• Forum - Liaison, Résidus, Action, Enzyme

Structure protéines

Trypsine.scinde la liaison peptidique du coté carboxylique des residus Arg et Lys l'action de l'enzyme est bloquée par la presence du Pro a droite.  [...] Chymotripsine clive la liaison peptidique du coté carboxylique des residus Phe,Tyr et Trp,l'action de l'enzyme bloquée par la presence de Pro a droite.  [...]

[Biochimie] Action d'une enzyme sur des acides aminés

Le peptide traité par un mélange de 2 enzymes protéolytiques qui hydrolysent les liaison peptides sur le côté carboxylique des résidus Leu, Ile, et Val d'une part, et de Tyr, Trp, et Phe d'autre part, ont fourni quatres peptides Pa, Pb, Pc et Pd  [...] J'ai pensé à la thermolysine, mais cette enzyme coupe au niveau des N-Terminal de Val, Leu, Ile, sauf que dans l'énoncé, on me demande de trouver celle qui hydrolyse les liaisons peptides sur le côté carboxylique des résidus.. (La papaïne peut être ).  [...]

peptide + feuillet beta et proprietes

est ce que je dois imaginer la zone de fixation du peptide qui servira de substrat (c'est a dire un autre morceau du peptide avec les AA que j'ai donnés) ou est ce que je dois determiner la nature de la zone de fixation de l'enzyme si c'est celle de l'enzyme je me disais qu'il faut des AA chargés + mais je ne vois pas quelle devra etre sa structuration.  [...] Je suis d'acc' pour l'idée qu'il faille des AA chargés + pour intergair avec ce peptide. Sinon, pour la structure du site actif de l'enzyme, vu que asp, val et glu ont des résidus -R assez long, on peut penser que le site de fixation soit une sorte de poche avec les résidus (-) au fond de celle ci.  [...]

collagène

Hydroxylation. Certaines enzymes hydroxylases (des peptidyl hydroxylases) agencent des groupements hydroxyles aux résidus aminoacides proline et lysine, formant ainsi respectivement de l'hydroxyproline et de l'hydroxylysine. Cette hydroxylation est absolument nécessaire pour former la triple hélice de collagène plus tard.  [...] L'étape finale fait intervenir une dernière enzyme oxydase, la lysyl oxydase, qui oxyde les résidus hydroxyls en groupes aldéhydes des résidus hydroxylysyls et hydroxyprolyls. Les molécules de tropocollagène peuvent alors s'assembler en fibrilles (polymérisation), par formation de liaisons covalentes.  [...]

[Biochimie] Rendement et facteur de purification

RDT. Quelle est l'efficatité de ma purification en pourcentage Ou si tu veux Quelle est ma perte d'activité liée à la purifaction en %.  [...] si tu veux, l'activité spécifique désignant la quantité d'enzyme quil faut pour une activité totale tant, en la purifiant, tu enleves les résidus pesant dans la protéine, donc je suppose que en purifiant, tu as augmenté son activité spécifique, donc le facteur de purification désigne le gain que tu as eu en efficacité.  [...]

[Biochimie] PFK-2 et FBPase-2 (enzyme bifonctionelle glycolyse) incompréhension

Le Glucagon qui est une hormone peptidique (29 résidus) sécrété par les cellules alpha des ilots de Langerhans qui ce trouve dans le Pancréas va se fixé sur les récepteurs membranaires spécifique aux glucagons par exemple au niveau des hépatocytes ( cellule du foie) ça va induire une cascade de réaction ( un peu flemmard pour tout décrire) mais mon problème se trouve au niveau de la PKA (Protéine Kinase AMPc Dépendante) je sais que les enzymes du catabolisme sont activés par phosphorylation contrairement aux enzyme de l'anabolisme qui elles sont inactivés par phosphorylation ici ça concerne l'enzyme bifonctionelle qui se trouve dans la 2 ème réaction irréversible spontané de la glycolyse je parle de la réaction qui amène a la formation de fructose 2,6 biphosphate.  [...] Par exemple, l'arginine peut être phosphorylée lorsqu'elle est sous forme libre (du coup ce n'est pas une modification post-traductionnelle comme ça peut l'être pour S, T ou Y). L'arginine-phosphate constitue un réservoir énergétique grâce à sa liaison au phosphate.  [...]

[Biochimie] Enzyme

Un polypetdide possède deux lysines, deux arginines et deux méthionies internes, combien de peptides prévoit-on d'obtenir après la digestion par la trypsine.   [...] Bonjour, un Peptide contient entre 2 à 100 résidus, une protéine contient un taux de résidu supérieur à 100, un Polypeptide est une Protéine. Il faut savoir que la Trypsine est une enzyme qui clive à droite de résidu basique comme l'Arginine,Lysine,Histidine alors tu obtiendrais 2 Résidus Lysine et 2 résidus Arginine.  [...]

[Biochimie] Question rapide feuillet bêta

Même si la liaison peptidique est plane, dans un brin bêta, la chaine polypeptidique s'organise de façon à avoir les résidus d'a.a. tête-bêche.  [...] Le feuillet bêta, reposant bien sur la présence de liaison hydrogènes entre les brins bêta, aura plutôt tendance à ressembler à un éventail, c'est à dire une succession de crête et de creux. J'aurai tendance donc à dire que ce type de structure est bien tri-dimensionnelle.  [...]

[Biologie Cellulaire] Protéines et liaisons convalentes entre 2 résidus soufrés

Il est inscrit dans un QCM, en tant que item vrai, que la forme protéine Prion est stabilisée par des liaisons covalentes qui s'établissent entre deux résidus soufrés.  [...] Ce QCM porte sur une partie d'un livre qui parle de la conformation des protéines et rapidement de la protéine Prion. or, il n'est inscrit nulle part dans cette partie du livre que les protéines -ou que la protéine Prion- est stabilisée par des liaisons covalentes entre résidus soufrés.  [...]

[Biologie Moléculaire] liaison acide aminé

Oui mais la question etait precise, le radical d'un acide aminé avec le radical d'un autre acide aminé par une liaison peptidique*, or avec vton exemple, c'est un pont disulfure non.  [...] Ah, si, un exemple. la polymérisation de la fibrine qui résulte de la formation de ponts amides interbrins entre des résidus lysines et glutamines. La liaison formée est dire isopeptidique.  [...]