• Forum - Fragments, ADN, Bactérie

Génétique bactérienne

Maintenant pour la transduction, j'ai quelques soucis, a la fin du cycle lytique, des fragments d'ADN sont encapsidés, est ce des fragments de la bactérie ou du virus ou les 2.  [...] Et enfin pour la transduction généralisée de type abortive, est ce que le nouveau géne est exprimé vu qu'il n'est pas intégré dans le génome bacterien.  [...]

[Microbiologie] Hybridation par Southern-Blot

svp quelqu'un pourra m'expliquer les résultats d'une hybridation avec du l'ADN 16s et de gene de résistance (afin de déterminer si le gène de resistance est chromosomique ou nn ). pour bien expliquer.j'ai fais le transfert des fragments d'ADN par Southern Blot (ADN digeré par une enzyme )(2 copies d'echantillons )et j'ai fais du PCR pour un gene de resistance de cette bacterie (c'est du PCR multiplexe c'est ça) et une PCR 16s(de quoide l'ADN de cette bacterie),puis ils m'ont dis de faire une hybridation.  [...] une copie avec le gene et l'autre copie avec de 16s,et le but de determiner si ce gene est chromosomique ou nn.   [...]

[Biologie Moléculaire] Fragment attendu pour électrophorèse d'ADN

[Biologie Moléculaire] Fragment attendu pour électrophorèse d'ADN.  [...] Actuellement en projet de recherche sur Staph aureus, nous avons extrait l'ADN de la bactérie, puis nous l'avons amplifié par PCR. Nous avons utilisé les amorces NucAF et NucAR. Nous attendions un fragment de 180 pb spécifique à Staph aureus. Lors de la lecture du gel d'agarose de l'électrophorèse nous avons bien eu des fragments mais ils ne sont pas de 180pb mais d'environ 270-300 pb.  [...]

Composition d'une cellule souche

Elle est aussi utilisée quand l'ADN à integrer est deja méthylé et qu'il risque d'être dégradé par la bactérie (fragments de virus). Enfin c'est ce que j'ai vu dans les abstracts de plusieurs publis en essayant de chercher la signification exacte de MCR.  [...] C'est un systeme de protection contre l'ADN exogene (comme les phages par expl). Cet ADN ne possede pas le meme pattern de methylation que celui de la bacterie donc le systeme de restriction de la bacterie doit pouvoir fragment l'ADN avant que celui ci ne s'exprime.  [...]

Technique de séquençage de génome (WGS)

Mettons qu'on prenne une bactérie quelconque, on récupère son ADN, on le fragmente par sonication pour avoir des fragments chevauchant, et on les intègre dans des plasmides. Ensuite on constitue notre banque de clonage.  [...] On doit ensuite séquencer pour chaque puits l'insert du plasmide (pour ensuite tenter de former les contigs, et reconstituer le génome complet). Notre prof nous a dit que séquencer les extrémités de l'insert suffit en général (et qu'on séquence le milieu qu'en cas de lacune par exemple).   [...]

[Evolution] processus des mutations génétiques.

si le résultat et l'apparition de nouveau gène, ce qui est pour moi fortement improbable parce que le disign intelligent d'une bactérie ne peut pas lui permettre de muter de cette manière. ceci est d'autant plus vrai, si je trouve des difficultés à insérer les fragments d'ADN qui vont constituer la mutation artificielle.  [...] à ce que je sais, chaque micro nanomètre dans une cellule n'importe dans la nature, sert à quelques chose donc à ce que cette cellule elle même accepte des fragments nouveaux apportés par l'Homme, et non substitués, est quelques chose d'absurde.  [...]

rDNA ou rRNA?

Par ex. avec leur faculté de se transmettre des fragments d'ADN par conjuguaison, comment les bactéries gardent-elles leurs critères d'espèce.  [...] Deja les genes qui sont transmis et gardes ne sont pas des genes essentiels, puisque les bacteries les ont deja et que cela leur suffit. Donc il n'y aura pas de transfert d'ADNr par exemple, et c'est aussi pour cela que la phylogenie construite a partir de cette portion d'ADN est relativement fiable.  [...]

[bio mol] pUC et LacZ

En présence de glucose, les bactéries aillant intégrer le plasmide pUC composé du gène LacZ+ du gène d'intérêt ne vont donner aucune coloration, tandis que celle qui ont intégré un plasmide non recombinant (sans le gène d'intérêt, donc avec un gène LacZ non interrompu) vont faire une coloration bleue.  [...] si on connais la protéine synthétisé, on la digère avec une protéase puis séquencage aa ce qui permet de retrouver le fragment d'adn et donc le clone.  [...]

[Biologie Moléculaire] Southern blot !!!

Et sinon, concernant l'adn du sperme du saumon, j'ai lu sur un bouquin qu'il est sans lien avec les molécules séparées...qu'est ce qu'ils sous-entendent par molécules séparées serait ce les mono brins par hasard.  [...] C'est pour cela qu' avant de mettre les sondes en contact avec la membrane, on met la membrane en contact avec de l'ADN de saumon qui la recouvre entièrement.  [...]

Homochromie Variable

En fait l'homochromie est apparu plusieurs fois au cours de l'évolution et de manière indépendante, donc l'homochromie est présente chez des espèces très différentes, par convergence évolutive et cela veut donc dire que le fragment d'ADN impliqué n'est pas le même selon les taxons considérés.  [...] On sait que la lumière traverse d'une part les lipophores composés de pigments jaunes (ptéridine) et rouge-orangé (caroténoides). Ceux-ci absorbent certaines radiations et diffusent (ou réfléchissent quel est le terme physique correspondant ) celles qui leur sont complémentaires et qui correspondent à leur couleur.   [...]