• Forum - Liaisons, ADN, ARN, Protéines

[Biologie Moléculaire] Gel de retard

Eske je peut trouvé quelqu'un qui peut m'expliquer la nature des interaction qui s'établissent entre ADN/protéines ARN/protéines lors de la migration sur un gel de retard.. merci d'avance.  [...] merci infiniment.. g entendu parlé de sites de liaisons spécifiques entre ADN ou ARN et protéines.. j voulais m'en assuré.. merci pour l'information.  [...]

[Biologie Cellulaire] Domaine de liaison à l'ADN

Les protéines qui se lient plus spécifiquement à l'ADN vont plutôt reconnaître la partie variable de l'ADN cad l'enchaînement des base. Dans ce cas, les protéines établissent plutôt des liaisons hydrogène avec les bases de l'ADN. Les acides aminés les plus mis en jeu étant ceux qui établissent le plus de liaisons hydrogène cad glutamine, asparagine et arginine.  [...] Dans un premier temps il faut bien qu'elle adhère de manière aléatoire à l'ADN par ces phosphates ( fixation non spécifique donc )ensuite qu'elle rompt les liaisons et enfin qu'elle se fixe ou pas à la séquence de paire de base. Sans compter sur le fait qu'elle doit dégager l'hisone de l'ADN si sa séquence spécifique est enroulée autour d'un octamère d'histones... Elle fait tout ça la protéine.  [...]

Propriétés des ADN et ARN

Dans le cours des propriétés physicochimiques des acides nucléiques (ADN et ARN), on nous a dit que la basicité dénaturait l'ADN (affecte les liaisons H) bicatenaire (sans affecter les liaisons phospho diester), alors que cette même basicité hydrolysait (affecte les liaisons phosphodiester) l'ARN monocatenaire.  [...] - Comment se fait-il que la basicité n'affecte pas les liaisons phosphodiester de l'ADN bicatenaire, alors qu'elle affecte celle de l'ARN, c'est du au sucre (ribose et disoxyribose), aux base.  [...]

Réplication de l'ADN

pour une réplication,l'ADN doit s'ouvrir çàd les brins dADN ne sont plus associés par l'intermédiaire de l'Hélicase qui va coupé les liaisons d'hydrogènes entre les deux brins, on sait que la lecture de lADN se fait de 5'vers 3' et puisque lADN est une double hélice donc il ya une partie 5'-3' et l'autre 3'-5', donc pour le 2eme cas, l'adn est synthétisé d'une façon normale et continue ( de 5'vers 3' ) mais donc le 1er cas qui est de 5 vers 3' (la synthèse serait de 3 vers 5' ce qui n'est pas habituel ) donc on a une proteine nommé ADN primase qui va synthétisé des fragements d'ARN oui je dis bien des fragments d'arn qui vont etres remplacés par la suite par des petits fragments d'adn par l'intermédiaire dADNpolymérase tu vas surement te posé la question.  [...] est prq pas des amorces d'ADN dès le départ et bien non car ladn polymérase nécessite un amorce dARN pour débuter son '' travail, une fois on a les amorces dadn sont là ( les fragments d'OKAZAKI QUI SONT FAIT DE 5 VERS 3 ) une proteine ligase va les '' soudés pour avoir un brin d'ADN continu.  [...]

DNAses, pourquoi spécifique aux ADN?

je sais que les DNAses coupent l'ADN au niveau des liaisons phosphodiesters, cependant les ARN sont aussi, dans leur structure primaire, une suite d'acides nucléiques liés entre eux par des liaisons phosphodiesters. Comment la DNAse (en générale) fait-elle pour être spécifique à l'ADN.  [...] Et dans la formation du complexe enzyme-substrat, il n'y a pas que la structure du site ou se déroule la réaction qui compte (ici la liaison PDE), dans notre exemple la seule présence du groupe hydroxy sur le ribose peut faire la différence.  [...]

[Biologie Moléculaire] Lyse cellulaire

non, un crosslinker = un produit qui fait des liaisons covalentes entre tous les trucs qui passent à sa portée. C'est utilisé pour fixer des liaisons labiles le temps de purifier une interaction. Par exemple on l'utilise en ChIP pour fixer les protéines sur l'ADN, avant de lyser les cellules et de récupérer l'ADN lié aux protéines d'intérêt (formaldehyde par exemple).  [...] Votre proposition est théoriquement viable, mais cela peut être extrêmement lourd a mettre au point. Il faut notamment etre sur que le reste de la protéine n'est pas important dans l'interaction avec le lipide, (ou meme dans l'interaction avec d'autres protéines elle-même importantes dans l'interaction avec le lipide).  [...]

arrêt de la transcription

bonjour à tous, je ne comprends pas trop comment se fait l'arrêt de la transcription chez les procaryotes. l'ARNm va former une boucle et lorsque l'ARN polymérase va rajouter un certain nombre de U, l'ARN polymérase de détache de l'ADN C'est ça qu'il se passe pourquoi rajouter des U va provoquer l'arrêt de la transcription merci d'avance.  [...] Du coup l'hybride ADN-ARN forme une boucle au niveau des U. or les liaisons A-U sont plus faibles (deux liaisons hydrogène, mais même par rapport à A-T, c'est moins stable, pour une raison que j'ignore), ce qui pousse la Pol à se décrocher.  [...]

[Biotechnologie] Terminateur de transcription

a) les sites Nut, qui une fois transcrits sont des sites de liaisons pour une hélicase (la fameuse Rho) qui migre sur l'ARN, rattrape l'ARN pol et dissocie le complexe ADN..ARN, si bien que l'ARN pol aussi est élaguée de l'ADN. Les sites Nut sont suivie de sites de pauses (des tiges-boucles) ce qui favorise Rho.  [...] Il est possible que la séquence terminateur ait été prise sur un modèle bien connu, tel le phage lambda, mais qu'il comporte aussi un site antiterminateur. or pour qu'il y ait antiterminaison, il faut la présence d'une protéine (N chez lambda je crois), donc si ta souche ne le code pas, cela peut le faire.  [...]

[Biologie Moléculaire] Questions sur la transcription

Déjà, l'ARN polymérase permet la fabrication temporaire d'une molécule d'ARN double brin c'est bien ça, pendant la transcription Ce que je ne comprends pas, c'est que après que l'enzyme soit détachée de la molécule d'ADN et recyclée dans le nucléoplasme, il y a une rupture de liaisons hydrogènes temporaire entre le brin non codant ADN et l'ARN et donc la libération de l'ARN dans le nucléoplasme.  [...] Ensuite, concernant l'ARN dit messager, c'est un peu comme une lettre envoyé à la poste. L'information ADN est transcit ( regarder la définition dans un dictionnaire ) en ARN(messager) et sera ensuite traduit en protéine.  [...]

Compositions des ARN

Comme l'ADN, l'ARN comporte des liaisons phosphodiester, les nucléotides sont monophosphate mais sont incorporés sous la forme de ribonucléotides tri phosphates.  [...] Si je comprends pour bien lors de l'incorporation des ribonucléotides triphosphates, l'ARN polymérase va entrainer la rupture d'une liaison anhydre d'acide pour libérer un pyrophosphate (comme dans le cas de la polymérisation de l'adn) On aura ainsi un ribonucléotide monophosphate intégrer à l'ARN naissant.  [...]