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[Biochimie] Méthodes de purification du lysozyme

Si tu disposes d'anticorps spécifiques (ce qui est le cas pour le lysosyme je suppose), tu peux faire une chromatographie d'immunoaffinité (les groupements chargés négativement de ta résine sont remplacés par des anticorps spécifiques de ta protéine). tu peux trouver des protocoles sur internet, en utilisant ce terme ou bien immunocapture.  [...] Les deux inconvénients majeurs sont que les conditions d'élution de ta protéines peuvent la dégrader, et surtout que ça coûte très cher comparé à la colonne échangeuse d'ions. Je n'ai malheureusement pas de chiffres à donner sur l'enrichissement et le rendement de ce genre de méthodes.  [...]

Utilisation des fluorochromes Cyanine

Dites moi, je sais que les fluorochrome cyanine sont organiques Copment peut t on les utiliser pout un marquage en cellule Est ce qu'on peut faire un marquage spécifiques avec.   [...] Ils peuvent etre fonctionnalisés avec des groupements réactifs pour pouvoir les fixer sur une protéine par exemple. Le marquage ne sera pas spécifique, il ciblera par exemple toutes les lysine d'une protéine. Ils peuvent aussi etre couplés à des brins d'ADN ou des anticorps et sont donc ensuite révélés par fluorescence.  [...]

Biochimie S.O.S :(

Cette activation enzymatique provoque une élévation de l'AMPc. Ce même AMPc est un messager intracellulaire qui exerce ses effets notamment en activant des protéines effectrices de type kinase (protéine qui agence un groupement phosphate et dépendante de l'hydrolyse d'un ATP) dépendantes de l'ATP, notamment la protéine kinase AMPc-dépendante (PKA).  [...] Dans ce cas ci, il augmente. On poursuit le raisonnement. l'AMPc augmentant, il active des protéines kinases dépendantes de l'AMPc (PKA). La protéine kinase est une protéine effectrice à activité kinase, c'est à dire qu'il s'agit d'une enzyme qui agence des groupements phosphates à d'autres protéines.  [...]

[Biochimie] Cytochrome b5

J'ai juste une derniere petite question,je pensais que le groupement hème dans le cytochrome b était situé au coeur de la proteine dans la partie hydrophobe (similiarité avec l'hémoglobine),seulement on me dit que c'est plutot en surface comme ca intéragit avec d'autres groupements.Je ne sais donc pas qui a raison.  [...] Oui moi aussi j'aurai tendance a dire que le groupement hème dans le cytochrome est situé au cSur de la protéine dans la partie hydrophobe, parce que ce n'est pas parce qu'il est au centre qu'il ne peut pas interagir avec d'autres groupements, car il ya d'autres groupements (qui sont a la surface) qui capte les électrons et qui le transfère a l'hème, d'ailleurs j'ai trouve sur Google livre, deux passages qui parle de ça.  [...]

[Biologie Moléculaire] Protéine

Une protéine peut être conciéré comme un amphotére puisqu'elle posséde des groupements chimiques basiques (lysine, arginine) et acides (aspartate, glutamate).  [...] Par contre, pour ce qui est du repliement des proteines c'est bien plus compliqué que de simple répulsion attraction. Le premier phénoméne d'un point de vue énergétique est l'augmentation de l'entropie de l'eau lorsque la protéine se replie. Ensuites, des intéractions électrostatiques de type liason hydrogéne permettent la formation de structure secondaire (hélice, feuillet).  [...]

[Biologie Cellulaire] Comparons la cellule à une usine !

Le RE a énormément de rôles. Là c'est dur de faire simple mais je dirai machine de maturation du produit(pour le REG) et machine de production de briques(pour le REL) En effet le REL synthétise les lipides de la membrane cellulaire. N'oublies pas que les protéines sont à la fois synthétisées par la cellule et unités fonctionnelles de la cellule.  [...] Bah, les ribosomes ils assemblent les acides aminés pour la bonne séquence d'une protéine. Mais une protéine doit être modifiée pour être fonctionnelle. Sa structure mise en place, ajout de groupements de sucre ect.. Tout ceci c'est fait par.. des protéines déjà fonctionnelles.  [...]

[Génétique] manipulation génétique

Pour exemple, une fois une protéine synthétisée, avant d'avoir la forme de la protéine fonctionnelle elle va être coupée en certains endroits (nécéssites des enzymes donc des gènes spécifiques) puis repliée comme elle devrait l'etre (le folding, car une protéine peut avoir plusieurs conformation et parfois ce n'est pas la conformation naturelle qui est la bonne) elle peut nécessiter l'addition de groupements (acétylations, methylations, phosphorylations.  [...] Il y a aussi les glycosylations, très très très importantes et les glycosylations sont pas les memes d'un organisme a un autre, c'est pourquoi fabriquer de l'EPO ou desanticorps par d'autres organismes est risqué car ils n'ajouterons pas les meme motifs de glycosylation et pas aux memes endroits.  [...]

[Biologie Cellulaire] swiss prot

Tu peux regarder dans les catalogues d'anticorps si tu veux avoir une image de ce fameux shift (si bien entendu il existe un anticorps contre la forme phosphoryllée et non phosphoryllée de la protéine que tu étudies).  [...] Je ne crois pas en une quelconque interaction entre les groupements phosphate (Vinc, tu en dis quoi). Il s'agit plutôt d'un encombrement stérique qui fait que sur gel on a l'impression que le poids moléculaire de la protéine est supérieur de 2-3 Da. Dans ce cas, tu as ce shift dont parle Vinc (tu as deux bandes correspondant à ta protéine, légèrement espécées).  [...]

Dominant négatif !!

Heu...la protéine G n'est pas à proprement parler cytosolique. Elle est sous membranaire et la myristoylation est une étape de maturation qui n'as pas grand chose à voir avec l'adressage des protéines.  [...] Si quand même. Protéine membranaire ne veut pas nécessairement dire transmembranaire (séquence signal). Des protéines myristoylées comme c-src ou certaines GTPases sont adressées à la membrane grâce à cette modification. Il existe aussi d'autres modifications par addition de groupements lipidiques (farnésylation, géranylation) qui sont importantes pour l'adressage membranaire de protéines.  [...]

[Biochimie] Activité alcool déshydrogénase

Je sais que la présence de groupement thiol -SH au sein de la protéine est importante pour son activité, donc est-ce que malgré que l'on soit dans du tampon, H2SO4 agirait sur ces groupements En établissant des liaisons hydrogène ou en établissant des ponts disulfures par exemple.  [...] Ou bien, est-ce que H2SO4 agit directement sur l'éthanol en réalisant le réaction suivante. R-OH + H+ ==. R+ + H2O. Etant dans un milieu contenant un tampon, je en sais pas si cette réaction peut se faire.   [...]