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[Génétique] taille moyenne fragments de restriction

Je bloque sur une question où l'on me demande de calculer la taille moyenne des fragments de restriction après digestion par ecoR1 (site reconnaissance. GAATTC) de l'adn humain.  [...] Justement en calculant la fréquence d'apparition, j'avais trouve 1 pour 4096 (4^6), donc j'en avais déduit que la taille moyenne était de 4096 pB.  [...]

[Biochimie] génétique - endonucléases de restriction

Un ADN génomique contenant 40% de guanine est hydrolysé par une enzyme de restriction reconnaissant le palindrome AATT. Quelle est la taille moyenne des fragments générés par l'hydrolyse enzymatique.  [...] Donc la probabilité de trouver un site est (1/4) n avec n la taille du site de restriction. Ce genre de calcul vous amène à conclure qu'une enzyme telle que EcoRI génère des fragments de 4096 pb en moyenne.  [...]

Mémoire en génétique : questions diverses

Je dois donc rédiger quelque chose de simple et de compréhensible pour tout le monde. Mais pour cela, il faut déjà que je comprenne moi-même J'ai donc commencé mes recherches par les bases de la génétique. où se trouve l'ADN dans la cellule, qu'est-ce-que les chromosomes, la chromatine, les chromatides, les nucléosomes, les histones, la mitose. J'en suis à peu près là.  [...] Ces derniers jours, j'étudie les empreintes génétiques, notamment le polymorphisme de l'ADN, les SNP et les séquences répétées en tandem. Je souhaite parler du polymorphisme de longueur des fragments de restriction, mais j'ai beau faire des recherches, je ne comprends absolument pas de quoi il s'agit.  [...]

[Biologie Moléculaire] Connaitre séquence génomique....

digestion de restriction avec plusieurs enzymes dont les séquences ne reviennent pas trop souvent (digestions simples et doubles histoire d'avoir les fragments avec plusieurs origines et fins différentes.). Tu as une idée de la complexité du génome (tu peux faire des essais pour voir la taille moyenne des fragments que tu rammènes). Tu fais une banque avec tout cela.  [...] Pour la PCR inverse, il peut être intéressant d'utiliser une 2eme enzyme de restriction située entre les 2 amorces, de manière à relinéariser le brin d'ADN circulaire. Cela facilite la PCR sur des petits fragments.  [...]

[Biologie Moléculaire] Fréquence de sites de restriction

La taille du génome de P. aeruginosa est = 6,3^10 6 pb. Donc, avec le calcul ci-dessus, on aura que la taille moyenne des fragments est de 7000pb.  [...] Le nombre de clones indépendants N. dépend de la taille du génome G représenté dans la banque et de la taille moyenne des fragments clonés L (inserts).  [...]

Technique : RFLP

tu as dis précédemment que l'adn était coupé en point x (car site de restriction) et cela donnait des fragments. Soit, mets tu dis que s'il y a absence de ce site alors il y a migration de fragments plus courts ce ne serait pas le contraire par hasard, car si présence de site de restriction alors ca coupe donc longueur moindre que s'il n'y avait pas de site.  [...] je pense comme toi, s'il y a présence de sites de restriction, les fragments obtenus seront plus courts que si les sites sont absents, puisque s'il n'y a aucun site de restriction spécifique à l'enzyme de restriction, le fragment reste entier et donc sa longueur est maximale.  [...]

[Biochimie] Preparation et analyse de plasmides

En fait, on a fait notre electrophorese sur plusieurs especes de E.coli, HRPN PGAG PCK3 et PLTR avec ECOR1 et HINDIII, une autre chose que je n'ai pas comprise, c'est. Est ce que c'est enzymes de restriction vont séparer les plasmides avec le même nombre de fragments A priori non.  [...] La carte circulaire comme tu dis (= la carte de restriction) se fait après l'électrophorèse. Tu ne peux pas prédire le nombre de fragments que tu auras (à part si tu connais la séquence complète de ton plasmide).  [...]

[Génétique] Dm sur la myopathie de Duchenne

l'analyse du document 2 permet de voir que les enzymes de restriction coupent l'ADN en reconnaissant une séquence particulière de désoxunucléotides, les fragments n'ont donc pas la même taille. Les fragments obtenus sont plus petit 1,3kb. L'allèle muté est mis en évidence.  [...] Parmi les résultats présentés, lequel correspond au foetus le but de ce document est de montrer ce que peut être un diagnostic génétique, et non de comprendre quelle est exactement la mutation.  [...]

[Biochimie] Mapping et Bal 31

This degradation is accomplished without the introduction of detectable scissions away from the ends of the duplexes. When this nuclease is used to produce a series of progressively shortened samples from a linear duplex DNA, subsequent digestion of these samples with a site-specific restriction endonuclease and analysis of the resulting fragments by gel electrophoresis permits the rapid establishment of the order of the restriction enzyme fragments through the entire genome.  [...] This is accomplished by noting from the electropherograms the order in which the various restriction enzyme fragments become noticeably shortened or disappear. Using this method, the five cleavage sites for the endonuclease Hpa I and the single cleavage sites for the nucleases Hpa II and Pst I have been mapped in PM2 bacteriophage DNA.  [...]

[Génétique] être non codant et co-dominant? Est ce possible?

_Enfin, est ce qu'on peut dire que l'espèce S. Anglica est hétérozyte, car elle possède tous les fragments de restriction de S. Maritima et S. Alterniflora (c'est une sorte de polyploïde je crois).  [...] Après obtention des résultats, on remarque que L'individu appartenant à l'espèce S. Anglica à un profil de restriction intermédiaire à l'individu S.Maritima et S. Alterniflora. (en fait on voit dans son profil à la fois l'ensemble des fragments de restriction de l'individu S. Anglica et de S.Maritima).  [...]