• Forum - Liaisons, ADN, Sucres

faces Hoogsteen de l'adénine

La contrainte physique de la molécule d'ADN (ribose-phosphate) empêche la face Hoogsteen de former des liaisons d'hydrogène.  [...] La face Hoogsteen est favorisée sur la face Watson/Crick, car elle génère moins de tensions intermoléculaires. Les liaisons sont de type Watson/Crick dans l'ADN en raison de la présence des nombreux phosphates et sucres, qui empêchent l'approche d'un autre cation par la face Hoogsteen, en se basant sur votre exemple.  [...]

[Biochimie] Interaction entre l'eau et l'ADN

J'aimerais savoir si l'eau interagit plutôt avec les bases azotées ou sucres (liaisons hydrogènes) lorsque l'ADN est simple/double brin ou avec les phosphates (chargés - donc interaction peut être possible avec les H de l'eau). Merci d'avance.  [...] - au niveau des sucres, de part la cyclisation du désoxyribose mais aussi de la liaison phosphodiester qui vont créer un moment polaire à tendance positif au niveau des carbones 3 et 5, tandis que la liaison osidique avec l'azote de la base (purique ou pyrimidique) va créer un autre moment polaire positif au niveau du carbone 1.  [...]

[Biologie Moléculaire] Devoir sur l'ADN à rendre pour le 21/11/16 !

PS. Je dois aussi avouer que je n'ai pas très bien compris par ce qu'il a voulu dire par l'enroulement de l'ADN pour former des chromosomes donc pour toutes explications je suis tout ouïe.  [...] Pour faire simple, ADN = protéine composée de sucres (Désoxyribose si je ne dis pas de bêtises), lié d'une part à une base (Adénine [A], Thymine [T], Guanine [G] ou Cytosine [C]) et d'autre part à un phosphate.  [...]

[Biochimie] ADN: pKa du groupement phosphate, acidité etc.

Première question. On dit que les acides nucléiques ont un caractère acide, je peux le concevoir puisque l'acide phosphorique est un donneur de protons, or au pH physiologique, ce dernier va laisser partir ses protons. Donc l'ADN devient basique. J'aimerais savoir si je divague ou si c'est correct.  [...] Deuxième question. N'oublie pas que dans l'ADN deux fonction -OH du phosphate font une liaison ester (neutre) avec les sucres. Donc au final on a qu'une seul charge négative dans notre polynucléotide sauf au niveau des extrémités ou on a deux charges négatives.  [...]

l'ADN chromosomique sert-il in fine à produire autre chose que des protéines ?

Dans l'ADN il y a aussi des sequances qui ne donnerons ni protéines ni ARN, mais qui sont indispensables (séquences régulatrices,promotteurs, switchs) des séquences qui favorisent la compaction de l'ADN pour qu'il prenne moins de place car une cellule ne peut pas avoir son ADN en permanence déroulé tellement il est grand, il y a aussi des séquences protectrices (télomères), des zones indispensable à la structure (centromère) et tout ceci ne fabrique aucunes protéines mais est indispensable.  [...] après puisque dans ton titre tu parlede production in fine, alors quelque part l'ADN sert a la fabrication des lipides, ainsi que des sucres et polysaccharides, puisque à partir de l'ADN on obtiens l'ARN, a partir de l'ARN on obtiens une protéine, et à partir d'une protéine on peut obtenir des lipides(/ou des sacchrides) car certaines enzymes sont responsable de la création de macromolécules (comme les saccharyles transferases) et les fabricant dans un ordre particulier et permettant une liaison particulière, on aura une molécule lipidique (ou sacharidique dans le cas des sacharyl transferases) particulière, et pas une autre.  [...]

[Biochimie] Calcul d'une concentration en ADN

Bonjour, je voudrais savoir s'il existe un moyen de calculer la concentration d'ADN dans une solution avec comme seule information la masse d'unités osidiques que contient celle-ci (les bases, sucres et phosphates ont été séparés et sont toujours présent dans la solution).  [...] Le but de l'exo est de déterminer la quantité d'ADN plasmidique dans une solution de 100mL. On sait que la taille du plasmide est de 3500pb. On introduit dans la solution des enzymes qui détachent les sucres, bases et phosphates les uns des autres, puis on détermine qu'il y a 9,8g d'unité osidique dans la solution.  [...]

[Biologie Moléculaire] PVP CTAB extraction d'ADN

Le CTAB (Cetyltrimethylammonium bromide) est un détergent permettant la dissolution des sucres et la précipitation de l'ADN.  [...] Le PVP (Poly(n-vinyl-2 pyrolidone)) permet d'éliminer certains inhibiteurs de PCR et protège des effets néfastes des produits de la réaction de Maillard.   [...]

[Biologie Cellulaire] La cellule mystère.... - Page 29

Je vois que certains d'entre vous s'y connaissent en coloration pour la microscopie bifocale. Ne connaissant pas trop cette technique, je me demandais comment se faisaient les colorations, mais plus en intravitale Les anticorps peuvent être utilisés Ou il faut avoir des souris modifiées avec de la GFP ou autre Tout en sachant que se serait pour visualiser des interactions entre différentes populations cellulaires (CD4, CD8 et DC).   [...] C'est bien l'équivalent de CENP-A chez C. elegans (HCP-3). CENP-A est un variant de l'histone H3 qui n'est localisé que sur la partie externe des centromères. Chez C. elegans, les chromosomes sont holocentriques, c'est à dire que le centromère est réparti sur l'ensemble du chromosome, d'où cette aspect en tranche napolitaine.   [...]

[Biologie Cellulaire] Centrifugation du cytoplasme de E.coli

Dans mon lab, nous avons après séparation des bactéries de leur milieu et lyse de ces dernières, centrifugé à 1200rpm pendant 10-15min l'échantillon contenant les bactéries, lysis buffer et lysozymes.   [...] Non, il y a de l'ADN, des lipides, sucres et des protéines. Sans séparation autre que la centrifugation, tu t'es seulement débarrassé des éléments volumineux (parois, vésicules...).  [...]

Absorption des sucres par l'organisme

-la serie est aussi importante, les sucres sont caracterises par des carbones portant une fonction reductrice par sucre, cést par cette fonction qu'auront lieu les liaisons. Il existe deux grandes series, les cetoses (de cetone, comme le fructose) et les aldoses qui ont une fonction aldehydique ( le glucose par exemple).  [...] -la grande difference entre les differents sucres, est la presence de carbones assymetriques quasiment partout, en particulier au niveau de la fonction reductrice, et lors de la formation de liaisons avec un autre sucre, on va avoir une liaison particuliere soit en alpha soit en beta on appelle cela l'anomerie de la liaison osidique.  [...]