... que peut faire le complexe enzymatique (qui de nature protéique) avec l'ADN ou ARNi dans ce cas.  [...] Je sais pas pourquoi tous le monde fait le raisonnement enzyme -. protéine. Ya pas que ça tout de même, les ribozymes ont leur site actif constitués d'acides nucléiques.  [...]

[Biologie Cellulaire] Code Histone

-les histones coeur sont organisés en octamères protéiques. 2 de chaque sorte (H2A, H2B, H3 et H4). Ta double hélice d'ADN va venir s'enrouler autour de cet octamère, établissant des liaisons faibles avec lui (liaisons H principalement), formant un nucléosome.  [...] L'enchaînement de ces nucléosomes forme la chromatine décondensée (=euchromatine) et adopte une structure grossièrement appelée en collier de perles (11nm de diamètre).   [...]

[Biologie Moléculaire] Lyse cellulaire

non, un crosslinker = un produit qui fait des liaisons covalentes entre tous les trucs qui passent à sa portée. C'est utilisé pour fixer des liaisons labiles le temps de purifier une interaction. Par exemple on l'utilise en ChIP pour fixer les protéines sur l'ADN, avant de lyser les cellules et de récupérer l'ADN lié aux protéines d'intérêt (formaldehyde par exemple).  [...] Votre proposition est théoriquement viable, mais cela peut être extrêmement lourd a mettre au point. Il faut notamment etre sur que le reste de la protéine n'est pas important dans l'interaction avec le lipide, (ou meme dans l'interaction avec d'autres protéines elle-même importantes dans l'interaction avec le lipide).  [...]