• Forum - Forme, Groupement, Acide aminé

protéine: hydrophile ou hydrophobe

En effet, un polypeptide résulte de la réaction de condensation de plusieurs acides aminés. Un acide aminé est un molécule composé d'un carbone central ( alpha ) lié à un atome d'hydrogène, à un radical R ( où R représente un groupement fonctionel ) ainsi qu'à un groupement amine et carboxylique.  [...] A pH acide, les groupements amines sont sous forme NH3+ et le groupement acide est dans une certaine proportion (suivant le pH et le pKa du groupement alpha COOH) sous forme COOH ou COO-. A ph très acide, on a alors une charge nette de +1.  [...]

[Biochimie] Hélice Alpha

Les hélices sont les mêmes morphologiquement, c'est les acides aminées qui les compose qui sont différents, n'oublie pas que les radicaux sont positionné à l'extérieur de l'hélice pour éviter tout encombrement stérique et que les hélices sont formé par des liaisons peptidiques stabilisé par des liaisons hydrogènes et/ou dissulfure.-D.  [...] Chaque acide aminé a des propriétés différentes, a cause de son groupement R. Une chaine d'acides aminés, en fonction de leur groupement, peuvent donc avoir tendance à former des domaines différents comme des hélices alpha, présentes par exemple dans l'hémoglobine.  [...]

[Biochimie] Charge nette d'un peptide

Salut, pour calculer la charge nette d'un peptide a un pH donné il faut connaitre la forme ionique de ton groupement -R pour chaque acide aminé. Il faut pas oublier de prendre en compte la forme ionique de l'NH2 terminal et du COOH terminal.  [...] Pour savoir quel forme ionique a un groupement il faut connaitre le pH du milieu ainsi que du pHi (isoélectrique) de ton groupement.  [...]

[Biochimie] transamination

Il y'a d'abord fixation de l'aspartate (S1)sur l'enzyme (E). Il suit le départ d'un groupement aminé qui se fixe sur le phosphate de pyridoxal (groupement prosthétique intimement lié à l'enzyme) donnant ainsi la forme phosphate de pyridoxamine.  [...] A ce moment, le transfert du groupement aminé du phosphate de pyridoxamine s'effectue sur l'alpha-cétoglutarate qui devient ainsi du glutamate (P2).  [...]

Différence entre un groupement polaire et ionisable?

l'Aspartate possède un groupement ionisable sur sa chaîne latérale. EN effet, suivant le pH du milieu, l'acide aminé sera sous forme COOH ou COO-.  [...] Si maintenant tu prends la sérine, l'hydrogène du OH part difficilement. Toutefois, il y a quand même une différence de charge (meme faible) entre le O et le H et le groupement est donc polaire.  [...]

[Biochimie] Role acide glutamique

Les acides aminés sont synthetisés à partir d'±-ketoacides et eventuellement transaminés à partir d'un autre acide aminé -. généralement le glutamate (la forme anionique de l'acide glutamique).  [...] La transamination peut donc être liée a la déamination afin de permettre à l'azote du groupement amine des acides aminés d'être eliminé (via le glutamate comme un intermédiaire ) et finalement excreté sous forme d'urée.  [...]

aminoacyl tRNA synthétase

Il y a autant d'aminoacyl tRNA synthétase que d'acides aminés ` car les enzymes reconnaissent spécifiquement le groupement latéral de l'acide aminé.  [...] Le groupement latéral de l'acide aminé c'est bien le radical R car si c'est le radical R il peut être de n'importe qu'elle nature donc il pourrait y avoir énormément d'acide aminés différent pourtant il n'y a pas tant que ça d'acides aminés utilisé pour la synthèse de protéine. je ne comprends pas trèsx bien cette phrase.  [...]

[Biochimie] reaction d'edman

De souvenir, c'est toujours l'acide aminé Nterm qui est fixé car lui seul contient un groupement amine libre (NH2-) réactif dans ces conditions.  [...] Le PhynylThioHydantoine-aminoacide est injecté dans une colonne chromatographique. (affinité en phase inverse ou autre.).le temps de rétention est déterminé et ceci permet de caractériser le PTH-AA en sortie de colonne.  [...]

[Biochimie] calcul du pHi (aspartate)

Il faut que cet acide aminé ait un groupement carboxyle protoné pour que sa charge globale soit nulle, donc le pHi de l'acide aspartique est (2+3.9)/2.  [...] Pour se mettre les idées au clair je vous conseille de dessiner une échelle de pH de ce genre. http.//www.takween.com/tyrosine-ionisation.gif et de représenter la forme majoritaire de la molécule pour chaque plage de pH (inférieur à pKa1, entre pKa1 et pKa2& ) (Vous pouvez vous contenter de représenter l'état des fonctions ionisables.).  [...]

[Biochimie] Structure acides aminés

voilà j'ai un ptit probleme de biologie en fait j'ai une prof (terrible) et je n'ai rien compris à un passage de la leçon qui concerne la structure des acides aminés... en fait après avoir relu des articles sur internet j'ai un peu mieux compris mais il me reste juste un petit détail a comprendre.  [...] Voilà alors ( c'est la formule générale) le truc c'est que j'ai compris que en rouge c'est la fonction amine ( NH2) et en bleu la fonction acide (COOH) ou groupement carboxyle. De plus R dans cette formule est le radical mé ce que je ne comprend pas c'est pourquoi il y a un C et un H en plein milieu de la molécule.  [...]