• Forum - Liaison, Site, Actif, Substrat

site catalytique = site actif ???

Dans le site actif d'une enzyme, on intègre deux choses le site de liaison au substrat (la reconnaissance), et le site catalytique responsable de la fonction.  [...] Malheureusement en général ce sont des configurations spatiales dues à la structure tertiare sinon quaternaire qui forment un site actif et pas une séquence primaire, donc on te trouvera difficilement une telle séquence.  [...]

[Biologie Moléculaire] Acide aminé

la région particulière de l'enzyme dans laquelle s'imbrique la molécule de substrat est appelé site actif ( jusque là je ne vous apprends rien ). On distingue dans ce site actif 2 régions.les acides aminés de liaison qui se lient par des liaisin non covalente avec le substrat, et les acides aminés catalytiques qui sont responsable de la réaction.  [...] Donc je suis partit sur le fait qu'un substrat et un site actif on un forme complémentaire, deux enzyme différente avec 2 substrats différentes donnent les deux même produits... ca me laisse perplexe.  [...]

enzymes

Les enzymes allostériques sont souvent sous forme de dimères, trimères, etc (homo ou hétéro). L'activation d'un site allostérique par un effecteur entraîne un changement de conformation des autres sites, situés sur une autre sous-unité. Ce changement favorise la liaison du site actif à son substrat.  [...] Quand on ne parle pas d'allostérie, il n'y a tout simplement pas de ces sites modulateurs.  [...]

Inhibiteur compétitif

Tout comme la liaison du substrat à l'enzyme, la liaison de l'inhibiteur compétitif est réversible. Celui-ci, en se fixant à l'enzyme au niveau du site actif (site liant le substrat) réduit par conséquent son activité par compétition avec le substrat. Toutefois, l'enzyme peut atteindre sa vitesse maximale d'activité enzymatique si l'on augmente la concentration en substrat.  [...] Pour répondre à ta question, l'inhibiteur compétitif inhibe toujours l'activité enzymatique, bien qu'en présence de substrat celle-ci existe toujours (même si parfois très faible).  [...]

[Biologie Moléculaire] Site actif d'un enzyme.

Le site actif est la région de l'enzyme où à lieu la réaction qu'elle catalyse. C'est là que le substrat de l'enzyme va être transformé en un nouveau produit en réagissant avec le ou les acides aminés de ce site.  [...] La transformation catalysée par l'enzyme et le substrat utilisé dépendent donc de la nature du site de liaison ET du site de catalyse. En un mot. du site actif.  [...]

reactions chimiques dans les molecules des cellules vivantes?

Pour les transporteurs... Grosso modo dans le compartiment de départ, le contact (non covalent) avec un substrat/ligand va induire un changement de conformation de la structure protéique du transporteur.  [...] S'il s'agit d'un transport actif, le changement de conformation induit par le substrat/ligand dévoile un site secondaire de liaison pour l'ATP, qui va se lier de façon covalente avec le transporteur, puis s'hydrolyser (libération d'un phosphate). L'hydrolyse va induire un état excité de la structure portéique, avec un nouveau changement de conformation qui relâche le substrat dans le compartiment destinataire.  [...]

[Biochimie] enzymologie

non mais un co-facteur retrouve son etats initial tandis que le substrat se transforme en produit et d'ailleur un co-facteur ne se lie pas sur un site actif de liaison avec le substrat donc j pense que c'est tout à fait différent.  [...] Ca je sais bien, mais les cofacteurs peuvent se lier sur un site tellement proche qu'un échange est possible avec le substrat. Après je ne saispas pour la question que tu as posé... mais le cofacteur peut ne pas se retrouver dans son état initial. Il se retrouvera dans son état initial par la suite.  [...]

[Biochimie] enzymologie

-une autre question s'agit de l'inhibition compétitive, les 2 sites de fixation de substrat et d'ihnibiteur presente une analogie structurale, et il ya un seul site actif de fixation soit il est occupé par l'I ou le Sub, mais en regardant les model de fixation des 2 ligants on trouve parmis eux celui d'encombrement stérique.  [...] la liaison de l'inhib à l'enzyme libre sur un site prés du site actif, peut empecher la liason du subs par encombrement stérique, ou bien à un site éloigné du site actif induit un chagement de l'enzyme ce qui empeche la fixation du substrat.  [...]

[Biochimie] Inhibiteur allostérique

Plutôt que de se lier sur le site actif de l'enzyme où se déroule la réaction, comme c'est le cas d'un inhibiteur compétitif, l'inhibiteur allostérique se lie sur un autre site de l'enzyme (dite alors enzyme allostérique) et changer sa configuration / conformation, de façon telle qu'elle ne possède plus la même affinité pour son substrat.  [...] Oui c'est bien ça, c'est un inhibiteur non compétitif justement car il ne se lie pas sur le site actif de l'enzyme (le site actif = le site sur lequel se fixe le substrat).  [...]

[Biologie Moléculaire] enzyme

Bonsoir, Ce sont tous les deux des enzymes protéolytiques mais ils sont différents par leur séquence d'acides aminés et par conséquent, leur structure 3D est différente. La structure est importante notamment au niveau du site actif. Imagine que le site actif soit une serrure et que le substrat soit une clé.  [...] Si la clé entre bien dans la serrure alors le substrat est fixé au niveau du site actif et l'enzyme peut agir. La trypsine et la chymotrypsine ont des serrures différentes.  [...]