• Forum - Génome, ADN, Souche

[Divers] Compilation des termes en "-ome".

Je ne suis pas bien sûr de saisir l'utilité d'un tel recensement. A chaque fois qu'on pourra créer un nouvel ensemble ou sous-ensemble, on pourra ajouter le suffixe -ome et le tour sera joué. Il n'y a pas vraiment de finalité je crois. Et en débattre, je saisis encore moins car il s'agit là de nouveaux termes permettant d'organiser l'acquisition et le stockage des nouvelles connaissances en biologie (même si cela ne s'arrêtent pas qu'à la biologie certainement).   [...] Cela ne correspond pas avec ce lien http.//www.biocimera.org/2011/03/le-...e-en-biologie/ qui lui recense des mots terminant en -ome qui ne correspondent pas à des ensembles (adénochrome., acrosome,...). Le lien peut donc aider à trouver des définitions de mots rentrant dans la catégorie définie par jmbowie, mais ne constitue pas un remplacement.   [...]

OGM (l'identification du/des gènes intéressant(s))

Une des méthodes peut être d'avoir deux souches de l'organisme en question. l'une qui produit la molécule qui nous intéresse, l'autre qui ne la produit pas.  [...] On étudie alors leur génome par exemple en faisant une banque d'ADN de chaque souche. En comparant les deux banques on trouvera au moins un fragment d'ADN qui sera différent entre les deux. il y a de bonnes chances que ce fragment soit le gène recherché.  [...]

[Biologie Moléculaire] souche d'expression

Je voudrais savoir comment différencie t-on une souche d'expression d'une souche d'amplification de l'ADN.  [...] mais par exemple pour TOP10 je vois parfois plutôt des amplifications d'ADN, parfois des expressions protéiques, ce n'est pas très clair.  [...]

[Génétique] Génétique de la levure

j'ai une souche de levure mutée(j'ai remarqué la mutation d'après le phénotype) et je veux s'assurer que cette mutation est dans l'ADN génomique et non dans l'ADN mitochondriale.(je sais que c'est très rare d'avoir une mutation dans l'ADN mitochondriale qui s'apparait sur le phénotype mais il faut s'assurer).  [...] je pense de croiser 2 souches (mutée et WT) mais je ne sais pas le ratio que je doit attendre c.à.d est ce que j'aurai 4/0 ou 2/2, 3/1(comme phénotype)... car la mutation est récessive et je propose qu'elle est mitochodriale.  [...]

[Microbiologie] banque génomique

j'ai réalisé une banque génomique, l'ADN génomique de la souche Mycoplasma a été digéré par 3 enzymes de res-.  [...] quence obtenue m'a informé que j'ai effectué une erreur lors de la digestion enzymatique. Je ne suis pas d'accord avec elle parce que je me suis dit que les amorces que j'ai pris sont spécifiqUES DU Gène Mm14 de la souche en question, mais je me suis dit que c'est en rapport avec le clone recombinant que j'ai obtenu (ADN digéré par Eco RV).  [...]

[Biologie Moléculaire] Technique pour obtenir des amorces souche spécifique sans séquence du génome

Or pour cela je dois tout d'abord déterminer des amorces spécifiques de mes souches, le problème est que les génomes de mes bactéries n'ont jamais été séquencés à ce jour et il n'est pas prévu car trop cher.  [...] Si tu cibles un gène très bien conservé chez d'autres souches bactériennes, tu peux designer tes amorces sur un consensus (à partir des leur séquences).  [...]

[Biochimie] Dot Blot et Northern Blot

J'ai utilisé le dot blot sur l'ADN génomique bactérien lorsque je cherchais la présence d'un gène dans un grand nombre de souche. Ca m'a permis de faire un premier screening rapide avant de continuer le reste des tests.  [...] Pour l'ADN ca peut etre utiliser pour mettre en evidence une insertion, ou pour quantifier le nombre de copie d'un gene par genome, voire par cellule (pour les bacteries eb tout cas dans la mesure ou en pleine division il peut y avoir jusqu'a 16 origines de replications).  [...]

[Microbiologie] dégradation de l'ADN

1) j'ai constaté que L'adn de la Mycoplasma se dégrade rapidement, j'ai respecté le protocole d'extraction de l'adn mes réactifs sont en bon état je soupçonne l'interférence de la mutation de la souche dans ça est il possible de considérer que les mutations et/ou la présence d'une activité exonucléasique chez la souche soient impliqués dans la dégradation de l'ADN.  [...] merci d'avoir répondu à mes questions, mais maintenant on doit se focaliser sur la dégradation D'ADN presque tous mes collègues rencontrent le même problème pour la souche Mycoplasma meleagridis sachez qu'on travaille dans les normes, je ne sais pas franchement à quoi est dû spécialement pour cette espèce, je me suis posée la question % à la présence de Dnase mais si c'étais le cas ça ne marcherait pas pour toutes les espèces aidez moi s'il vous plaît sachant qu'on utilise la méthode d'extraction d'adn au phénol chloroforme.  [...]

[Microbiologie] séquençage de génome bacterien

j'ai lu dans des articles scientifiques,que la localisation chromosomique d'un gène de résistance chez une bactérie doit être confirmé par un sequençage complet de génome de cette souche. Pourrai-je savoir pourquoi \comment je pourrais savoir sa localisation à l'aide de la séquence complété de gènome de cette souche.  [...] Ben a partir du moment ou tu as une liste de tous les gènes, il devient possible d'identifier celui qui est à l'origine de la résistance.   [...]

Génie génétique

Afin de caractériser au niveau moléculaire la mutation hisD984, les ADN des souches LT2 ( souche sauvage d origine) et TR6238 ( souche LT2 modifiée contenant la mutation hisD984 après mutagénèse chimique) sont préparés et digérés séparément par différentes enzymes de restriction.  [...] ta sonde radioactive est ton M13Hol76. Il s'agit surement de portion d'ADN radioactif purifié. Elle est sans doute introduit dans ton produit de digestion avant de le faire migrer. Dans la logique, cette sonde se liera uniquement à ta souche sauvage.  [...]