• Forum - Liaisons, Organisation, Acides

[Biologie Moléculaire] Structure de l'ADN

La forme en double hélice de l'ADN est due aux liaisons H intercaténaires et au fait que cette organisation des acides nuléiques permet de minimiser l'énergie globale du système en excluant l'eau. Il s'agit là de force à une échelle beaucoup plus petite que celle de l'univers.  [...] L'organisation moléculaire voire atomique dans l'espace est définie par la thermodynamique. En bref, les structures moléculaires ou les atomes s'organisent dans l'espace d'une façon qui limitera au maximum l'état énergétique de la molécule. Pour cette raison, au niveau atomique par exemple l'angle entre les différentes liaisons qu'établit un carbone est d'environ 109° s'il fait 4 liaisons, 120° s'il n'en fait que 3 puisque c'est de cette façon que la molécule sera la plus stable.  [...]

Liaison entre acide aminé

Les liaisons ionique concerne les AA ionisable, dans une forme chargée. Les résidus ionisable sont ceux ayant un pKa pour leur side chain.  [...] Ainsi, dans le peptidoglycane bactérien, on trouve des liaisons entre acides aminés dont un clivage différent le la liaison peptidique.  [...]

[Biochimie] Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques

Certaines protéines interagissant ensemble peuvent être dissociées par l'ajout de sel (en solution). J'imagine que les ions de ce sel solvatés en solution peuvent interagir avec certains acides aminés afin d'empêcher l'interaction protéine 1 protéine 2 (donc une interaction électrostatique) mais je me demande quels acides aminés sont capables de réaliser ces types de liaisons.  [...] Ne pas oublier aussi que les protéines n'interagissent pas uniquement au moyen de la chaine latérale de leurs acides aminés. Le squelette peptidique d'une protéine, avec ses fonctions amides, peut également établir des liaisons H avec d'autres protéines.  [...]

[Biochimie] liaisons entre acides amines

Ce sont des liaisons amidiques aussi vu qu'il y a formation d'un amide primaire entre l'acide carboxylique d'un acide aminé et l'amine d'un autre.  [...] En fait, le terme de liaison carboxylique ne veut rien dire. Avec un acide carboxylique, on peut faire plusieurs types de liaison. ester, amide, thioester... et ces liaisons peuvent egalement tres bien se faire intervenir d'acides carboxylique.  [...]

[Divers] Les pepsines gastriques sont elles des enzymes?

Elles catalysent alors l'hydrolyse des protéines et seulement des protéines. Cette hydrolyse est très sélective, ne concernant que des liaisons entre acide aminé dit aromatique (tyrosine ou phénylalanine) et l'acide aminé suivant. De fait, les produits de cette réaction sont des peptides (enchainement de quelques acides aminés) de tailles très diverses.  [...] (...)Cette hydrolyse est très sélective, ne concernant que des liaisons entre acide aminé dit aromatique (tyrosine ou phénylalanine) et l'acide aminé suivant. De fait, les produits de cette réaction sont des peptides (enchainement de quelques acides aminés) de tailles très diverses. (...).  [...]

[Biochimie] Questions à propos de l'activité enzymatique (1èreS)

- Pouvez-vous m'apportez des précision svp sur les liaisons hydrogène liant les différents acides aminés et au niveau des ponts dissulfures se forment-ils à chaque fois qu'il y a deux cystéine Est-ce qu'il y a d'autres acides aminés qui provoquent la formation du pont dissulfure.  [...] Pour les activités enzymatiques, il s'agit de l'organisation spatiale précise des acides aminés du site catalytique parfois séparés par plusieurs centaines d'acides aminés au niveau de la séquence primaire, mais rapprochés et disposés précisément grâce au repliement adéquat.  [...]

[Biochimie] Acides Aminés !

Par contre moi j'aurai mis pour la 15) et la 17) la réponse E) qui inclus les liaisons ionique, pck il peut y avoir des liaisons ionique entre les autres acides aminés nn mm entre l'acide aspartique et d'autre acide aminés nn.  [...] Maintenant, tu peux aussi repondre e) aux questions 15, 16 et 17. Tes reponse seront justes. Il suffit juste de considerer que l'acide amine en question se situe en position N- ou C-terminale.  [...]

[Biologie Moléculaire] extractiobn d'ADN plasmidique

15M (ajout de 2V d'une solution SDS1%, NaOH 0.2M). Le SDS est un détergeant ionique servant à lyser les membranes et à dénaturer les protéines et les acides nucléiques (rupture des liaisons hydrogènes et des liaisons hydrophobes). NaOH, base forte, induit une augmentation du pH et dénature aussi les protéines et les acides nucléiques.  [...] (L'alcool isoamylique empêche la formation de mousse durant l'émulsion). L'ensemble est ensuite centrifugé 5 minutes à 13 000 tours minutes afin de séparer deux phases. La phase supérieur (V/2), aqueuse, contenant les acides nucléiques (donc les plasmides) est récupérée.  [...]

Le scénario de l'origine de la vie enfin déterminé ? - Page 4

D'une manière générale, on a souvent fait appel à l'idée de cycles humide/sec pour concentrer et polymériser des molécules organiques (pour former par exemple des peptides) dans les zones de marnage sur les rivages de la Terre primitive. Hors, on a démontrer que la polymérisation par un gradient thermique (de seulement 30°C) uniquement est non seulement possible, mais en plus plus efficace.   [...] 3) L'un des avantages de ces remontées alcalines au milieu de mers acides, c'est le double gradient pH et thermal (auquel viendrait s'ajouter les gradients de concentrations molaires ) On constate que la vie compartimente beaucoup sa chimie, mais comment s'est mis en place le tout premier compartiment Quid de l'énergie qui anime, régule, régit les échanges Car comme rebattu dans l'un des liens, un organisme mort contient tout les composants de la vie - bien qu'il ne soit plus vivant.  [...]

relation : peptides / acides aminés

Un peptide est une chaîne comportant moins de 50 acides aminés reliés par des liaisons peptidiques. C'est donc une petite protéine résultant d'une traduction génétique.  [...] ==. A l'inverse si on soude deux molécules (comme la liaison peptidique entre deux acides aminés ) il faut libérer deux liaisons en enlevant H à l'une et OH à l'autre, et de l'eau part.  [...]