• Forum - Interactions, Facteur, ADN

[Biologie Moléculaire] Gel de retard

Eske je peut trouvé quelqu'un qui peut m'expliquer la nature des interaction qui s'établissent entre ADN/protéines ARN/protéines lors de la migration sur un gel de retard.. merci d'avance.  [...] Il peut s'agir d'un des nombreux types d'interactions entre facteur de transcription et l'ADN (helice boucle hélice, zinc finger, glycine zip,...), de la reconnaissance par un acide nucléique complémentaire de la séquence qui ferait part d'un complexe, etc.  [...]

[Biologie Moléculaire] Compartiment nucléaire ...quelle importance ???

Les procaryotes sont des unicellulaires en générales comme les protistes, les bactéries... et ces micro-organismes n'ont pas une forte activité et complexité pour leur rôle y destinés, comme les pluricellulaires Eucaryotes tel les plantes, animaux.   [...] concentrer certaines molécules en un endroit et permettre de faciliter les interactions (ADN/Facteurs de transcriptions par exemple).  [...]

[Biologie Moléculaire] ChIP on chip

On peut utiliser la technique ChIP on Chip pour identifier les interactions protéines - ADN. Je me pose quelques questions quant à l'utilisation de cette méthode. Une fois qu'on obtient nos séquences d'ADN où étaient fixées nos protéines d'intérêt fait-on une PCR ou on peut hybrider directement sur la puce Quelles séquences sont utilisées sur notre puce (des facteurs de transcription) afin d'hybrider nos séquences qui contenaient nos protéines.  [...]

[Biologie Moléculaire] le silençage de gènes ou genes silencing

Je me demandais pourquoi le silençage de certains gènes au niveau de l'ADN n''est pas toujours associé à la méthylation des CpG.  [...] Il y'a aussi des causes moléculaires, dues aux interactions des molécules sur les sites de la transcription (enzymes, facteurs de transcription, autres protéines), et des causes topologiques, mettant en jeu la facilité avec laquelle les facteurs de transcription accèdent aux gènes selon la forme que prend la molécule d'ADN.  [...]

[Biologie Moléculaire] Criblage d'une banque d'ADNc

Une autre partie de l'explication réside dans l'application de la banque d'ADNc. Tu auras toujours besoin d'une telle banque pour des cribles d'intéraction, de fonction, etc.  [...] je parlais des fonctions et des intéractions si on veut par exemple savoir quelle sont les protéines qui s'expriment dans X condition on peut le savoir à partie des ARNm marqués dans les deux conditions différemment (a jeûn et nourris, par exemple) et avec une puce à ADN on peut voir les intéractions pareille pour la fonction sauf quand utilise le northern blots(avec la sonde radioactifs).  [...]

[Biologie Moléculaire] Liaisons Hydrophobes et ADN

Alors les liaisons hydrophobes, tu pourras trouver facilement toute la doc dont tu as besoin sur internet. Mais en gros ce sont les groupements hydrophobes qui se regroupent pour minimiser leur exposition à un environement aqueux, ils se regroupent pour fuir l'eau en qlq sorte.   [...] A partir de là tu n auras pas de mal a imaginer que l' ADN en particulier les bases comportent les cycles qui sont tres hydrophobes et interagissent entre eux par empilement. ce sont les interactions de stacking. Ces interactions, contrairement à ce qu on pense contribuent largement plus à la stabilité de l ADN db que les liaisons hydrogenes.  [...]

[Biologie Moléculaire] Peux t-on remplacer l'ADN de sperme de saumon par l'ADN d'une autre espèce ?

je comprends pas les interactions non specifiques sont la plus part du temps dues a des interaction electrostatiques ou hydrophobes. La séquence de l'ADN utilisé comme bloqueur n'a aucun interet.  [...] Par contre Yoyo, je suis intéressé par ce que tu dis au niveau de l'interaction entre ARN et la solution de blocage par ADN génomique. Penses-tu vraiment que ce sont des interactions non spé (i.e. indépendamment de la séquence).  [...]

Mode d'action du carmin (carmin acétique, carmin vert d'iode)

Quelqu'un saurait-il quel est le mode d'action du carmin dans sa coloration des noyaux/chromosomes (carmin acétique), et de la cellulose (carmin vert d'iode) Comme je fais dans le même TP le carmin acétique et le carmino-vert d'iode, je sens que mes étudiants vont être un peu embrouillés si je ne dépatouille pas ça un peu.   [...] Ben... ca permet d'expliquer, effectivement, la coloration de l'ADN. Je suppose qu'il doit y avoir des interactions ioniques entre l'ADN et le colorant (quoique... au pH du carmin acétique, je ne suis pas certain que l'ADN ne soit pas protonné...).  [...]

[Biologie Moléculaire] P53 et réparation de l'ADN

Mis bout à bout, ces différents domaines correspondent au portrait classique d'un facteur de transcription oligomérique. Mais ce découpage topographique révèle que chaque domaine peut aussi servir de site d'accrochage pour des protéines cellulaires telles que mdm-2 (dans le domaine de transactivation) ou p53BP2 (p53-binding protein 2, dans le domaine de liaison à l'ADN).  [...] Ces interactions sont particulièrement nombreuses dans la portion carboxyterminale, où se lient des protéines impliquées dans la réponse au stress (Hsp70), la réparation de l'ADN (ERCC3) et sa réplication (RPA). Par ces multiples interactions, p53 peut agir autrement qu'en activant la transcription de gènes cibles.  [...]

[Génétique] kit qiagen

Ceci dit, à peu de choses près, on sait tous ce qu'il y a dans les solutions des kits surtout pour une technique aussi simple que l'extraction de plasmides. Dans les tampons de lyse tu as du SDS et de la soude (pH 12-13), dans la seconde solution de neutralisation tu as un agent acide, les solutions de lavages sont à bases d'alcool, le TE est du Tris-EDTA et la colonne contient une résile en silice.   [...] L'ADN interagissant avec la silice par des interactions polaires, un solvant polaire comme l'eau élue l'ADN (certain kit Qiagen utilise simplement de l'eau pour l'élution), pour les lavages, l'alcool permet ainsi le maintien de l'ADN sur la silice.  [...]