• Forum - Groupe, Phosphate, Enzyme

enzymes de restriction

1) exemple avec l'enzyme BamHI qui coupe dans la séquence 5'-G*GATCC-3'. L'enzyme va couper la liaison covalente phosphodiester entre les 2 G de la séquence et va laisser un groupe phosphate 5' exposé et un groupe hydroxyle 3' en retrait. On parle alors d'une extrémité collante 5' (5' cohesive ends, ou 5' overhang ou surplomb 5').  [...] 2) exemple avec l'enzyme Sac I qui coupe dans la séquence 5'-GAGCT*C-3'. L'enzyme va couper la liaison phosphodiester entre le T et le C de la séquence et va laisser un groupe phosphate 5' en retrait et un groupe hydroxyle 3' exposé. On parle alors d'une extrémité collante 3' (3' cohesive ends, ou 3' overhang ou surplomb 3').  [...]

[Biochimie] enzymes: kinases, dehydrogenases

La seconde réaction catalyse le retrait d'un groupe phosphate (à noter que néanmoins c'est le nom de la molécule sans le phosphate qui est dans le nom de l'enzyme), quoi qu'il en soit ça reste pas très clair.  [...] J'ai également trouvé sur un site l'existence de la phosphoénolpyruvate phosphatase (PEP phosphatase), et apparemment cette enzyme joue le même rôle que la pyruvate kinase à savoir qu'elle catalyse le retrait d'un groupe phosphate.  [...]

[Biochimie] antartic phosphatase

Bonjour est il possible d enlever un groupe phosphate avec cette enzyme(antartic phosphatase).dephosphorylation ).  [...] a ma connaissance elle ne peut que catalyser la déphosphorylation en 5' d'un acide nucléique.  [...]

[Biochimie] Le glucose dans les muscles...

Si j'ai bien compris, seul le foie possède un récepteur au glucagon, qui lorsqu'il est stimulé, active une enzyme qui découpe le glycogène présent dans le foie, et associe les molécules de glucose ainsi libérées avec un groupement phosphate. Cette association est le glucose-1-phosphate (g-1-p).  [...] Enfin, une dernière enzyme découpe le g-6-p et sépare ainsi le glucose et le groupemment phosphate. La molécule de glucose ainsi isolée peut passer à travers les pores du foie pour aller dans le sang.  [...]

[Biochimie] Glycolyse : une kinase peut enlever un phosphate??

l'enzyme est une kinase mais c'est bien un phosphate qu'on enlève,c'est l'ADP qui récupère le phosphate. Ca me parait logique, mais le mécanisme de la kinase est de fixer un phosphate. Pourquoi pas une phosphatase a cette étape.  [...] En générale, et si ma mémoire est bonne, une enzyme phosphokinase (groupe des transférases) signifie tout enzyme qui réalise un transfère intermoléculaire du groupement phosphate (contrairement à celle qui assure un transfère intramoléculaire du groupement phosphate et qu'on appelle phosphomutase, celle-ci fait partie du groupe des isomérases).  [...]

[Biochimie] la phosphorolyse du glycogene

glycogène [(glc)n] ' [(glc)n-1] + glucose-1-phosphate, réaction catalysée par la glycogène phosphorylase. L'hydrolyse complète demande l'intervention d'une transférase et de l'± 1-6 glucosidase (enzyme débranchante).  [...] Co-enzyme. Phosphate de Pyridoxal ( vitamine B6 ) qui agit par son groupement Phosphate au lieu de son groupement habituel aldéhydique. Réaction de Phosphorolyse (hydrolyse par un Phosphate) qui permet un meilleur rendemment, et la non-utilisation d'ATP (donc de substrats énergétiques) pour l'obtention d'un Glucose-1-Phosphate.  [...]

Réactions catalysées par une kinase

Les kinases sont des enzymes qui catalysent les phosphorylations uniquement, c'est-à-dire l'addition d'un groupe phosphate. Tu n'as plus qu'à regarder tes réactions et à voir lesquelles présentent une phosphorylation.  [...] Pour ceux qui n'ont pas trop l'envie de tout lire, la figure 2 montre comment l'enzyme met tous les elements en place au sein de son site actif, et la figure 4 montre l'etat de transition lors du transfert (NB. la partie ADP de l'ATP constitue un bon groupe partant dans cette reaction - Si on avait a la place de l'ATP du phosphate inorganique, il faudrait eliminer OH - ce qui est bien bien plus difficile).  [...]

[Biologie Moléculaire] Contrôle de la glycolyse

2/Je cois que en ce qui concerne la kinase, l'AMPc va se fixer sur des sous inutés régulatrices qui vont activer d'autres sous unités, les sous unités catalytiques afin de catalyser la réaction. L'AMPc est donc un effecteur de l'activation de l'enzyme. Il est sur que l'enzyme phosphorylée est plus active en tout cas (dans la majeure partie des cas, lorsqu'on fixe un groupement phosphate, l'enzyme est plus active.  [...] Je pense que si [ATP] est trop important, il doit y avoir une sorte de saturation de l'enzyme qui doit alors ne plus fonctionner correctement, et qui doit etre inhibée... et agir ainsi plus comme une phosphatase (en enlevant un groupement phosphate pour que ADP -. ATP, et ainsi rééquilibrer les rapport).  [...]

[Biochimie] transamination

le phosphate de pyridoxal (PPal), coenzyme necessaire à la transamination et transporteur intermédiaire de la fonction amine, se charge du groupement amine de l'acide aminé 1 et se transforme en phosphate de pyridoxamine (PPNH2). Il y a alors libération du premier produit. l'acide alpha-cétonique 1.  [...] Il y'a d'abord fixation de l'aspartate (S1)sur l'enzyme (E). Il suit le départ d'un groupement aminé qui se fixe sur le phosphate de pyridoxal (groupement prosthétique intimement lié à l'enzyme) donnant ainsi la forme phosphate de pyridoxamine.  [...]

[Biologie Cellulaire] Synthèse de lipide dans le REL

Etape 2. Phosphatase. le groupement P est détaché avec cette enzyme. Le groupement P subi une réaction par hydrolyse, P devient Pi, ( là j'ai beaucoup de doute, car sur le schéma je vois que O est lié avec H, est-ce que c'est dû à la réaction par hydrolyse ).  [...] Etape 3. Choline phosphotransferase. qui est une enzyme qui accélère les réactions chimique. ça va transformer la cytidine diphosphocholine en cytidine monophosphate et choline monophoasphate. l'enzyme casse les liaisons entre les 2 groupements phosphate et donc la choline monophosphate vient se lier au glycérol, mais le H qui était lié avec le O se transforme en ion H+ ( pourquoi est-ce par affinité ).  [...]