• Forum - Groupements, Liaisons, Hydrogène

[Biologie Cellulaire] Domaine de liaison à l'ADN

Les protéines qui se lient plus spécifiquement à l'ADN vont plutôt reconnaître la partie variable de l'ADN cad l'enchaînement des base. Dans ce cas, les protéines établissent plutôt des liaisons hydrogène avec les bases de l'ADN. Les acides aminés les plus mis en jeu étant ceux qui établissent le plus de liaisons hydrogène cad glutamine, asparagine et arginine.  [...] Pour l'ADN, les interactions sont différentes selon la base considérée, suivant les différents groupements chimiques qu'elle possède. Elles peuvent toutes établir des liaisons hydogène mais le nombre de ces liaisons peut varier, et les atomes sont donneur ou accepteur d'hydrogène suivant les positions.  [...]

[Biologie Cellulaire] exam bio

dans quelles molécules les liaisons d'hydrogène jouent-elles un rôle important.  [...] Dans les homopolysides =. exemple de l'amylose dont la chaîne est stabilisée par les liaisons hydrogène entre les groupements hydroxyle et les molécules d'eau.  [...]

[Biochimie] Structures secondaires des protéines.

Il y a en fait une liaison hydrogène qui se forme entre l'oxygène du groupement carbonyle et l'atome d'hydrogène de l'azote situé vers le C-terminal. De ce fait, tous les groupements carbonyles pointent vers le groupement carboxyle (extrémité finale de la protéine) Regarde un schéma d'une hélice alpha avec la représentation des liaisons H pour bien visualiser. Tu t'en apercevras de suite.  [...] Pour reconnaitre un grand d'un petit sillon, tu dois regarder chaque virage(là où ça tourne ) de l'hélice. Entre 2 virages, tu as un espace, tu remarqueras que ça alterne entre un petit et un grand, ce sont les sillons majeurs et mineurs.   [...]

[Biologie Moléculaire] structure des protéines

Structure secondaire. liaison peptidique entre un atome de carbone et un atome d'azote de deux acides aminés. liaison hydrogène entre les groupements C=O et N-H de 2 liaisons peptidiques.  [...] Dois-je plus particulièrement parler des hélices alpha, brins béta et des coudes aussi ou est-ce que ça rentre dans les liaisons hydrogènes.  [...]

[Biologie Moléculaire] stabilité ADN

&Des arguments concernant la stabilité de la molécule liée à sa composition (disparition d'un groupement hydroxyle rendant la molécule plus hydrophobe et donc moins réactive en solution) et à sa structure double hélice neutralisant tous les groupements et accepteurs de liaisons hydrogène) ont été avancés.  [...] Les protéines du type Rec A chez les procaryotes ou Rad 51 chez les eucaryotes se lient à l'ADN et déforme la double hélice en en étirant le pas. Cet étirement rompt les interactions hydrophobes entre bases consécutives de la séquence et permet ainsi la rotation (Nishinaka et al 1998) Du fait son encombrement stérique, un groupement hydroxyle porté par le carbone 2 du sucre empêcherait cette rotation.  [...]

[Biochimie] Activité alcool déshydrogénase

lors de ma manipulation, j'ai mit dans un tube du tampon glycine, de l'alcool déshydrogénase, de l'éthanol et de l'acide sulfurique.Le tout a incubé pendant 2H à 30°C puis j'ai ajouté le cofacteur NAD+. Par mesure par spectrophotométrie j'ai pu déterminer que j'avais une baisse de l'activité de l'enzyme (par rapport à une expérience précédente sans H2SO4). Moins de NADH a été formé.  [...] Je sais que la présence de groupement thiol -SH au sein de la protéine est importante pour son activité, donc est-ce que malgré que l'on soit dans du tampon, H2SO4 agirait sur ces groupements En établissant des liaisons hydrogène ou en établissant des ponts disulfures par exemple.  [...]

[Biochimie] Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques

Merci de ta réponse, en fait il s'agit de liaisons hydrogènes (j'ai oublié de le préciser) et du coup c'est bien des liaisons qui se forment entre des acides aminés polaires (présentant des groupements OH (H donneur, O accepteur) NH (N accepteur, H donneur) c=O (accepteur) N (accepteur)).  [...] 2.1. S. 2.5 et O. 3.5, or par convention on désigne comme apolaire (covalentes simples) des liaisons dans lesquelles la différence électronégativité est inférieur ou égale a 0.4). Alors qu'avec une différence d'électronégativité de 1.4, la liaison O-H est une liaison dite covalente polaire, donc capable de former des liaisons hydrogènes.  [...]

[Biologie Moléculaire] structure secondaire de l'adn

Merci pour cette réponse mais je comprend pas ce que signifie cet espece de boulier avec les accepteurs et donneur de liaison H, atome H et groupement méthtyle c'est le seul truc que j'ai dans mon cours qui parle des sillons.  [...] Les protéines devant intéragir avec l'ADN se dirigent principalement vers les grands sillons (mais peuvent aussi atteindre les petits) et créent des liaisons hydrogènes à partir des groupements donneurs et receveurs de liaison H sur les bases.  [...]

activité enzymatique : concentration en sels

Cela est du au fait que les sels stabilisent les charges des groupements R des acides aminés. Si notre protéine est alors une enzyme, elle peut utilisée ses charges por faire des liaisons ioniques ou des transferts d'hydrogènes tel que l'ARNase qui part diverses echange de protons entre deux histidines arrive à digéré l'ARN.  [...] Si tu veux savoir tu à aussi l'eau lourd qui ralentit l'activité enzymatique, comme elle est plus lourde plus d'energie doit être utilisé pour lié ses hydrogènes à l'enzyme ce qui réduit la vitesse de réaction.  [...]

[Biochimie] Question rapide feuillet bêta

les feuillets béta reposent sur des liaisons hydrogènes en C=0 et N-H entre la même chaine polypeptidique, elles imposent une conformation plane, donc bidimensionnelle.  [...] lol.. Ok. Bon un feuillet béta, on sait ce que c'est, c'est l'association de deux chaines polypeptidques par des liaisons hydrogènes entre les groupements C=0 et N-H. Donc on est d'accord pour dire qu'un feuillet béta c'est deux chaines polypeptidiques, il n'y a pas de problème lol ne nous embrouillons pas.  [...]