• Forum - Hydrogène, Résolutions, Protéines

[Biochimie] PDB et Cristallographie

Il peut y avoir des zones dans la structure des protéines qui sont très dynamiques. Cela peut engendrer la formation d'un cristal de plusieurs conformères. La base de la résolution cristallographique étant la répétitivité de la même structure, s'il y a des variations à un endroit, la résolution sera donc impossible pour cette zone.  [...] Pour compléter ce que dit LXR, il faudrait une résolution d'environ 0,5 A pour voir les atomes d'hydrogène or les meilleures résolutions obtenues pour des protéines sont d'environ seulement 1 A. Les hydrogènes présents dans les structures sont donc rajoutés, il est possible de calculer leurs positions si on connait l'emplacement des autres atomes.  [...]

[Biochimie] Hplc

La colonne est polaire avec un gel de silice modifié ou non. Cette colonne va donc retenir les composés polaires par liaisons hydrogènes. C'est donc une des méthodes les plus rapides et avec une des meilleures résolutions pour séparer des composés.  [...] Après il faut savoir qu'il existe RPHPLC pour Chromatographie d'adsorption en phase inverse qui repose sur le même principe que la HPLC mais on utilie une phase apolaire et hydrophobe. La RPHPLC est beaucoup plus utilisé que la HPLC (notamment pour la dégradation d'Edman et donc déterminer la composition en acide aminé d'une protéine).  [...]

La microscopie à 2 photons et le mouvement des proteines

Ou les auteurs visualisent sans fixation le mouvement d'une protéine cytoplasmique en temps reel, grace a deux techniques de microscopie. Le FRAP et microscopie à 2 photons.  [...] En utilisant la microscopie confocale simple ou a 2 photons, on peut aussi visualiser en temps reels l'interaction de deux proteines dans une cellule au cours d'un evenement biologique (technique de FRET). Ces techniques (FRET, FRAP, FLIP...), ont revolutionne la facon de penser les processus biologiques (et tout ca, essentiellement grace a la caracterisation d'une proteine naturelle fluorescente extraite d'une meduse, la GFP).  [...]

Combien de couleurs voient les yeux ?

Si on zoom avec un microscope optique, le grossissement fera apparaitre des détails, mais si l'oeil n'est capable de discerner que 256 tons de rouge et que l'objet observé a une longueur d'onde qui ne fait pas partie de ces 256 tons de rouge, l'oeil ne verra pas cette couleur et le cerveau s'adaptera en lui donnant une impression d'un rouge le plus proche, parmis ces 256 tons.   [...] Si un pixel d'une certaine longueur d'onde est émis par l'écran et que les batonnets de la rétine ne sont pas conçus pour distinguer cette longueur d'onde, alors il envera un message sans information et le cerveau completera par une information qu'il jugera correcte, comme il le fait la plupart du temps quand il corrige une illusion d'optique sans que nous nous en rendions compte.   [...]

[Biologie Cellulaire] Microscopie

Hum, bah je suis pas assez calé en optique pour utiliser le terme de résolution..J'aimerai quand même bien que quelqu'un vienne valider ou non ce que je dis, mais oui, ce que j'en comprends, c'est que ayant une faible profondeur de champs, une photographie unique nous permet d'avoir une image sur un plan unique, c'est à dire sans avoir l'image floue de ce qui se trouve devant et derrière ce plan.  [...] pour les coupes en Z, c'est la lame qui bouge avec un système piézo electrique qui permet des résolutions inférieures au micromètre.  [...]

[Divers] [Méthodologie] Pouvoir de résolution d'un microscope électronique...

Cela concerne les microscopes électroniques à transmission, la mesure étant faite sur des structures test bien précises et avec une HT d'accélération élevée. Lors de l'examen des coupes fines des objets biologiques on est assez loinde ces valeurs car on utilise souvent une HT moyenne pour augmenter le contraste.   [...] Je n'ai jamais fait de ME à balayage, mais la résolution est moindre. Pour démontrer la puissance de la ME, on prend la meilleure résolution théorique, obtenue en MET.  [...]

PSC1 et ...

J'ai constaté que certaines antennes de la CRF proposaient une recyclage pour le PSC1. Ne serait il pas possible d'étendre cette mesure au niveau national.   [...] Même si par expérience personnelle je dirais que les bonnes résolutions ne durent pas toute l'année... D'où l'utilité d'un recyclage pour ceux que cela intéresse.  [...]

Articles importants dans Nature, Science ou Cell - Page 6

15 angstrom resolution reveals the higher complexity of eukaryotic ribosomes, which are 40% larger than their bacterial counterparts. Our model shows how eukaryote-specific elements considerably expand the network of interactions within the ribosome and provides insights into eukaryote-specific features of protein synthesis.  [...] Sinon dans la meme ordre d'idée, on a obtenu des données de cryoEM a 5,5A pour deux ribosomes eucaryotes. Ce qui est quasiment des résolutions atomiques.  [...]

[Biologie Moléculaire] Combien d'enzymes différentes dans le vivant ?

Protein Data Bank (banque de données sur les protéines) qui recense les structures secondaires des protéines et des acides nucléiques avec une résolution inférieure ou égale à 4 angströms.  [...] Par contre, on n'a aucune résolution temporelle. En microscopie électronique comme en diffraction des rayons X, on travaille sur des protéines figées dans leur conformation la plus stable (ou une des plus stables). En RMN on travaille en solution mais ça ne change rien, le signal obtenu sera la moyenne de tous les signaux de chaque protéine et au final on n'observera que les états les plus stables.  [...]

Rectocolite Ulcero-hemorragique

eefectivement moi ca ne fait qu'un an a peine que j'ai appris que ma maladie s'est déclarée je trouve ela très dur d'aacepter le fait de vivre avec elle tous les momentsde ma vie sans solutions ni d'aide.Je suis dans le broillard le plus complet même mon médecin ne m'aide pas.   [...] Je suis habituellement une battante et une optimiste indécrotable mais actuellement, je sens mes belles résolutions fondrent comme neige au soleil et je fatigue.  [...]