• Forum - Groupements, Acides, Forme

[Biologie Moléculaire] Structures

- La structure primaire, c'est la séquence en acide aminés. En fonction de la nature des groupements ( -R ) des acides aminés présents, des structures secondaires peuvent se former ou non. Certaines séquences favorisent plus facilement telle ou telle structure secondaire du fait de l'encombrement et des charges des groupements des AA qui la forme.  [...] - La structure IVaire, c'est l'assemblagfe de molécules de protéines entre-elles pour former une protéine active. Les gènes codent des chaînes qui se structurent, mais plusieurs chaines sont parfois nécessaire pour constituer une protéine active. on parle de dimère, trimère ou tétramère (= 1, 2 ou 4 protomères assemblés).  [...]

[Biologie Moléculaire] Site actif d'un enzyme.

Le site de liaison est une poche définie par un ensemble d'acides aminés. suivant la nature de ces acides aminés (aa), seuls certains substrats seront capables de ce placer dans cette poche. Imaginons que ton site de liaison soit petit et possède des aa chargés négativement.  [...] L'activité de l'enzyme dépend de la forme et de la taille de la serrure et aussi des acides aminés au fond. Les acides aminés ont des groupements chimiques différents au niveau de leur chaine latérale. C'est la chaine latérale qui différencie les acides aminés en fait.  [...]

protéine: hydrophile ou hydrophobe

En effet, un polypeptide résulte de la réaction de condensation de plusieurs acides aminés. Un acide aminé est un molécule composé d'un carbone central ( alpha ) lié à un atome d'hydrogène, à un radical R ( où R représente un groupement fonctionel ) ainsi qu'à un groupement amine et carboxylique.  [...] A pH basique, les groupements acides sont alors sous la forme COO- et les groupements NH3+ tendent à leurs tours à se dissocier dans une certaine proportion suivant le pKa du groupement amine pour ainsi obtenir des groupements sous la forme NH3+ ou NH2. A un pH très basique la forme prédominante du groupement est NH2. La charge nette est de -1.  [...]

[Biochimie] Etude de la reconnaissance enzyme, substrat

Celà ne concerne que les extrémités. Mais ce qui différencie les acides aminés c'est leur groupement latéral. Il existe des acides aminés qui portent un groupement latéral doté de fonctions basiques ou acides. Qui seront modifiées selon le pH également. Il faut noter que chaque groupement n'aura pas forcément un point de dissociation identique.  [...] Je vais etre un peu répétitif par rapport à novocaïne qui a bien résumé l'implication du PH. La charge des groupements latéraux acides et basiques est particulièrement importante pour la catalyse, ainsi, un carboxylate (cas de l'aspartate) n'aura pas le meme effet que la forme acide.  [...]

[Biochimie] Acides aminés capables de créer des liaisons électrostatiques

Merci de ta réponse, en fait il s'agit de liaisons hydrogènes (j'ai oublié de le préciser) et du coup c'est bien des liaisons qui se forment entre des acides aminés polaires (présentant des groupements OH (H donneur, O accepteur) NH (N accepteur, H donneur) c=O (accepteur) N (accepteur)).  [...] Ne pas oublier aussi que les protéines n'interagissent pas uniquement au moyen de la chaine latérale de leurs acides aminés. Le squelette peptidique d'une protéine, avec ses fonctions amides, peut également établir des liaisons H avec d'autres protéines.  [...]

[Divers] Arsenic

Le soufre intervient dans la formation des acides aminés soufrés et des groupements sulfhydriles nécessaires à la réaction catalytique des enzymes et des immunoglobulines. Il joue un rôle dans le métabolisme des sucres, des lipides et la formation des conjugués.  [...] Rien à ajouter, à part que les acides aminés soufrés sont très importants dans la structure des protéines. Ils forment entre eux des pont disulfures, liaisons covalentes fortes.  [...]

[Biochimie] pH optimal et Stabilité d'une enzyme

Dans ce dernier cas l'enzyme peut être placée dans les conditions voulues puis on peut la faire migrer en condition non dénaturantes afin d'observer la migration d'un dimère, trimère, tétramère ou plus (enzyme sous forme stable ou plus ou moins stable) ou la migration d'un monomère (enzyme instable).  [...] Merci beaucoup, il ne me reste plus qu'à manipuler en espérant trouver de bons résultats. En fait, je dose les groupements reducteurs des acides galacturoniques formés par la dégradation du pectate sous l'effet de l'enzyme. Le dosage de l'activité enzymatique s'effectue au DNS (methode de Miller). Je pense que ça devrait aller.  [...]

[Génétique] Enzyme de déméthylation

salut tous le monde. j'ai besoin de votre aide consernant les enzyme de déméthylation. qu'appel t 'on l'enzyme specifique a la démethylation c'est à dire l'enzyme qui enléve les groupement méthyl(CH3).  [...] Par exemple je crois que dans les mécanismes de croissance des cellules végétales, l'auxine en acidifiant la paroi va désactiver une enzyme, la pectine methylestérase, qui enlevait des groupements méthyl de la forme. R-0-CH3 en créant ainsi des molécules hydrophiles du type RO-.  [...]

[Biochimie] pKr

Les acides aminés ont deux groupements qui se comportent comme des acides ou des bases.  [...] Certains ont des fonctions sur leur chaine latérale qui a aussi des propriétés acido-basiques. Leur pKa est variable et on le note pKr.  [...]

Liaison peptidique dans une cellule

Les groupements amine et carboxyle dans un acide aminée sont sous leur forme ionisé(H3+N et COO-) dans une cellule à cause du pH d'environ 7. Ce que je ne comprends pas c'est de quelle façon les liaisons peptidique ont-elles lieu dans une cellule si les extrémités sont ionisés Et quand elles ont lieu, les extrémités vont-elles être ionisés aussi.  [...] Effectivement. deux acides aminés dans l'eau, a température ambiante, ne réagissent pas ensemble pour former une liaison peptidique.  [...]