• Forum - Formation, Liaison, ADN

Questions de génétique

2) Dans le cas d'un caractère d'expression récessive, il est toujours plus informatif d'analyser le croisement femelle mutée par un mâle sauvage que le croisement réciproque.  [...] 6) Les croisement de souches pures portant des allèles différents de 2 gènes donneront selon la localisation des 2 gènes des pourcentages d'associations parentales varient.   [...]

[Biochimie] la replication

Les dNMPs sont des desoxynucléotides monophosphate. En effet, dans une séquence d'ADN les nucléotides n'ont qu'un phosphate (dNMPs) permettant de faire la liaison phosphodiester avec l'OH du nucléotide suivant.  [...] Autrement dit, la poly III utilise l'énergie de liaison des 2 P surnuméraires pour effectuer la liaison des dNMP sur le brin d'ADN en formation.  [...]

[Biologie Cellulaire] réplication de l'adn

le nucléoside est constitué d'une base d'un sucre et d'un phosphate. lorsqu'il veut s'ajouter au brin de réplication il est composer de 3 phosphates. pourquoi.   [...] La rupture de la liaison libérant le PPi(pyrophosphate inorganique) fourni l'énergie nécessaire à la formation de la liaison ADN-nouveau nucléotide, c'est-à-dire à la formation d'un pont phosphodiester.  [...]

[Génétique] ADN polymérase

ma question est surement très bête mais j'arrive vraiment pas à comprendre. dans un QCM on me demande quelle ADN polymérase est indispensable à la réplication de l'ADN, je pensais (très sure de moi) que c'était l'ADN pol 3, mais non... la réponse est ADN pol 1 Pourtant c'est bien la 3 qui sert pour l'élongation de l'ADN du brin avancé et qui permet la formation des fragment d'Okazaki non.  [...] La ligase vient achever le travail en catalysant la formation d'une liaison phosphodiester entre une extrémité 3'OH d'un fragment d'ADN et une extrémité5' phosphate d'un autre fragment.  [...]

[Biologie Moléculaire] Transcrit Primaire (ARN pré-message)

J'aurais voulu savoir si l'extrémité 5' qui est une adénine la plus part du temps possède un groupement triphosphate naturellement Et pourquoi elle possède une extrémité triphosphate a quoi sa lui sert Il me semble que toute addition de nucléotide ce fait par l'extrémité 3'OH libre car apparement pas de phosphate accroché donc pas de liaison phosphodiester...Merci pour vos futures réponses.  [...] Au cours de la synthèse d'ADN, les dNTP suivants pris en charge par l'ADN pol perdent deux phosphates pour l'accrocher à la base précédente (formation de la liaison phosphodiester).  [...]

synthèse d'une amorce

Dans le cas des amorces d'ADN, je sais pas exactement comment ils font mais ils doivent utiliser des dNMP et pas des dNTP...Par contre ils doivent protéger le groupement phosphate. Après s'il faut ils favorisent l'électrophilie du phosphate et la nucléophilie du CH2OH du ribose, et la on a formation d'une liaison phosphodiester.  [...] D'accord, la protection...j'en ai entendu parler au cours de préparation aux OIC quand on veut obtenir tel ou tel dérivé d'acide. On limite la réactivité de certaines régions. Mais pour l'ADN ya qu'une région qui nous interesse, c'est le groupement hydroxyde du carbone 3' du desoxyribose, non On peut empecher tel ou tel nucléotide de se lier Mais ça veut dire que pour chaque nouveau nucléotide, il faut changer les conditions.  [...]

[Biologie Cellulaire] Reverse transcription et amorçage avec hexamères aléatoires ?

La concentration en amorces aléatoires conditionne la taille des fragments d'ADNc synthétisés. En effet, la longueur moyenne des brins synthétisés est inversement proportionnelle à la concentration en amorces. La concentration d'amorces aléatoires doit donc être déterminée en fonction de la taille du fragment à amplifier.   [...] La spécificité de cette enzyme vien du fait qu'elle reconnait sur l'ARN un ribonucléoside, et qu'elle peut catalyser (du fait de sa structure spatial ou, d'un point de vu énergétique, du fait des énergies d'activations qu'elle peut décomposer) la formation d'une liaison phosphodieter entre un dXTP et le fragement d'ADN en cours de synthèse.  [...]

[Biochimie] Question théorique sur clonage TOPO

Le plasmide pCR4 Blunt-TOPO vector (Figure11) nous est fourni sous forme linéaire, il possède en 3' une topoisomérase I du virus Vaccinia. Cette topoisomérase a la capacité de se fixer à des sites spécifiques de l'ADN et de cliver celui-ci au niveau des liaisons phosphodiesters, après le motif 5'-CCCTT.  [...] L'énergie libérée lors de cette réaction permet la formation d'une liaison covalente entre l'extrémité 3' du brin coupé et le résidu tyrosyl-274 de l'enzyme. Cette liaison est ensuite attaquée par l'extrémité 5' hydroxyl du brin d'ADN à insérer dans le vecteur, ce qui a pour résultats de libérer la topoisomérase I et de lier l'insert au vecteur (Figure12).  [...]

[Biochimie] Enzymologie : processus associatif / synchrone / dissociatif

- processus associatif = formation de la liaison avec le nucléophile se fait en même temps que la liaison se rompt avec le groupe partant.  [...] Synchrone signifie qu'il y a formation d'une liaison et rupture d'une autre en même temps (mécanisme concerté). Cela correspond à un processus associatif, et c'est le cas des SN2.  [...]

[Biologie Moléculaire] solution de liaison

mettre une solution de liaison, puis chauffer-. le gel se dissous. puis j'ajoute de la silice, puis après chauffage et centrifugation, on obtient le complexe adn/silice sous forme de précipité qu'on lave par après-. on obtient alors complexe adn/silice pur puis après élution on obtient précipité de silice qu'on jette + adn pur dans surnageant, voilou voilà, comme ça j'ai vraiment tout dis.  [...] en fait, je ne sais pas si c'est pour favoriser la liaison adn-silice ou pour faciliter la dissolution de l'agarose quand on chauffe.  [...]