• Forum - Groupements, Acide aminé, Valeur, Charge

ionisation des acides aminés

Je me retrouve face à une incompréhension. je ne sais pas toujours déterminé l'ionisation de mes groupements dans un acide aminé et par conséquent je n'arrive pas à donner la valeur de la charge nette.  [...] C'est de l'équilibre acidobasique simple, pour vulgariser. dis toi qu'à pH acide y'a pleins de protons dans le milieux qui vont venir se fixer partout et combler tes groupements, et inversement à pH basique, y'en a presque pas dans le milieux donc ils viennent pas se fixer sur tes groupements.  [...]

Protéines

1)Pour savoir la charge d'un acide aminé, il faut regarder les groupements latéraux (entre pH2 et 9,5 les fonctions carboxyliques et amines terminales se compensent). Tu pourras trouver ici les valeurs des pka des groupements latéraux déprotonables. On constate que Tyr, Cys, Asp, Glu, His, Lys, Arg peuvent avoir des chaines chargées.  [...] 2) Les groupements latéraux chargés sont très hydrophiles, les acides aminés les plus hydrophobes sont les acides aminés cycliques. tyrosine (non déprotonée), phénylalanine, tryptophane ainsi que ceux aliphatiques (valine, leucine, isoleucine).  [...]

protéine: hydrophile ou hydrophobe

A pH acide, les groupements amines sont sous forme NH3+ et le groupement acide est dans une certaine proportion (suivant le pH et le pKa du groupement alpha COOH) sous forme COOH ou COO-. A ph très acide, on a alors une charge nette de +1.  [...] A pH basique, les groupements acides sont alors sous la forme COO- et les groupements NH3+ tendent à leurs tours à se dissocier dans une certaine proportion suivant le pKa du groupement amine pour ainsi obtenir des groupements sous la forme NH3+ ou NH2. A un pH très basique la forme prédominante du groupement est NH2. La charge nette est de -1.  [...]

[Biologie Moléculaire] Zwitterion

le cas où on a entendu parler de ça est celui des acides aminés. On sait qu'ils ont un groupement amine et un groupement carboxyle de charge différente en plus de la charge des groupements du radical.  [...] le cas dans lequel sa charge est nule, c à d le nombre des groupements chargés positivement est égal au nombre de groupements chargés négativement on dit que sa charge est nulle est qu'il est en mode Zwitterion.  [...]

[Biologie Cellulaire] pH acide et bactéries

pour ce qui est des acides aminés et des protéines, lorsque le pH varie, les acides aminés vont se trouver différentes charges, lors de pH acides, les protéines vont se protoner et donc perdre leur charges négatives (l'acide aspartique et l'acide glutamique par exemple vont passer de la forme R-COO- à la forme R-COOH aux alentours du pH3) en présence d'un pH basique, l'asparagine et l'arginine vont quant à elles se déprotoner et perdre leur charge positive puisque les groupements R-NH3+ vont passer en R-NH2 or les charges d'une protéines vont etre importantes pour sa conformation, ses interactions, son rôle comme l'activité de certaines enzymes et autres.  [...] le pH peut permettre ou empêcher certaines molécules de passer la membrane plasmique (c'est le cas par exemple chez les plantes avec l'auxine, ce qu'on appelle la croissance acide à l'auxine correspond au fait qu'en pH acide les charges présentes sur l'auxine vont disparaitre et lui permettre de passer plus facilement dans la cellule puisque les charges et donc la polarité de l'auxine l'empêchait de diffuser librement et demandais la nécessité de protéines spéciales pour passer la membrane, en pH acide l'auxine peut passer meme sans protéine de transport.).  [...]

[Biochimie] acide aminé et pH

je voulais savoir comment démontrer qu'a PH=7. l'ionisation des 2 groupements carboxylique et amine de l'alanine est totale connaissant les Pk ( acide=5 et basique=10).  [...] Et bien vous devez savoir que pour un pH. pKa, la fonction acide est sous la forme COOH et pour pH. pKa, elle est sous la forme COO -. De la même manière, si pH. pKa =. NH 3 + et si pH. pKa =. NH 2.  [...]

[Biologie Cellulaire] Basophilie Eosinophilie

1. ADN. l'acide désoxyribonucléique est densément chargé négativement en raison des nombreux groupements phosphates. Il est acide et il a donc affinité pour les BASES. Il est donc dit basophile. Cet ADN est condensé par des protéines basiques (les histones).  [...] Ce sont les éléments principaux pour la traduction des ARNm matures en chaines polypeptidiques. Ils sont constitués d'ARNs (acides) et impactent donc une BASOPHILIE au cytoplasme. Une cellule active dans la synthèse des protéines aura donc un cytoplasme périnucléaire basophile.  [...]

[Biochimie] Etude de la reconnaissance enzyme, substrat

Je vais etre un peu répétitif par rapport à novocaïne qui a bien résumé l'implication du PH. La charge des groupements latéraux acides et basiques est particulièrement importante pour la catalyse, ainsi, un carboxylate (cas de l'aspartate) n'aura pas le meme effet que la forme acide.  [...] On peut également trouver des exemples pour la différences ammonium/amine d'acide aminés comme la lysine. Il est probable que la charge des acides aminés soit optimales pour la catalyse à PH physiologique (PH 7,4 il me semble sauf dans certains cas cités par novocaine, à PH 7,4, les acides seront en tout cas majoritairement sous forme carboxylate et les amines sous forme d'ammonium).  [...]

[Biochimie] les acides aminées

Pour le glutamate et l'aspartate, la seule différence se situe au niveau de la longueur de la chaine hydrocarbonée située avant la fonction acide. Pour la glutamine et l'asparagine on a la même différence sauf que c'est une fonction amine. Entre la leucine et l'isoleucine, seules les positions des groupements hydrocarbonés changent.  [...] Ainsi par logique, à partir d'un acide aminé tu peux en retrouver plusieurs et les interconnections font que tu les retrouves tous. Cela est vrai pour toute chose à mémoriser, plus on établit de connections, plus l'information reste.  [...]

acides aminés gauchers??

On regarde les deux groupements sur le coté, normalement un des deux est de l'hydrogène. Dans le cas d'un acide aminé, l'autre est une fonction amine, et elle pointe vers la gauche dans les acides aminés les plus courants dans les êtres vivants.  [...] - des acides aminés de série D sont présents dans les protéines de la paroi de bactéries, et dans les peptides antibiotiques de champignons. mais ils sont soit ajoutés après la traduction, par une enzyme, soit ils sont intégrés dans des peptides (des petites chaines d'acides aminés, de 100 aa et moins) qui sont le fait d'usine enzymatiques les construisant acide aminé par acide aminé et non de la traduction d'un gène (c'est d'ailleurs impressionant.  [...]