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[Biologie Moléculaire] BAC alignement

La phrase est la suivante...we performed alignments between small set of paired BAC end sequences from sperm DNA and a large dataset of whole genome sequencing that were generated fro, liver DNA of a different animal. PCR primers were developped for 7 BACs that yieled long reads for both read ends and further yieled no strong alignment to the WGS database.  [...] Je comprends pas du tout lorsqu'ils disent paired BAC end sequences from sperm DNA... ça veut dire qu'il prennent uniquement des séquences terminales Je sais pas comment marche un alignement ou comparaison de séquences avec des BAC et donc j'arrive pas à comprendre la phrase.  [...]

compter des cellules/marquer de l'ADN/transgenese

Il te suffit de faire une construction dans laquelle tu encadres ton ADN d'intérêt, par 2 séquences présentes chez le porc. Tu auras une recombinaison homologue et une insertion site spécifique entre ces 2 séquences sur le génome de ta bestiole. Ca se passe par linéarisation interne ou externe, à savoir qu'une linéarisation externe est mieux pour la stabilité qu'une linéarisation interne (car dans ce dernier cas tu peux de nouveau avoir des recombinaisons homologues après ton insertion.).  [...] Il te suffit de faire une construction dans laquelle tu encadres ton ADN d'intérêt, par 2 séquences présentes chez le porc. Tu auras une recombinaison homologue et une insertion site spécifique entre ces 2 séquences sur le génome de ta bestiole.  [...]

[Biotechnologie] Principe de la PCR

d'ADN matriciel contenue dans l'échantillon PCR n'aura pas varié. En revanche, la quantité de la ou des séquences amplifiées (l'ADN d'intérêt).  [...] Le produit d'une PCR est constitué d'un ou de plusieurs fragments d'ADN (la ou les séquences d'intérêt). La détection et l'analyse des produits.  [...]

adn

Oui enfin on est composé de quelques cellules donc la proportion de ces cellules particulières restent infimes. La probabilité que l'on en prélève est TRES faible. Ensuite vous extrayez. Rebelote, on extraie jamais vraiment tout l'ADN, avec un kit, on estime que ça tourne au maximum autour des 60% d'ADN total récupéré, donc on réduit encore les chances de le récupérer.  [...] Après ça vous faites vos analyses. L'ADN de ces cellules particulière, et j'ai presque envie de dire cette cellule, va être noyé dans le bruit de fond, complètement couvert par toutes les autres séquences identiques.  [...]

[Biologie Moléculaire] Principe de la LM-PCR

La LM-PCR est utilisé pour la technique de ChIP on Chip qui a été developpé afin de rechercher les sequences nucléotidiques associées a une protéines d'interet (Facteur de transcription) sur tout le génome. Elle permet d'amplifier les sequences d'ADN intergéniques coimmunoprécipité lors de la ChIP de séquence inconnue.  [...] Tu fait la meme chose avec un autre fluorophore pour l'ADN total non coimmunoprécipté lors de la ChIP et t'hybride le tout sur une puce possédant une banques de séquences intergénique et le tour est jouer.  [...]

[Biologie Cellulaire] Lecture de l'ADN

Il existe dans les cellules différents états de l'ADN. Ces états correspondent à des formes compactées ou relaxées. Pour lire un gène, il faut que de gros complexes de lecture (de transcription) reconnaissent des séquences d'ADN spécifiques et se fixent sur le gène.  [...] 1) Il existe aussi en plus de la condensation de l'ADN, des séquences régulatrices en amont du début des séquences de gènes qui induisent une répression ou une transcription de ces gènes. Voici un cours qui résume tous les mécanismes jouant sur (régulant) l'expression génétique.  [...]

Drépanocytose

Une autre voie consiste à sequencer la totalité du genome (ADN) de drépanocytaires. Ceci aurait pour avantage de comparer les génomes entiers de drepanocytaires faisant beaucoup de crises avec ceux en faisant peu, afin de trouver quelles differences seraient responsables de crises moindres chez les seconds, et d'identifier par là de nouvelles cibles pour de futures thérapies.  [...] Ca pourrait être intéressant, mais ce travail est terriblement fastidieux et devra utiliser des programmes très élaborés et surtout de nombreuses séquences e patients afin de cibler des gènes d'intérêt de manière statistiquement fiable. Mais peut-être que dans quelques années, les progrès technologiques aidant, comme le dit l'article, la séquence de l'ADN complet d'un individu sera plus rapide et moins couteuse.  [...]

[Biochimie] TPE PCR en temps réel, interprétation.

La police utilise la PCR-STR, est-ce bien une PCR en temps réel puisque les séquences STR ( les zone intéressante que multiplie la PCR ) sont révélées avec de la fluorescence.  [...] Après ça dépend quel chimie ils utilisent, mais la fluorescence ne révèle pas forcément que les séquences d'intérêt, elle peut aussi simplement révéler tout double brin d'ADN sans discrimination.  [...]

[Biotechnologie] la création variétale

souvent des microsatellites (séquences courtes d'ADN). On considère les marqueurs déjà identifiés qui bordent la région qui intéresse le sélectionneur, c'est-à-dire le QTL d'une variété donneuse qu'il cherche à introgresser dans un fond génomique d'une autre variété receveuse par recombinaisons successives.  [...] L'objectif du sélectionneur, le plus souvent, est d'éliminer les séquences d'ADN parasites de la variété donneuse autour du QTL d'intérêt, pour affiner son introgression. c'est-à-dire n'introgresser que le QTL, avec un objet de pureté de 97%. Les marqueurs sont donc un outil de quantification idéal, puisqu'ils permettent de suivre la disparition progressive au cours des recombinaisons de certains marqueurs éloignés du QTL, et de la conservation de ceux qui sont les plus proches.  [...]

La PCR fragments d’adn

Je crois avoir compris ta remarque. Dire que l'on s'intéresse à l'ADN non codant, c'est dire que l'on va chercher à amplifier spécifiquement ce type de séquences. ça n'empêche pas ton échantillon de départ de contenir des millions d'autres séquences (tout ce qui reste d'ADN non codant + ADN codant.  [...] Et pourtant les ARN non codants sont des instructions pour la cellule. Je dis ça parce que vous disiez précédemment vous intéresser à l'ADN qui ne comporte pas d'instructions, c'est-à-dire laisser tomber tout ce qui va donner des ARN non codants alors que ces séquences sont potentiellement utilisées en criminologie vu qu'elles font partie de l'ADN non codant.  [...]