• Forum - Interactions, ADN, Protéines

[Biotechnologie] Techniques éléctrophorétiques et fonctions des protéines

les techniques d'électrophorèses servent à séparer les protéines en fonction de différents paramètres, taille et charge par exemple (ou dans certains cas à mettre en évidences des interactions ADN/Protéines...) mais elles ne peuvent pas renseigner sur la fonction.  [...] Pour cela il faut avoir accès à d'autres informations comme la séquence et la comparée avec celles de protéines déjà connues ou encore ce que provoque l'inactivation de la protéine dans une cellule/organisme.  [...]

UV footprinting

Je prépare un exposé sur les intéractions ADN-protéines et plus précisément sur les footprinting par UV.  [...] Si mes sources sont bonnes, la T4 endonucléase V clive l'ADN au niveau des dimère cyclobutyliques de thymines grâçe à ses activités glycosylases et AP lyases.  [...]

[Biochimie] pH de l'ADN

Les bases de l'ADN ne sont pas basiques contrairement a ce que leurs nom pourraient indiquer, (les atomes d'azotes qui pourraient capter des H+ et donc être basique, ne peuvent en fait pas capter les H+ car leur doublet non liant est pris dans délocalisations d'électrons du cycle).  [...] on peut changer le pH du milieu et lors de ce changement l ADN va subir qlqs modifications( concernat les charges... protonation deprotonation,,,, ).  [...]

[Biologie Moléculaire] P53 et réparation de l'ADN

Pour le vérifier, ces domaines peuvent être découpés, interchangés, insérés dans d'autres protéines ou analysés comme des entités distinctes. Appliqué à p53, ce découpage linéaire a permis d'identifier 4 grandes fonctions, chacune localisée dans un fragment distinct de la molécule (figure 1 haut).  [...] Ces interactions sont particulièrement nombreuses dans la portion carboxyterminale, où se lient des protéines impliquées dans la réponse au stress (Hsp70), la réparation de l'ADN (ERCC3) et sa réplication (RPA). Par ces multiples interactions, p53 peut agir autrement qu'en activant la transcription de gènes cibles.  [...]

[immunologie] Réaction antigène-anticorps

Chip (et non ship) est le terme anglais pour puce. Il existe des puces à ADN pour étudier les hybridations, des puces à protéines pour les interactions protéiques dont par exemple les interactions Ag/Ac. Sur une surface fonctionnalisée, l'Ag (pour cribler des Ac) ou des Ac pour indentifier des Ag sont liés chimiquement.  [...] Sur cette surface fonctionnalisée est ensuite envoyé l'échantillon à tester. Suivant le marquage (fluorescent souvent) et à l'aide d'une caméra de détection et d'un logiciel d'analyse d'image, il est possible de visualiser les spots qui réagissent...plusieurs milliers de spots peuvent être déposés sur une lame.   [...]

[Génétique] Fonctionnement biochimique dominance et récessivité des allèles

J'aimerais savoir ce qui se produit au niveau biochimique lorsque qu'on est en présence de 2 allèles un dominant et un récessif d'un gène. est-ce que la dominance se traduit par une inhibition de l'expression de l'allèle récessif sur le chromosome homologue, ou est ce que les deux protéines (codées par le gène étudié) sont produites mais l'une d'elle interagit préférentiellement et exprime le phénotype associé.  [...] Donc les allèles dominants comme récessifs sont forcement transcrit+traduit dans la cellule, et c'est ensuite les interactions inter-protéines produites qui vont produire le phénotype dominant Il n'existe aucune régulation sur l'ADN.  [...]

diagnostic prénatal technique

Pour le diagnostique, on fait souvent (je pense) des PCR suivies de séquençage pour un certain nombre de gènes connus pour être impliqués dans certaines maladies. Il existe aussi des puces à protéines (même principe que les puces à ADN pour caractériser les interactions protéiques).  [...] Cependant, elles ne sont pas ultime, car elles manquent de sensibilité, et ne sont normalement pas capable de détecté un simple changement de base (A en T par exemple), qui peut être catastrophique pour la fonction de la protéine. Mais tout ceci concerne la recherche.  [...]

[Biologie Moléculaire] Criblage d'une banque d'ADNc

Une autre partie de l'explication réside dans l'application de la banque d'ADNc. Tu auras toujours besoin d'une telle banque pour des cribles d'intéraction, de fonction, etc.  [...] je parlais des fonctions et des intéractions si on veut par exemple savoir quelle sont les protéines qui s'expriment dans X condition on peut le savoir à partie des ARNm marqués dans les deux conditions différemment (a jeûn et nourris, par exemple) et avec une puce à ADN on peut voir les intéractions pareille pour la fonction sauf quand utilise le northern blots(avec la sonde radioactifs).  [...]

Expression de gènes

Enfin, le système d'épissage des ARN messager permet de faire augmenter énormément le nombre de protéines différentes ainsi que leur fonction. Sans compter les modifications post-transcriptionnelles... Heureusement, tous les gènes ne sont pas exprimés en même temps dans la cellule, seul une petite partie.  [...] Plus sérieusement, il m'arrive de devoir identifier des protéines suite à des analyses. Si je me contrefiche du niveau ADN et ARN, la structure de la protéine, ses interactions probables et sa fonction m'intéressent beaucoup plus. Je n'utilise donc pas tout les jours cette database. Mais vu qu'elle est toujours utile.  [...]

[Biologie Moléculaire] stabilité ADN

Et tous ceux qui se sont amusés à faire des extractions d'ARN te le confirmeront, pour plein de raisons aussi bien chimiques que biochimiques, l'ARN a de façon générale une demi vie beaucoup plus courtes que l'ADN.  [...] Les protéines du type Rec A chez les procaryotes ou Rad 51 chez les eucaryotes se lient à l'ADN et déforme la double hélice en en étirant le pas. Cet étirement rompt les interactions hydrophobes entre bases consécutives de la séquence et permet ainsi la rotation (Nishinaka et al 1998) Du fait son encombrement stérique, un groupement hydroxyle porté par le carbone 2 du sucre empêcherait cette rotation.  [...]