• Forum - Groupement, Phosphate, Charge

[Biologie Cellulaire] Arn

- Les nucléotides constituant l'ARN (et l'ADN) portent un groupement phosphate qui est chargé positivement et qui permet, pendant une électrophorèse, la migration vers le pôle chargé positivement de la cuve (donc la cathode..).  [...] Les nucleotides sont normalement chargés négativement à cause de la présence d'un groupement phosphate, si non, s'il étaient chargés positivement, leur déplacement se ferai vers le pôle négative.  [...]

débrifing sur l'ADN.

la molécule d'ADN est hydrophyle car elle possède des charge négatif, donc elle est charger négativement. c'est vrai ces charges la déstabilise un peu.les charges négatif sont du au groupement phosphate présent sur les nucléotide. (lorsqu'on dit groupement phosphate ce sont des groupement acide phosphatidique HPO4 (2-)).  [...] Le nucléosome est stable car il est constitué d'histones basiques dont la charge positive permet une interaction forte avec les groupement phosphates de l'ADN double brin, c'est cela J'avais lu quelque part que les liaisons hydrogènes intervenaient, est ce possible.  [...]

empreinte genetique!sos

grace au groupement phosphate mais comment cela est-ce une charge partiel ou n'est elle pas neutralisée par quelque chose... merci.  [...] Il reste donc une fonction acide libre sur le phosphate. En milieu physiologique, elle cède son proton plus qu'elle ne recapte (cf la notion de pKa). Il y a donc bien une charge -, donc en fait l'ADN serait plutôt un désoxyribonucléate si on veut respecter les normes de la chimie.  [...]

[Biochimie] séparation des lipides

bon pour moi sa serai le phosphate car il a la plus grande hydrophile (enfin je crois) mais es-que le phosphate est un lipide ( je ne pense pas ).  [...] La différence tient donc au carbone 3, qui dans la première molécule portera un acide gras également, et dans la seconde un groupement phosphate, chargé, hydrophile, donc.  [...]

[Biochimie] transamination

le phosphate de pyridoxal (PPal), coenzyme necessaire à la transamination et transporteur intermédiaire de la fonction amine, se charge du groupement amine de l'acide aminé 1 et se transforme en phosphate de pyridoxamine (PPNH2). Il y a alors libération du premier produit. l'acide alpha-cétonique 1.  [...] Il y'a d'abord fixation de l'aspartate (S1)sur l'enzyme (E). Il suit le départ d'un groupement aminé qui se fixe sur le phosphate de pyridoxal (groupement prosthétique intimement lié à l'enzyme) donnant ainsi la forme phosphate de pyridoxamine.  [...]

Cycle de Calvin

J'ai du mal a comprendre la formule chimique du ribulose-1,5biphosphate dans le cycle de Calvin, je m'explique, sur ce schéma. http.//upload.wikimedia.org/wikipedi...vin-cycle4.svg au niveau des groupement phosphate du ribulose-1,5biphosphate il n'y a aucun hydrogène lié aux oxygènes, c'est normal pour celui qui comporte une charge négatif et pour celui qui est lié au carbone mais pour les deux autres, puisque ils n'ont pas de doubles liaisons il y a une violation de la règle de l'octet Est ce que quelqu'un pourrait m'expliquer ce qui justifie cela.  [...]

[Biologie Moléculaire] Les ions bivalents

Les ions Mg++ ont plusieurs rôles. l'un étant de stabiliser les acides nucléiques qui sont très négatifs. En effet les nombreuses charges négatives (une par groupement phosphate il me semble) se repoussent et déstabilisent l'ADN et l'ARN. Du coup le Mg++ étant positif, il y a un effet compensatoire.  [...] lun des deux ions métalliques est en interaction avec l'oxygène du groupement oh 3 libre de la chaine du polynucléotide ce qui diminue laffinité de l'oxygène pr sn hydrogène cette interaction favorise l'attaque nucléophile du 3'o sur latome de phosphore de lalpha phosphate du nucléotide entrant le second ion métallique facilite le départ du produit de réaction le groupement phosphate du nucléotide entrant.  [...]

[biochimie] Question sur la formation ATP

Pourquoi, lors de la formation d'ATP ( Adénosine Tri phosphaté ) le groupement phophaté libère t'il TOUS ses Hydrogènes et non pas seulement celui utilisé pour faire la liaison Anhydride phosphorique et on peut donc écrire ATP ( 4- ) ( ça c'est clair ).  [...] La forme solide est protonée. En solution, le degré de protonation dépend du pH de la solution puisque la chaque groupement phosphate de l'ATP a deux fonctions acide de pKa différent (sauf la dernière qui en a trois).  [...]

[Biologie Moléculaire] kinase

Le terme kinase ou proteine kinase est un terme general pour definir une proteine qui catalyse le transfert d'un groupement phosphate issue de l'ATP sur un substrat proteique ou lipidique. C'est une reaction de phosphorylation. Leur contrepartie sont les phosphatases qui elles catalysent la reaction inverse, enlevement d'un groupement phosphate (reaction de dephosphorylation).  [...] Mon probleme est que je soupsonne une proteine qui m'interesse d'etre phosphorylee, mais probablement pas fortement (donc elle possede un ou deux phosphate au plus) et qu'en plus de ca elle doit etre en equilibre avec une forme non phosphorylee.  [...]

Réactions catalysées par une kinase

Je sais que la kinase est une enzyme qui fait partie de la famille des transférases et que lors de cette réaction il y'a transfère d'un groupement phosphate.  [...] Par contre, une kinase est une transferase. Elle transfert un groupement phosphate d'un donneur (par exemple l'ATP) a un substrat (au niveau d'une fonction alcool, thiol, amine, phenol, imidazole...). Le transfert est direct. Il n'y a pas hydrolyse, formation de phosphate inorganique (Pi), puis condensation du Pi avec le substrat.  [...]