• Forum - Liaisons, Formation, Protéines

[Biochimie] Congélation : effet sur les enzymes

C'est généralement la formation des cristaux de glace qui endommagent les protéines. On peut mettre du glycérol (environ 20%) ce qui limite la la taille des cristaux. De manière générale, tout ce qui fait des liaisons hydrogène et qui perturbe donc la formation des cristaux de glace, permet de préserver la structure 3D des protéines à la congélation. Par exemple, les sucres marchent bien.  [...] Certaines grenouilles (je ne sais plus lesquelles) possèdent des protéines qui se lient justement aux cristaux de glace naissant, empêchant leur croissance. C'est une sorte d'antigel qui leur permet de résister à la congélation.  [...]

Protéine/cellule ? oeuf/poule

Finalement il a été établi (il y a des spécialistes qui confirmeront peut être cela) que ce qui est important dans les ribosomes pour la formation des liaisons peptidiques ce sont des ARNs. Les proteines ne jouent donc qu'un role de structure.  [...] Si j' ai bien compris au tout début de la formation de la vie les ARNs aurait étés suffisant pour permettre la synthèse protéique. J' apprécierai vraiment que tu me communique les sources qui te permettent d' avancer cela, non pas car je remet ton explication en question mais juste parcque je trouve le sujet intriguant.  [...]

collagène

Les molécules de procollagènes sont ensuite stabilisées par formation de liaisons hydrogènes, de ponts disulfures, mais aussi par l'intervention de protéines chaperones. Chaque triple hélice (procollagène) possède des extrémités libres, qui ne forment pas de triple hélice.  [...] L'étape finale fait intervenir une dernière enzyme oxydase, la lysyl oxydase, qui oxyde les résidus hydroxyls en groupes aldéhydes des résidus hydroxylysyls et hydroxyprolyls. Les molécules de tropocollagène peuvent alors s'assembler en fibrilles (polymérisation), par formation de liaisons covalentes.  [...]

[Divers] Albumine dénaturée

Je dirais masse apparente lorsqu'on détermine la taille de la molécule par comparaison avec un marqueur de poids moléculaire. Mais cette unité est aussi employée dans la détermination précise des masses moléculaires, où on retrouve bien 1 Da = 1 g/mol. Les bases de données comme expasy donnent la masse réelle de la protéine en Daltons par exemple.  [...] Le mécanisme de cette coagulation consiste en une rupture des liaisons intramoléculaires provoquant un déplissement des molécules protéiques avec formation de nouvelles liaisons intermoléculaires.  [...]

[Biochimie] Formation de liaisons électrostatiques en absence de résidus chargés ?

Je n'arrive pas à trouver la réponse à cette question. La formation de liaisons électrostatiques au sein d'une protéine est-elle possible en absence de résidus chargés.  [...] Bien sûr, les liaisons électrostatiques ne sont pas dues aux charges portées par les acides aminés mais aux interactions atomiques.  [...]

[Biologie Cellulaire] Protéines et liaisons convalentes entre 2 résidus soufrés

Ce QCM porte sur une partie d'un livre qui parle de la conformation des protéines et rapidement de la protéine Prion. or, il n'est inscrit nulle part dans cette partie du livre que les protéines -ou que la protéine Prion- est stabilisée par des liaisons covalentes entre résidus soufrés.  [...] Je précise néanmoins un point que je n'ai pas vu sur le wiki en anglais. en dehors de la question éventuelle de ponts disulfure (je te laisse y trouver la réponse), les deux principaux éléments qui stabilisent la protéine prion anormale et les autres peptides amyloides sont la formation de feuillets betas interchaine très stable et l'emboitement quasi-parfait des chaines latérales des acides aminés des différentes chaines.  [...]

"Couper" des liaisons hydrogène

Toutefois, dans le cas des hélices DNA-b, une fois qu'elles séparent deux brins, des protéines SSB viennent s'y fixer pour empêcher la reformation des liaisons hydrogène, ce qui indiquerait que la formation des liaisons hydrogènes dans le cas de l'ADN est spontanée.  [...] Et la reformation de la liaison H c'est possible que ça soit pas spontané La liaison H ça stabilise non donc je pensais que ça se refait spontanément en permanence (si la distance le permet), comme les molécules hydrophobes dans un l'eau, elles se retrouvent toutes regroupées à cause de cette liaison H.  [...]

Protéines dimériques

Dans mon cours, on insiste bien sur le fait que les protéines globulaires ne possedent pas de liaisons covalentes dans leur structure quaternaire.  [...] Pour les types de liaisons entre les domaines constitutifs des chaînes lourdes et légères, je pense à des liaisons 'classiques' non covalentes entre sous unités d'une protéines constituée de plusieurs sous unités.  [...]

[Biochimie] Glycolyse

Dans la glycolyse, la production d'ATP est précédée par la formation de molécules intermédiaires possédant des liaisons dites riches (1-3 diphosphoglycérate et phosphoénolpyruvate).  [...] Pour ma glycolyse, je pense que la 6ème réaction (oxydation-phosphorylation du GAP en 1,3-BPG) est permise grâce au couplage de la réaction et la formation d'un thioesters intermerdaire, ce qui est possible grace à NAD -. NADH mais bon, je m'embrouille un peu avec tout ça... C'est vraiment pas clair dans ma tête.  [...]

[Biochimie] Comment casser des liaisons d'intéraction entre protéines?

Contexte. les lectines sont responsables (en partie) de la coagulation des hématies entre elles. Ce sont des protéines membranaires qui reconnaissent les parties glycosidiques d'autres protéines.  [...] Tes 3 propositions me paraissent bonne (le plus efficace devrait être le chauffage, mais à condition de ne pas vouloir absolument des protéines natives parce que tu vas les dénaturer).  [...]