• Forum - Lecture, Signaux, Séquence

coiffe et queue polyA traduite ?

Au départ, alors que l'ARNm est naissant, elle va recruter le complexe HCE qui va ajouter le cap en 5' et à la fin, à la lecture des signaux polyA sur la séquence lue, le complexe SR/pA est recruté (bien sûr HCE n'est plus là) et va cliver l'ARNm au site de clivage et polyAdényler (150-200 A) l'extrémité 3'.  [...] -Modèle allostérique, dans lequel la RNApolII est très processive tout le long de la transcription, sauf une fois les signaux polyA passés. L'affinité pour l'ADN va ainsi diminuer et favoriser la libération de la PolII. Il y a forcément une exonucléase dans ce modèle mais qui n'est pas responsable de la libération de la PolII.  [...]

méthode de pyroséquençage

De plus, comme il y a plusieurs copies de la séquence dans un puits, il y aura plusieurs signaux-lumières simultanés, non Ou bien il y a seulement une seule polymérase.  [...] , comme il y a plusieurs copies de la séquence dans un puits, il y aura plusieurs signaux-lumières simultanés, non Ou bien il y a seulement une seule polymérase.  [...]

[Biologie Moléculaire] analyse southern et northern blot

Chez les individus atteints, je retrouve deux signaux en southern ( au lieu d'un chez les individus sains). les signaux étant les mêmes ( sain/ malade) en northern on a donc supposé que la mutation avait lieu sur une séquence nucléotidique qui était supprimé par excision.  [...] Le problème, c'est qu'en western, chez un individu malade on observe aucun signal...pas d'hybridation avec la protéine. Je n'arrive pas a comprendre comment a partir des mêmes ARNm on obtient des protéines différentes.  [...]

Protéines de liaison de signal

Ca ne peut pas être la c) parce que le mannose n'est pas une protéine mais la réponse donnée est la b) et je ne comprends pas pourquoi c'est la b). Je pensais que la particule de reconnaissance du signal (dans l'adressage des ribosomes au RE) allait s'accrocher à la séquence signal et qu'ensuite la séquence signal s'accrochait au translocon pour que la protéine soit transloquée vers la lumière du RE mais visiblement non.  [...] La PRS va se lier au signal présent sur l'extrémité N-ter de l'ac aminé, et cette même PRS va se lier à un récepteur présent sur le RE, qui va reconnaitre spécifiquement une région de la PRS, et ensuite seulement le Ribosome lui même va se fixer sur le translocon.  [...]

[Biologie Moléculaire] Séquençage à très haut débit

Pour ce qui est du résultat, en fait dans la machine un capteur d'image prends une photo à chaque incorporation de nucléotide dans le milieu. Si le nucléotide est présent, la polymérase l'incorpore et il y a donc production ensuite d'un signal lumineux (principe classique du pyroséquençage).  [...] Ensuite on fait la PCR en émulsion, donc sur chaque bille. Et au fur et à mesure de cette PCR par ajout de nucléotide on connait la séquence. A chaque fois on sait qu'elle nucléotide on rajoute et ainsi, si à la photo il y a de la lumière, c'est que le nucléotide incorporé à l'instant dans la copie en cours était bien celui qu'on a ajouté dans le milieu c'est comme cela qu'on connait l'enchaînement parce qu'après tout la lumière dit qu'li y a incorporation, mais il faut forcément connaitre le nucléotide rajouté pour connaitre la séquence, non.  [...]

EXON et concensus de Kozak

Pour exon/intron il faut identifier les signaux d'excision dans la séquence.. pas toujours facile. Cf les différentes classes d'introns.  [...] Hum identifier les séquence d'excision des introns, j'ai rien dessus dans mon cours par contre j'ai chercher et j'ai trouver la chose suivante.  [...]

[Biotechnologie] Analyse FISH

Je suis actuellement en train de lire un article et je ne comprends pas la partie me parlant de l'analyse FISH qui permet apparement de mettre en évidence des régions mutées. S'agit il d'une technique semblable au southern blot.   [...] Donc une sonde sensée s'hybrider à la région WT s'hybriderait mal à la séquence comportant une mutation ponctuelle, pas du tout en cas de délétion, on obtiendrait plusieurs signaux en cas de duplication...etc.  [...]

[Biologie Cellulaire] Lecture de l'ADN

Il existe dans les cellules différents états de l'ADN. Ces états correspondent à des formes compactées ou relaxées. Pour lire un gène, il faut que de gros complexes de lecture (de transcription) reconnaissent des séquences d'ADN spécifiques et se fixent sur le gène.  [...] C'est un premier point. Ensuite, un gène précis peut être relaxé, donc potentiellement lisible. Cependant le complexe de lecture peut être empêché de se fixer, par la présence d'un complexe de répression. Comme tout à l'heure, certains signaux pourront entrainer la fixation ou le relargage des complexes de répression, en fonction de la situation.  [...]

queue poly A chez les procaryotes

il est bien connu que l'ARNm des eucaryotes subi une modification post transcriptionnelle. l'ajout d'une queue polyA, mais ce n'est pas le cas chez les procaryotes. Pourtant un des signaux de la fin de transcription procaryote est une longue séquence poly A sur le brin matrice.  [...] La reponse la plus simple est qu'etant un signal de terminaison, cette sequence n'est que partiellement transcrite. Donc on ne retrouve pas son integralite sur l'ARNm. De plus si je me souviens bien ce n'est pas une suite ininterompue de A que l'on trouve mais plutot une region riche en A/T.  [...]

brin+ brin-?

- Celui que l'on appelle le brin +, c'est le brin que l'on représente en 5'-3' le plus souvent, le brin sens parce qu'on peut plus facilement y repérer les codons, les signaux d'initiations et de terminaison transcriptions/traductions. Il s'agit du brin codant, qui a la même séquence que ton ARNm.  [...] -Le brun - ou brin antisens est celui qu'utilise l'ARN polymérase comme matrice (je parle de brin matrice) pour transcrire en séquence ARN celle que tu lis sur le brin codant.  [...]