• Forum - Identification, Protéine, Peptides

[Biotechnologie] Maldi-tof ms

bonjour tout le monde, pourquoi on ne peut realiser un PMF ( empreinte peptidique massique) que lorsque le génome est complétement identifié.  [...] Pour faire de l'identification de proteine en partant d'une partie des peptides de cette proteine (ce qui est fait en sequençage proteique) il faut avoir un patron contre lequel aligner les peptides identifiés, i.e un génome.  [...]

[Biochimie] séquençage d'une proteine

voila dans l'article les auteurs ont procéder à une digestion enzymatique d'une protéine par la trypsine et par la Asp N. Ensuite ils ont fait une analyse des peptides par HPLC couplé à un spectromètre de masse en tandem. Ce que j'ai pas compris c'est comment en premier temps on identifie les acides aminé sur le profil d'élution de HPLC et comment on determine l'ordre de chaque acide aminé cad comment savoir que c'est une tyrosine et non une lysine ou cysteine et comment on détermine qu'il ya une tyrosine ensuite une methionine ensuite une leucine dans notre peptide.  [...] Ici, je suppose qu'il s'agit de l'identification d'une protéine. Donc, pour commencer, ils digèrent la protéine avec différentes protéases, ce qui génère plusieurs peptides. Ces peptides sont ensuites séparés par HPLC, où la colonne est couverte de chaînes de carbone (C18 ici).  [...]

Le Lait de vache : véritable poison ?

La dégradation des protéines n'est certainement pas totale dans l'estomac. Si un certain nombre sont dénaturées par l'acidité avec perte des caractéristiques de repliement pour permettre l'attaque enzymatique, toutes ne sont pas aussi sensibles. Pour citer un exemple que je connais assez, l'interleukine-2 (qui n'est pas vraiment une protéine alimentaire courante je le concède bien volontiers) supporte très très bien un séjour à pH très acide (0.  [...] Une protéine qui a commencé à être digérée en peptides peut avoir de nouvelles activités biologiques liées à ces peptides avec liaison possible à des récepteurs spécifiques. (Penser à la POMC et aux différentes hormones peptidiques qui résultent de son découpage).  [...]

[Biochimie] Méthode d'études AA et protéines

Pour séquencer une protéine il faut bien sûr l'isoler et la purifier avant, mais ce sont pas des techniques de séquençage proprement dites.  [...] En fait, grâce aux hydrolases par exemple, dont tu connais les sites de coupures, tu vas pouvoir générer différents peptides à partir de la même protéine. Après le séquençage de ces différents peptides, tu vas pouvoir recouper les informations car certains peptides vont se chevaucher. Tu obtiendras ainsi ta séquence primaire.  [...]

influence des peptides signaux sur la sécrétion des protéines

J'ai supposé que c'était peut être parce que le peptide signal n'est pas clivé après la translocation de la protéine, ce qui gène la sécrétion.  [...] Mais je peux donner quelques informations. il s'agit d'un domaine extracellulaire d'un récepteur membranaire. Il y a modification post-traductionnelle (glycosylation surtout). Il y a pas de clivage ou autre de la protéine qui pourrait s'apparenter à un mécanisme comme celui pour l'insuline.  [...]

[Biochimie] acide aminée absorbtion

les acides aminés ne sont pas forcement absorbés tous en même temps car les protéines doivent être protéolysée pour libérer les acides aminés qu'elles contiennent donc le temps peut être variable.  [...] On ne parle plus vraiment de protéine au niveau intestinal mais de peptides (protéine fragmenté pour faciliter la digestion).  [...]

[Biologie Cellulaire] Synthèse des protéines

Oui, l'initiation de la traduction débute toujours dans le cytosol. Le peptide signal est synthétisé en début de séquence par le ribosome. Dans le cas de la mitochondrie au moins, la Hsp70 vient chaperoner le reste de la séquence protéique au fur et à mesure de la traduction (via des groupements -SH) afin de garder la protéine linéaire pour son passage dans la mitochondrie.  [...] Oui ces peptides signaux sont synthetises dans le cytosol car sans eux la proteine ne pourrait atteindre d'autres compartiments.  [...]

[Génétique] transfection

Voilà dans le cadre d'un projet en apprentissage je dois rendre un rapport sur les differentes méthode de transfection. Le probleme c'est que je ne sais pas par quoi commencer donc si pouviez me donner un petit coup de main en me donnant des adresses internet ou en me disant ce que vous savez sur la transfection leurs avantages, leurs inconveniant etc.   [...] traverser la membrane plasmique et entraîner le reste de la protéine. Les trois peptides les plus.  [...]

[Biochimie] Calcul de concentration de la protéine dans un échantillon (Exo L1)

le tampon de stockage utilisé et les autres acides aminés présents dans la protéine n'absorbent pas signifcativement la lumière UV à 280 nm.  [...] Enfin, pour la dernière question, l'hydrolyse acide d'une protéine a pour rôle de cliver la protéine en peptides. est-ce que cette méthode impacte sur la concentration en acides aminés que tu analyses ensuite.  [...]

[Biologie Cellulaire] Peptide signal

Mais ensuite au cours de sa vie, une protéine peut changer de localisation, typiquement les facteurs de transcription et ceci indépendamment de ce peptide signal de départ qui, si je ne me trompe pas, est souvent clivé lors de la maturation des protéines.  [...] Mais dans le cas d'une protéine résidente du REG par exemple, si le peptide signal est clivé lors de la maturation, comment peut-elle arrivée au compartiment adressé Ce que tu dis la n'est pas, seulement, valable pour les protéines de types hormones telles que l'insuline Car dans le cas de cette hormone, il y a bien clivage des peptides signal lors de la maturation mais dans le cas que j'ai cité ce n'est pas possible, si.  [...]